RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622107.4

LTBP4-237, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene LTBP4, Length 590 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4-237ENST00000622107 ITIH4Q14624 930 aa14.65□□□□□ -0.06
LTBP4-237ENST00000622107 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
LTBP4-237ENST00000622107 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
LTBP4-237ENST00000622107 ARMC3Q5W041 872 aa14.65□□□□□ -0.06
LTBP4-237ENST00000622107 TTC27Q6P3X3 843 aa14.65□□□□□ -0.06
LTBP4-237ENST00000622107 CASC4Q6P4E1 433 aa14.65□□□□□ -0.06
LTBP4-237ENST00000622107 CERS6Q6ZMG9 384 aa14.65□□□□□ -0.06
LTBP4-237ENST00000622107 USP53Q70EK8 1073 aa14.65□□□□□ -0.06
LTBP4-237ENST00000622107 SERPINA9Q86WD7 417 aa14.65□□□□□ -0.06
LTBP4-237ENST00000622107 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
LTBP4-237ENST00000622107 OTUD6BQ8N6M0 293 aa14.65□□□□□ -0.06
LTBP4-237ENST00000622107 EPB41L1Q9H4G0 881 aa14.65□□□□□ -0.06
LTBP4-237ENST00000622107 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
LTBP4-237ENST00000622107 PRDM8Q9NQV8 689 aa14.65□□□□□ -0.06
LTBP4-237ENST00000622107 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa14.65□□□□□ -0.06
LTBP4-237ENST00000622107 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
LTBP4-237ENST00000622107 CPNE7Q9UBL6 633 aa14.65□□□□□ -0.06
LTBP4-237ENST00000622107 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa14.65□□□□□ -0.06
LTBP4-237ENST00000622107 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa14.65□□□□□ -0.06
LTBP4-237ENST00000622107 UNC13CQ8NB66 2214 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 A6NCN8 305 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 MGAT4DA6NG13 374 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 AGAP14A8MT82 685 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 AGRPO00253 132 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 HGSO14964 777 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 GSTM1P09488 218 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 SLC35G4P0C7Q5 338 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 ITIH1P19827 911 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 RPL10P27635 214 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 SLC5A2P31639 672 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 CSF2RBP32927 897 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 GRIA1P42261 906 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 NSG1P42857 185 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 MAPK9P45984 424 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 GSTM4Q03013 218 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 DMPKQ09013 629 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 CLN3Q13286 438 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 KRT33BQ14525 404 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 C16orf72Q14CZ0 275 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 BCL7AQ4VC05 210 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 AGAP9Q5VTM2 703 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 NKAIN2Q5VXU1 208 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 WASH2PQ6VEQ5 465 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 ZNF547Q8IVP9 402 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 OR4D9Q8NGE8 314 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 OR4L1Q8NH43 312 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 HDAC10Q969S8 669 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 SGF29Q96ES7 293 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 CCDC74BQ96LY2 380 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 WASH6PQ9NQA3 447 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 KCND1Q9NSA2 647 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 POT1Q9NUX5 634 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 ACSL6Q9UKU0 697 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 ACSL5Q9ULC5 683 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 CCDC162PA2VCL2 907 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 NDC80O14777 642 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 NVLO15381 856 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 AP2A2O94973 939 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 GOT2P00505 430 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 FTH1P02794 183 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 OR56A5P0C7T3 313 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 PRLHRP49683 370 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 CTSCP53634 463 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 LIMK2P53671 638 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 MAPK10P53779 464 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 EPHA4P54764 986 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 SQSTM1Q13501 440 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 KCNJ11Q14654 390 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 KLHL7Q8IXQ5 586 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 PPIL6Q8IXY8 311 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 RCBTB1Q8NDN9 531 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 OR2L2Q8NH16 312 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 HM13Q8TCT9 377 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 CCM2Q9BSQ5 444 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 CPNE5Q9HCH3 593 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 CATSPERZQ9NTU4 200 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 FAM8A1Q9UBU6 413 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 SLC23A2Q9UGH3 650 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 ATMQ13315 3056 aa14.62□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa14.62□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa14.62□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa14.62□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 MAGEB16A2A368 324 aa14.62□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
LTBP4-237ENST00000622107 PRAMEF10O60809 474 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms