RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496024.1

CALD1-223, Transcript of caldesmon 1, human

TSL 4

Gene CALD1, Length 557 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CALD1-223	ENST00000496024	MAGEA3	P43357	314 aa		9.63	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	FASLG	P48023	281 aa		9.63	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	PREP	P48147	710 aa		9.63	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	9.63	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	CKAP4	Q07065	602 aa	Known RBP	9.63	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	DMPK	Q09013	629 aa		9.63	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	MORF4L2	Q15014	288 aa		9.63	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	MSS51	Q4VC12	460 aa		9.63	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	9.63	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	9.63	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	CHCHD2P9	Q5T1J5	151 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		9.63	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	METRNL	Q641Q3	311 aa		9.63	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	9.63	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		9.63	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		9.63	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	B3GNT8	Q7Z7M8	397 aa		9.63	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	SPDYE1	Q8NFV5	336 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	HM13	Q8TCT9	377 aa		9.63	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	JPH3	Q8WXH2	748 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	ELMO1	Q92556	727 aa		9.63	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		9.63	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	9.63	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		9.63	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	VPS37B	Q9H9H4	285 aa		9.63	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	EPB41L5	Q9HCM4	733 aa		9.63	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	9.63	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	9.63	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	AK5	Q9Y6K8	562 aa		9.63	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	APC2	O95996	2303 aa		9.63	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	COL27A1	Q8IZC6	1860 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	FAM187A	A6NFU0	413 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	IQCF5	A8MTL0	148 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	ZW10	O43264	779 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	TCEA3	O75764	348 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	AP2A2	O94973	939 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	FTH1	P02794	183 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	TYRP1	P17643	537 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	XRCC1	P18887	633 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	MPST	P25325	297 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	CD1C	P29017	333 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	PDHA2	P29803	388 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	GPR3	P46089	330 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	TTPA	P49638	278 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	KRT33B	Q14525	404 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	RPE65	Q16518	533 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	ISX	Q2M1V0	245 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	SYTL3	Q4VX76	610 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	PHF19	Q5T6S3	580 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	PTRHD1	Q6GMV3	140 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	NEPRO	Q6NW34	567 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	ABRAXAS1	Q6UWZ7	409 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	UNQ6494/PRO21346	Q6UXR6	183 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	WASH2P	Q6VEQ5	465 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	PACS1	Q6VY07	963 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	TMPRSS9	Q7Z410	1059 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	PIM3	Q86V86	326 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	PDIK1L	Q8N165	341 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	KRT222	Q8N1A0	295 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	GPR150	Q8NGU9	434 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	OR10G6	Q8NH81	332 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	WDR48	Q8TAF3	677 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	NCSTN	Q92542	709 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	GATA6	Q92908	595 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	SH3KBP1	Q96B97	665 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	CFAP36	Q96G28	342 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	LINC00615	Q96LM1	132 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	RMDN2	Q96LZ7	410 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	C12orf66	Q96MD2	445 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	CNTNAP3B	Q96NU0	1288 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	INSM2	Q96T92	566 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	ERP44	Q9BS26	406 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	CNTNAP3	Q9BZ76	1288 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	COG4	Q9H9E3	785 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	C20orf96	Q9NUD7	363 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	ACSL5	Q9ULC5	683 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	CHMP2B	Q9UQN3	213 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	CRYL1	Q9Y2S2	319 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	ENTPD2	Q9Y5L3	495 aa		9.62	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024	ZCWPW2	A0A1B0GU75	182 aa		9.61	□□□□□ -0.87
CALD1-223	ENST00000496024		F8W8V4	182 aa		9.61	□□□□□ -0.87

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