RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 MARVELD3Q96A59 401 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 SGF29Q96ES7 293 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF285Q96NJ3 590 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 SERPINB12Q96P63 405 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 CSPG4P5Q96PW8 444 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 CITED4Q96RK1 184 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 NEU1Q99519 415 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 SH2D3AQ9BRG2 576 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 TRIM54Q9BYV2 358 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 SEPT3Q9UH03 358 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 NFU1Q9UMS0 254 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 PGPEP1LA6NFU8 196 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 OR6C70A6NIJ9 312 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 ERVH48-1M5A8F1 160 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 RFPL1O75677 317 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 RFPL2O75678 378 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 ERVK-10P10266 1014 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 MCF2P10911 925 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 ARL2P36404 184 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 DPP6P42658 865 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 MEOX2P50222 304 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 NR1H2P55055 460 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 ERVK-8P63133 956 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP4.52□□□□□ -1.692e-7■□□□□ 11.1
RABGGTB-213ENST00000496055 FADDQ13158 208 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 PTGDRQ13258 359 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 TUBB2AQ13885 445 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 TAF5Q15542 800 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 XKR4Q5GH76 650 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 PKN3Q6P5Z2 889 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 IQCKQ8N0W5 287 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 EID3Q8N140 333 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 CLIP4Q8N3C7 705 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 SNX29Q8TEQ0 813 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC20A1Q8WUM9 679 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 LENG9Q96B70 501 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 MYADMQ96S97 322 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 AGAP2Q99490 1192 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 TUBB2BQ9BVA1 445 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 LTB4R2Q9NPC1 389 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 ADPRHL2Q9NX46 363 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 ST14Q9Y5Y6 855 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 C12orf71A8MTZ7 269 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 WRBO00258 174 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 MATN3O15232 486 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 VPS4BO75351 444 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 SULT1C4O75897 302 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 DCNP07585 359 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 RARAP10276 462 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 RALAP11233 206 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 PAMP19021 973 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 PCSK6P29122 969 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 EIF1P41567 113 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 ACTR1BP42025 376 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 GRIA2P42262 883 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 RPL35P42766 123 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 RARRES1P49788 294 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 LIG4P49917 911 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 STARD6P59095 220 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 RAB4BP61018 213 aa4.52□□□□□ -1.69
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RABGGTB-213ENST00000496055 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF45Q02386 682 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 MBTD1Q05BQ5 628 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 CAPSQ13938 189 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 FLOT2Q14254 428 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC39A12Q504Y0 691 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 PKDCCQ504Y2 493 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 TTC38Q5R3I4 469 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 ANKRD40Q6AI12 368 aa4.52□□□□□ -1.69
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RABGGTB-213ENST00000496055 UNC5AQ6ZN44 842 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 GSTA5Q7RTV2 222 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 MCOLN2Q8IZK6 566 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM3CQ92520 227 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 BORCS5Q969J3 196 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 ELSPBP1Q96BH3 223 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC2A11Q9BYW1 496 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-213ENST00000496055 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
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