RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 STK19P49842 368 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HMGCS1Q01581 520 aa11.62□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TLE2Q04725 743 aa11.62□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BCL2L1Q07817 233 aa11.62□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SELPLGQ14242 412 aa11.62□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PTGR1Q14914 329 aa11.62□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AP5B1Q2VPB7 878 aa11.62□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP11.62□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DGKKQ5KSL6 1271 aa11.62□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TPGS2Q68CL5 300 aa11.62□□□□□ -0.55
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRT80Q6KB66 452 aa11.62□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GAREM2Q75VX8 874 aa11.62□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CARM1Q86X55 608 aa11.62□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HS6ST3Q8IZP7 471 aa11.62□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM47BQ8NA70 645 aa11.62□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP11.62□□□□□ -0.55
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OLAHQ9NV23 265 aa11.62□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa11.61□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AQP12BA6NM10 295 aa11.61□□□□□ -0.55
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 INPP5AQ14642 412 aa11.61□□□□□ -0.55
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CEP295NLQ96MC4 621 aa11.61□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RIC8BQ9NVN3 520 aa11.61□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NUDT4Q9NZJ9 180 aa11.61□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa11.61□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRT87PA6NCN2 255 aa11.61□□□□□ -0.55
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TEX28O15482 410 aa11.61□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CD9P21926 228 aa11.61□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DEFB103AP81534 67 aa11.61□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LMAN2Q12907 356 aa11.61□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BNIP2Q12982 314 aa11.61□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRAF3Q13114 568 aa11.61□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PRKG2Q13237 762 aa11.61□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PYCR3Q53H96 274 aa11.61□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CYP20A1Q6UW02 462 aa11.61□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 Q6ZNB5 142 aa11.61□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa11.61□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MYLIPQ8WY64 445 aa11.61□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NCSTNQ92542 709 aa11.61□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRIM54Q9BYV2 358 aa11.61□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZFP14Q9HCL3 533 aa11.61□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LATS2Q9NRM7 1088 aa11.61□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SMOXQ9NWM0 555 aa11.61□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CFAP97Q9P2B7 532 aa11.61□□□□□ -0.55
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa11.61□□□□□ -0.55
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