RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567234.1

LINC00543-201, long intergenic non-protein coding RNA 543, humanhuman

BASIC

Gene LINC00543, Length 1,845 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00543-201ENST00000567234 KLHL42Q9P2K6 505 aa22.94■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa22.94■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 SLC8A2Q9UPR5 921 aa22.94■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 IQCF5A8MTL0 148 aa22.94■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 UBDO15205 165 aa22.94■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 SNX2O60749 519 aa22.94■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 TSPAN8P19075 237 aa22.94■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 UGT1A6P19224 532 aa22.94■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 UGT1A1P22309 533 aa22.94■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 UGT1A4P22310 534 aa22.94■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 UGT1A3P35503 534 aa22.94■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 UGT1A5P35504 534 aa22.94■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 ATP4BP51164 291 aa22.94■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 DHCR24Q15392 516 aa22.94■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 CLEC6AQ6EIG7 209 aa22.94■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 C16orf89Q6UX73 402 aa22.94■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 CHRDL2Q6WN34 429 aa22.94■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 CYHR1Q6ZMK1 362 aa22.94■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 CHST14Q8NCH0 376 aa22.94■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa22.94■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 FRS2Q8WU20 508 aa22.94■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 ING5Q8WYH8 240 aa22.94■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 ULK4Q96C45 1275 aa22.94■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 MRGPRX3Q96LB0 322 aa22.94■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 BOCQ9BWV1 1114 aa22.94■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 REV3LO60673 3130 aa22.93■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 LRRC14BA6NHZ5 514 aa22.93■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 GPC4O75487 556 aa22.93■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 ZNF30P17039 623 aa22.93■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 DGKAP23743 735 aa22.93■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 NFKBIAP25963 317 aa22.93■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 CA5AP35218 305 aa22.93■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 NSG1P42857 185 aa22.93■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 ACADVLP49748 655 aa22.93■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 ZFP1Q6P2D0 407 aa22.93■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 SATL1Q86VE3 508 aa22.93■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 DEFB107AQ8IZN7 70 aa22.93■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 KYQ8NBH2 561 aa22.93■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 CLPTM1LQ96KA5 538 aa22.93■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa22.93■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 PCTPQ9UKL6 214 aa22.93■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa22.93■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 TSPAN11A1L157 253 aa22.92■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 LHCGRP22888 699 aa22.92■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 HK3P52790 923 aa22.92■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 MAPRE2Q15555 327 aa22.92■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 TGFBIQ15582 683 aa22.92■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 ITFG1Q8TB96 612 aa22.92■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 PBXIP1Q96AQ6 731 aa22.92■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 LRIG1Q96JA1 1093 aa22.92■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 KLHL32Q96NJ5 620 aa22.92■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 CD274Q9NZQ7 290 aa22.92■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 BLOC1S6Q9UL45 172 aa22.92■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 A8MX80 341 aa22.92■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 SPINT3P49223 89 aa22.92■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 AQP4P55087 323 aa22.92■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 FOLH1Q04609 750 aa22.92■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 CCNIQ14094 377 aa22.92■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 GEN1Q17RS7 908 aa22.92■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 ZNF554Q86TJ5 538 aa22.92■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 KBTBD6Q86V97 674 aa22.92■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 HCAR2Q8TDS4 363 aa22.92■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 OSCP1Q8WVF1 389 aa22.92■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 EFCAB1Q9HAE3 211 aa22.92■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 B4GALT6Q9UBX8 382 aa22.92■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 CDH22Q9UJ99 828 aa22.92■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 PSMD13Q9UNM6 376 aa22.92■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 PRSS21Q9Y6M0 314 aa22.92■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 SZT2Q5T011 3432 aa22.91■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 A0A0J9YVX5 310 aa22.91■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 VPS4BO75351 444 aa22.91■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 ADH1CP00326 375 aa22.91■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 CYP17A1P05093 508 aa22.91■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 TFAP2AP05549 437 aa22.91■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 CISD3P0C7P0 127 aa22.91■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 ADH5P11766 374 aa22.91■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 NR1H2P55055 460 aa22.91■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 GPRC6AQ5T6X5 926 aa22.91■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 MYO1HQ8N1T3 1032 aa22.91■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 NAT16Q8N8M0 369 aa22.91■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 OR56A4Q8NGH8 313 aa22.91■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 TWIST2Q8WVJ9 160 aa22.91■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 TIFAQ96CG3 184 aa22.91■■□□□ 1.26
LINC00543-201ENST00000567234 PKD2L2Q9NZM6 624 aa22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms