RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343131.6

SYCE1-202, Transcript of synaptonemal complex central element protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYCE1, Length 1,113 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE1-202ENST00000343131 XIAPP98170 497 aa15.47■□□□□ 0.07
SYCE1-202ENST00000343131 DNASE1L3Q13609 305 aa15.47■□□□□ 0.07
SYCE1-202ENST00000343131 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP15.47■□□□□ 0.07
SYCE1-202ENST00000343131 KLHL35Q6PF15 583 aa15.47■□□□□ 0.07
SYCE1-202ENST00000343131 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa15.47■□□□□ 0.07
SYCE1-202ENST00000343131 RANBP10Q6VN20 620 aa15.47■□□□□ 0.07
SYCE1-202ENST00000343131 ACRBPQ8NEB7 543 aa15.47■□□□□ 0.07
SYCE1-202ENST00000343131 OR2L2Q8NH16 312 aa15.47■□□□□ 0.07
SYCE1-202ENST00000343131 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
SYCE1-202ENST00000343131 SPATA13Q96N96 652 aa15.47■□□□□ 0.07
SYCE1-202ENST00000343131 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
SYCE1-202ENST00000343131 CRLS1Q9UJA2 301 aa15.47■□□□□ 0.07
SYCE1-202ENST00000343131 RARRES3Q9UL19 164 aa15.47■□□□□ 0.07
SYCE1-202ENST00000343131 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa15.47■□□□□ 0.07
SYCE1-202ENST00000343131 KCNMB2Q9Y691 235 aa15.47■□□□□ 0.07
SYCE1-202ENST00000343131 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
SYCE1-202ENST00000343131 FER1L5A0AVI2 2057 aa15.47■□□□□ 0.07
SYCE1-202ENST00000343131 OR6C74A6NCV1 312 aa15.46■□□□□ 0.07
SYCE1-202ENST00000343131 K7EM74 188 aa15.46■□□□□ 0.07
SYCE1-202ENST00000343131 STK10O94804 968 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
SYCE1-202ENST00000343131 POLBP06746 335 aa15.46■□□□□ 0.07
SYCE1-202ENST00000343131 PRSS56P0CW18 603 aa15.46■□□□□ 0.07
SYCE1-202ENST00000343131 PTPN7P35236 360 aa15.46■□□□□ 0.07
SYCE1-202ENST00000343131 ARL4DP49703 201 aa15.46■□□□□ 0.07
SYCE1-202ENST00000343131 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
SYCE1-202ENST00000343131 RPS18P62269 152 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
SYCE1-202ENST00000343131 GPR19Q15760 415 aa15.46■□□□□ 0.07
SYCE1-202ENST00000343131 BCL7AQ4VC05 210 aa15.46■□□□□ 0.07
SYCE1-202ENST00000343131 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
SYCE1-202ENST00000343131 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
SYCE1-202ENST00000343131 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
SYCE1-202ENST00000343131 OOSP2Q86WS3 158 aa15.46■□□□□ 0.07
SYCE1-202ENST00000343131 NXPE1Q8N323 547 aa15.46■□□□□ 0.07
SYCE1-202ENST00000343131 NRTNQ99748 197 aa15.46■□□□□ 0.07
SYCE1-202ENST00000343131 TBL1YQ9BQ87 522 aa15.46■□□□□ 0.07
SYCE1-202ENST00000343131 TWSG1Q9GZX9 223 aa15.46■□□□□ 0.07
SYCE1-202ENST00000343131 LACRTQ9GZZ8 138 aa15.46■□□□□ 0.07
SYCE1-202ENST00000343131 ACTL8Q9H568 366 aa15.46■□□□□ 0.07
SYCE1-202ENST00000343131 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa15.46■□□□□ 0.07
SYCE1-202ENST00000343131 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
SYCE1-202ENST00000343131 PDE7BQ9NP56 450 aa15.46■□□□□ 0.07
SYCE1-202ENST00000343131 LHX9Q9NQ69 397 aa15.46■□□□□ 0.07
SYCE1-202ENST00000343131 FGF21Q9NSA1 209 aa15.46■□□□□ 0.07
SYCE1-202ENST00000343131 HRASLS2Q9NWW9 162 aa15.46■□□□□ 0.07
SYCE1-202ENST00000343131 SEMA5BQ9P283 1151 aa15.46■□□□□ 0.07
SYCE1-202ENST00000343131 SLC24A2Q9UI40 661 aa15.46■□□□□ 0.07
SYCE1-202ENST00000343131 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
SYCE1-202ENST00000343131 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
SYCE1-202ENST00000343131 NAV2Q8IVL1 2488 aa15.45■□□□□ 0.06
SYCE1-202ENST00000343131 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
SYCE1-202ENST00000343131 GRID2IPA4D2P6 1211 aa15.45■□□□□ 0.06
SYCE1-202ENST00000343131 C5orf60A6NFR6 353 aa15.45■□□□□ 0.06
SYCE1-202ENST00000343131 NTRK1P04629 796 aa15.45■□□□□ 0.06
SYCE1-202ENST00000343131 PYGMP11217 842 aa15.45■□□□□ 0.06
SYCE1-202ENST00000343131 CASRP41180 1078 aa15.45■□□□□ 0.06
SYCE1-202ENST00000343131 PRLHRP49683 370 aa15.45■□□□□ 0.06
SYCE1-202ENST00000343131 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
SYCE1-202ENST00000343131 ZNF75DP51815 510 aa15.45■□□□□ 0.06
SYCE1-202ENST00000343131 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
SYCE1-202ENST00000343131 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
SYCE1-202ENST00000343131 SEPT6Q14141 434 aa15.45■□□□□ 0.06
SYCE1-202ENST00000343131 PRPSAP1Q14558 356 aa15.45■□□□□ 0.06
SYCE1-202ENST00000343131 DENND5AQ6IQ26 1287 aa15.45■□□□□ 0.06
SYCE1-202ENST00000343131 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
SYCE1-202ENST00000343131 RAD9BQ6WBX8 426 aa15.45■□□□□ 0.06
SYCE1-202ENST00000343131 HM13Q8TCT9 377 aa15.45■□□□□ 0.06
SYCE1-202ENST00000343131 DCUN1D1Q96GG9 259 aa15.45■□□□□ 0.06
SYCE1-202ENST00000343131 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
SYCE1-202ENST00000343131 PANX2Q96RD6 677 aa15.45■□□□□ 0.06
SYCE1-202ENST00000343131 FERMT1Q9BQL6 677 aa15.45■□□□□ 0.06
SYCE1-202ENST00000343131 TLR10Q9BXR5 811 aa15.45■□□□□ 0.06
SYCE1-202ENST00000343131 SOHLH2Q9NX45 425 aa15.45■□□□□ 0.06
SYCE1-202ENST00000343131 POLHQ9Y253 713 aa15.45■□□□□ 0.06
SYCE1-202ENST00000343131 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
SYCE1-202ENST00000343131 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa15.45■□□□□ 0.06
SYCE1-202ENST00000343131 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
SYCE1-202ENST00000343131 PIPSLA2A3N6 862 aa15.44■□□□□ 0.06
SYCE1-202ENST00000343131 CCDC66A2RUB6 948 aa15.44■□□□□ 0.06
SYCE1-202ENST00000343131 DNAJB5O75953 348 aa15.44■□□□□ 0.06
SYCE1-202ENST00000343131 CRTAMO95727 393 aa15.44■□□□□ 0.06
SYCE1-202ENST00000343131 CCNYL3P0C7X3 344 aa15.44■□□□□ 0.06
SYCE1-202ENST00000343131 ITGALP20701 1170 aa15.44■□□□□ 0.06
SYCE1-202ENST00000343131 MC4RP32245 332 aa15.44■□□□□ 0.06
SYCE1-202ENST00000343131 RWDD2BP57060 319 aa15.44■□□□□ 0.06
SYCE1-202ENST00000343131 HSD11B2P80365 405 aa15.44■□□□□ 0.06
SYCE1-202ENST00000343131 GSE1Q14687 1217 aa15.44■□□□□ 0.06
SYCE1-202ENST00000343131 IGFBP7Q16270 282 aa15.44■□□□□ 0.06
SYCE1-202ENST00000343131 CYB5D1Q6P9G0 228 aa15.44■□□□□ 0.06
SYCE1-202ENST00000343131 CFAP206Q8IYR0 622 aa15.44■□□□□ 0.06
SYCE1-202ENST00000343131 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
SYCE1-202ENST00000343131 LRRC57Q8N9N7 239 aa15.44■□□□□ 0.06
SYCE1-202ENST00000343131 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
SYCE1-202ENST00000343131 CD180Q99467 661 aa15.44■□□□□ 0.06
SYCE1-202ENST00000343131 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
SYCE1-202ENST00000343131 KCND3Q9UK17 655 aa15.44■□□□□ 0.06
SYCE1-202ENST00000343131 ACSL5Q9ULC5 683 aa15.44■□□□□ 0.06
SYCE1-202ENST00000343131 PADI1Q9ULC6 663 aa15.44■□□□□ 0.06
SYCE1-202ENST00000343131 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
SYCE1-202ENST00000343131 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa15.44■□□□□ 0.06
SYCE1-202ENST00000343131 EFR3BQ9Y2G0 817 aa15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms