RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516122.1

RNU6-871P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 871, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-871P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-871P-201ENST00000516122 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 RCOR1Q9UKL0 485 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 TRHDEQ9UKU6 1024 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC39A10Q9ULF5 831 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 ERVK-11Q9UQG0 969 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 EPOPA6NHQ4 379 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 B4DXG7 233 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 H3BML4 177 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 TAF4O00268 1085 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 TNFSF11O14788 317 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 FRS3O43559 492 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 TSC22D2O75157 780 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 APBB3O95704 486 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 DCNP07585 359 aaKnown RBP-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 ODC1P11926 461 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 ANPEPP15144 967 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 GPX3P22352 226 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 EFNA3P52797 238 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 THOP1P52888 689 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 ERVPABLB-1P60509 514 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 PLA2G7Q13093 441 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 DUOXA1Q1HG43 343 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 TCTN1Q2MV58 587 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 GRAMD1BQ3KR37 738 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 RAB6CQ53S08 254 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF766Q5HY98 468 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 MAEAQ7L5Y9 396 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 HAUS6Q7Z4H7 955 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 NOXA1Q86UR1 476 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 BEST3Q8N1M1 668 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 SCCPDHQ8NBX0 429 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMEM116Q8NCL8 245 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 KBTBD8Q8NFY9 601 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR2L5Q8NG80 312 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 PPP1R35Q8TAP8 253 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 NSMAFQ92636 917 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 GRAMD2BQ96HH9 432 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 TWNKQ96RR1 684 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 OVOL2Q9BRP0 275 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 RAB6CQ9H0N0 254 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 PCDHAC1Q9H158 963 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 KLQ9UEF7 1012 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 BAHCC1Q9P281 2608 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 MTMR11A4FU01 709 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMEM150BA6NC51 233 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 KIF28PB7ZC32 967 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 F8W8V4 182 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 TFECO14948 347 aaPredicted RBP-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 NBNO60934 754 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 SERPINC1P01008 464 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 IL1AP01583 271 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 LIPFP07098 398 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 FASLGP48023 281 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 GPNMBQ14956 572 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 FBXO43Q4G163 708 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 LRRC8DQ7L1W4 858 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 HIPK1Q86Z02 1210 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR4N5Q8IXE1 308 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 STAG1Q8WVM7 1258 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 ITLN1Q8WWA0 313 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 KCNJ9Q92806 393 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 OTULINQ96BN8 352 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 TECTBQ96PL2 329 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCDC134Q9H6E4 229 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 PDE11AQ9HCR9 933 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 SUFUQ9UMX1 484 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 MOKQ9UQ07 419 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 DHDHQ9UQ10 334 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 RCE1Q9Y256 329 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF835Q9Y2P0 537 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 WIPI2Q9Y4P8 454 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 RFNGQ9Y644 331 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 SHANK1Q9Y566 2161 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 GTF3C1Q12789 2109 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMEM8BA6NDV4 472 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 CLCA1A8K7I4 914 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 OGTO15294 1046 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 GPR137BO60478 399 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 ADAP00813 363 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP-1.07□□□□□ -2.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms