RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430766.1

PTPRD-AS1-201, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRD-AS1, Length 1,959 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CFAP58Q5T655 872 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KIF18BQ86Y91 864 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 AOPEPQ8N6M6 819 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HSFY1Q96LI6 401 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NCAPGQ9BPX3 1015 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HES7Q9BYE0 225 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MIS12Q9H081 205 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KLHL25Q9H0H3 589 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RETREG1Q9H6L5 497 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 WDR54Q9H977 334 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MPP6Q9NZW5 540 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NOTCH3Q9UM47 2321 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EML6Q6ZMW3 1958 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LINC01387J3KSC0 135 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 WFS1O76024 890 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 UQCRHP07919 91 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HOXD13P35453 343 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ADH7P40394 386 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SORDQ00796 357 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ETFDHQ16134 617 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TRIM74Q86UV6 250 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 AMER3Q8N944 861 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TMEM178AQ8NBL3 297 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FKBP10Q96AY3 582 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SPSB2Q99619 263 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF747Q9BV97 191 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IMPG2Q9BZV3 1241 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SIK2Q9H0K1 926 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FAM204AQ9H8W3 233 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KLHL1Q9NR64 748 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 VPS18Q9P253 973 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SIK3Q9Y2K2 1263 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GOLGA6CA6NDK9 693 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GOLGA6BA6NDN3 693 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TMCC1O94876 653 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GOLGA6DP0CG33 693 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ACVRL1P37023 503 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GPR1P46091 355 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CASP9P55211 416 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DPTQ07507 201 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TRIM72Q6ZMU5 477 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 COX14Q96I36 57 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 UBTD1Q9HAC8 227 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PLCB1Q9NQ66 1216 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLC22A11Q9NSA0 550 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CISHQ9NSE2 258 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 OR5K3A6NET4 321 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.11
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GPRIN2O60269 458 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TMCC2O75069 709 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ACVR2AP27037 513 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PREPP48147 710 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 APBA1Q02410 837 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.11
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DACH2Q96NX9 599 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ATG10Q9H0Y0 220 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 POPDC2Q9HBU9 364 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DDIT4Q9NX09 232 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.11
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF407Q9C0G0 2248 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MAPK13O15264 365 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ALBP02768 609 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ATXN8OSP0DMR3 200 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TFEBP19484 476 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RHOAP61586 193 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CNGA3Q16281 694 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ARTNQ5T4W7 220 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IL17RELQ6ZVW7 336 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FAXDC2Q96IV6 333 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 AK8Q96MA6 479 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 OLFM1Q99784 485 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FN3KRPQ9HA64 309 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZFATQ9P243 1243 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FAM215AQ9Y5M1 114 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MAP2K7O14733 419 aa8.13□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms