RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000338045.7

LIMS1-202, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LIMS1, Length 1,876 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-202ENST00000338045 TRPC5OSA6NMA1 111 aa15.18■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 PPP6CO00743 305 aa15.18■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 PCDH8O95206 1070 aa15.18■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 JUNP05412 331 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 C8GP07360 202 aa15.18■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 VCLP18206 1134 aa15.18■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 TSPAN8P19075 237 aa15.18■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 INHBCP55103 352 aa15.18■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 PNCKQ6P2M8 343 aa15.18■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 TMEM220Q6QAJ8 160 aa15.18■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 ASB11Q8WXH4 323 aa15.18■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 HLA-CQ95604 372 aa15.18■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 OR52B2Q96RD2 323 aa15.18■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 CCM2Q9BSQ5 444 aa15.18■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 CCDC28BQ9BUN5 200 aa15.18■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 CCDC106Q9BWC9 280 aa15.18■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 SLC12A9Q9BXP2 914 aa15.18■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 TCF7L2Q9NQB0 619 aa15.18■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 TXLNGQ9NUQ3 528 aa15.18■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 ASB1Q9Y576 335 aa15.18■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 MYO10Q9HD67 2058 aa15.17■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 SLC5A10A0PJK1 596 aa15.17■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 TMEM202A6NGA9 273 aa15.17■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 GFYI3L273 518 aa15.17■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 SLC16A5O15375 505 aa15.17■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 MLYCDO95822 493 aa15.17■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 DNTTP04053 509 aa15.17■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 SRFP11831 508 aa15.17■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 TEAD1P28347 426 aa15.17■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 CDKL1Q00532 357 aa15.17■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 SP140Q13342 867 aa15.17■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 WSCD2Q2TBF2 565 aa15.17■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 UGT3A2Q3SY77 523 aa15.17■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 LEXMQ3ZCV2 418 aa15.17■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 FBXO48Q5FWF7 155 aa15.17■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 SULT1C3Q6IMI6 304 aa15.17■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 TRIM74Q86UV6 250 aa15.17■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 CLYBLQ8N0X4 340 aa15.17■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 PLA2G15Q8NCC3 412 aa15.17■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 TRPC4APQ8TEL6 797 aa15.17■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 AGAP11Q8TF27 550 aa15.17■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 UBTD2Q8WUN7 234 aa15.17■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 FAM3CQ92520 227 aa15.17■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 GLMNQ92990 594 aa15.17■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 RHBDF1Q96CC6 855 aa15.17■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 HIC2Q96JB3 615 aa15.17■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 TUBB6Q9BUF5 446 aa15.17■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 ARMCX1Q9P291 453 aa15.17■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 GULP1Q9UBP9 304 aa15.17■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 SDHDO14521 159 aa15.16■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 TAPBPO15533 448 aa15.16■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 VEGFDO43915 354 aa15.16■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 CBX6O95503 412 aa15.16■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 S100BP04271 92 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 TARSP26639 723 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 BTKQ06187 659 aa15.16■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 TDGQ13569 410 aa15.16■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 TBCCQ15814 346 aa15.16■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 TMEM259Q4ZIN3 620 aa15.16■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 SLC44A4Q53GD3 710 aa15.16■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 ASRGL1Q7L266 308 aa15.16■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 RNF217Q8TC41 542 aa15.16■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 ESAMQ96AP7 390 aa15.16■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa15.16■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 SLC6A17Q9H1V8 727 aa15.16■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 OR2AG1Q9H205 316 aa15.16■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 MEAF6Q9HAF1 191 aa15.16■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 MID1IP1Q9NPA3 183 aa15.16■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 ARL8BQ9NVJ2 186 aa15.16■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 ATXN10Q9UBB4 475 aa15.16■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 FZD4Q9ULV1 537 aa15.16■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 PDE10AQ9Y233 779 aa15.16■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 TRPM6Q9BX84 2022 aa15.16■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 MATN4O95460 622 aa15.16■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 GSTM1P09488 218 aa15.16■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 AOC1P19801 751 aa15.16■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 EPHA3P29320 983 aa15.16■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 ADPRHP54922 357 aa15.16■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 RPS21P63220 83 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 GSTM4Q03013 218 aa15.16■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 FGL2Q14314 439 aa15.16■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 EOGTQ5NDL2 527 aa15.16■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 KANK2Q63ZY3 851 aa15.16■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa15.16■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 ACAD11Q709F0 780 aa15.16■□□□□ 0.02
LIMS1-202ENST00000338045 USP30Q70CQ3 517 aa15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms