RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-222	ENST00000512014	PPP1CA	P62136	330 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	MC2R	Q01718	297 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	SEMA5A	Q13591	1074 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCDC38	Q502W7	563 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	ANKS6	Q68DC2	871 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	SERPINA9	Q86WD7	417 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRIM48	Q8IWZ4	208 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPDYE1	Q8NFV5	336 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR13J1	Q8NGT2	312 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	STYX	Q8WUJ0	223 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	JPH3	Q8WXH2	748 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	TTC9	Q92623	222 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	ULK4	Q96C45	1275 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	C9orf72	Q96LT7	481 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	RMDN2	Q96LZ7	410 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCNL2	Q96S94	520 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	DDA1	Q9BW61	102 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	CASS4	Q9NQ75	786 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZDHHC3	Q9NYG2	299 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	AKAP7	Q9P0M2	348 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	KLHL3	Q9UH77	587 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	CRLS1	Q9UJA2	301 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	BOD1L1	Q8NFC6	3051 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCDC78	A2IDD5	438 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR51F1	A6NGY5	319 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	ATXN7	O15265	892 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	CAPN5	O15484	640 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	KIF1C	O43896	1103 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	C1QL1	O75973	258 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	IFNB1	P01574	187 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	ATP1B2	P14415	290 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	ITGAL	P20701	1170 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	FOXN2	P32314	431 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	RPL22	P35268	128 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	FDFT1	P37268	417 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	CAPZB	P47756	277 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	SEPT6	Q14141	434 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCNG2	Q16589	344 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	DBN1	Q16643	649 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	GPR33	Q49SQ1	333 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	VASH2	Q86V25	355 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM129C	Q86XR2	697 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	NKD1	Q969G9	470 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF778	Q96MU6	729 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	COPS8	Q99627	209 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	WWP1	Q9H0M0	922 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC39A1	Q9NY26	324 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	EPHA6	Q9UF33	1036 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC2A6	Q9UGQ3	507 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF148	Q9UQR1	794 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRSS21	Q9Y6M0	314 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	PIEZO2	Q9H5I5	2752 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCDC162P	A2VCL2	907 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	ERI2	A8K979	691 aa	Known RBP	12.42	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	FGG	P02679	453 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRB1	P04280	392 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	CXCR5	P32302	372 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	HAL	P42357	657 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	KCNJ1	P48048	391 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	ACVR1	Q04771	509 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	CDH17	Q12864	832 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZRANB3	Q5FWF4	1079 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRSS42	Q7Z5A4	293 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	LINC00523	Q86TU6	105 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	CLDN19	Q8N6F1	224 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRIM58	Q8NG06	486 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	HM13	Q8TCT9	377 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	TGM7	Q96PF1	710 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	ALS2CR12	Q96Q35	445 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	CTRC	Q99895	268 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	RAB33B	Q9H082	229 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZMYND15	Q9H091	742 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR52A5	Q9H2C5	316 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	FBXO8	Q9NRD0	319 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	RAB6B	Q9NRW1	208 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	EIF2AK3	Q9NZJ5	1116 aa	Known RBP	12.42	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM8A1	Q9UBU6	413 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	PILRA	Q9UKJ1	303 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	ACSL5	Q9ULC5	683 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	12.42	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	C17orf113	A0A1B0GUU1	675 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	KLHL33	A6NCF5	533 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	STMND1	H3BQB6	276 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	AMD1	P17707	334 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	MSN	P26038	577 aa	Known RBP	12.41	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	PDHA2	P29803	388 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	12.41	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	RAB15	P59190	212 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	SH3BP2	P78314	561 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SH3BP2-222	ENST00000512014	CACNG1	Q06432	222 aa		12.41	□□□□□ -0.42

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