RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348333.7

TNFRSF25-201, Transcript of TNF receptor superfamily member 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFRSF25, Length 1,119 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25-201ENST00000348333 SLC35G4P0C7Q5 338 aa22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 ITGB6P18564 788 aa22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 F8A1P23610 371 aa22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 HADHAP40939 763 aa22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 NFKB2Q00653 900 aa22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 NFATC3Q12968 1075 aa22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 OASLQ15646 514 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 CCDC38Q502W7 563 aa22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 SERPINA9Q86WD7 417 aa22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 TXLNBQ8N3L3 684 aa22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 OR52K1Q8NGK4 314 aa22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 C1orf54Q8WWF1 131 aa22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 ULK4Q96C45 1275 aa22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 PPM1MQ96MI6 270 aa22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 SLC24A2Q9UI40 661 aa22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 B8ZZF3 427 aa22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 PRKAR1AP10644 381 aa22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 ETS1P14921 441 aa22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 FOLR1P15328 257 aa22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 NELFEP18615 380 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 ACRV1P26436 265 aa22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 STAT5AP42229 794 aa22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 GRIA1P42261 906 aa22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 P3H1Q32P28 736 aa22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 CLDN19Q8N6F1 224 aa22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 GLIS1Q8NBF1 620 aa22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 GALNT6Q8NCL4 622 aa22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 HM13Q8TCT9 377 aa22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 SLC45A3Q96JT2 553 aa22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 SEMA5BQ9P283 1151 aa22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 ACSL5Q9ULC5 683 aa22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 OR5K3A6NET4 321 aa22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 H7C0S8 307 aa22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 KIAA0754O94854 1291 aa22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 ABHD18Q0P651 414 aa22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 SNX1Q13596 522 aa22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 DBN1Q16643 649 aa22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 SLC41A2Q96JW4 573 aa22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 C19orf43Q9BQ61 176 aa22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 COG4Q9H9E3 785 aa22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 ETNK1Q9HBU6 452 aa22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 PRSS21Q9Y6M0 314 aa22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 BSNQ9UPA5 3926 aa22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 OR6C74A6NCV1 312 aa22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 MROH6A6NGR9 719 aa22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 EBLN1P0CF75 366 aa22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 RALBP11234 206 aa22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 FGF5P12034 268 aa22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 OAS2P29728 719 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 PDHA2P29803 388 aa22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 PREPP48147 710 aa22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 GPR33Q49SQ1 333 aa22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 SEL1L2Q5TEA6 688 aa22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 TAS2R42Q7RTR8 314 aa22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 RASGRP3Q8IV61 690 aa22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 LRRC45Q96CN5 670 aa22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 OR52A5Q9H2C5 316 aa22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 HRASLS2Q9NWW9 162 aa22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 SPTBP11277 2137 aa22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 CFAP99D6REC4 459 aa22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 SPAG6O75602 509 aa22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 IFNB1P01574 187 aa22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 CDC20Q12834 499 aa22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 IL11RAQ14626 422 aa22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 GSE1Q14687 1217 aa22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 ESX1Q8N693 406 aa22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 STYXQ8WUJ0 223 aa22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 STARD8Q92502 1023 aa22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 CCDC162PA2VCL2 907 aa22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 PSMA3P25788 255 aa22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 CACNG1Q06432 222 aa22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 TUBB3Q13509 450 aa22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 MAP7Q14244 749 aa22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 MEI1Q5TIA1 1274 aa22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF25-201ENST00000348333 BORAQ6PGQ7 559 aa22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms