RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472027.1

SYN3-211, Transcript of synapsin III, humanhuman

TSL 4

Gene SYN3, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN3-211ENST00000472027 WWP1Q9H0M0 922 aa8.97□□□□□ -0.97
SYN3-211ENST00000472027 BFARQ9NZS9 450 aa8.97□□□□□ -0.97
SYN3-211ENST00000472027 OGFRQ9NZT2 677 aa8.97□□□□□ -0.97
SYN3-211ENST00000472027 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
SYN3-211ENST00000472027 PDP2Q9P2J9 529 aa8.97□□□□□ -0.97
SYN3-211ENST00000472027 FAM8A1Q9UBU6 413 aa8.97□□□□□ -0.97
SYN3-211ENST00000472027 PISDQ9UG56 409 aa8.97□□□□□ -0.97
SYN3-211ENST00000472027 ACSL5Q9ULC5 683 aa8.97□□□□□ -0.97
SYN3-211ENST00000472027 NEU2Q9Y3R4 380 aa8.97□□□□□ -0.97
SYN3-211ENST00000472027 PRSS21Q9Y6M0 314 aa8.97□□□□□ -0.97
SYN3-211ENST00000472027 RP1P56715 2156 aa8.96□□□□□ -0.97
SYN3-211ENST00000472027 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa8.96□□□□□ -0.97
SYN3-211ENST00000472027 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa8.96□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 A8MU76 341 aa8.96□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 HGSO14964 777 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 ABCB7O75027 752 aa8.96□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 UBXN7O94888 489 aa8.96□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 AP2A2O94973 939 aa8.96□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 ITGA2BP08514 1039 aa8.96□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 THRAP10827 490 aa8.96□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 CCL4P13236 92 aa8.96□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 TYRP1P17643 537 aa8.96□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 ITPKBP27987 946 aa8.96□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 NMBRP28336 390 aa8.96□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 ETV5P41161 510 aa8.96□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 NSG1P42857 185 aa8.96□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 MAGEA6P43360 314 aa8.96□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 FNTAP49354 379 aa8.96□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 PRAMEP78395 509 aa8.96□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 SARNPP82979 210 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 CCDC173Q0VFZ6 552 aa8.96□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 GPR18Q14330 331 aa8.96□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 SNAP47Q5SQN1 464 aa8.96□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa8.96□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 ANKRD22Q5VYY1 191 aa8.96□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 CERS6Q6ZMG9 384 aa8.96□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa8.96□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 CLEC14AQ86T13 490 aa8.96□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 ZNF248Q8NDW4 579 aa8.96□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 HM13Q8TCT9 377 aa8.96□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 GRK7Q8WTQ7 553 aa8.96□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 CPT1BQ92523 772 aa8.96□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP8.96□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 SGSM3Q96HU1 749 aa8.96□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 C12orf66Q96MD2 445 aa8.96□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 TTC1Q99614 292 aa8.96□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 ZMYND15Q9H091 742 aa8.96□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 EPB41L1Q9H4G0 881 aa8.96□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 SYBUQ9NX95 663 aa8.96□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 ANAPC5Q9UJX4 755 aa8.96□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
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SYN3-211ENST00000472027 AVILO75366 819 aa8.95□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 GSTM1P09488 218 aa8.95□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 SLC35G4P0C7Q5 338 aa8.95□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 SLC5A2P31639 672 aa8.95□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP8.95□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 MAPK10P53779 464 aa8.95□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 GSTM4Q03013 218 aa8.95□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 SEMA3AQ14563 771 aa8.95□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 COL28A1Q2UY09 1125 aa8.95□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 CES3Q6UWW8 571 aa8.95□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 PACS1Q6VY07 963 aa8.95□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa8.95□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 JAMLQ86YT9 394 aa8.95□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 CREG2Q8IUH2 290 aa8.95□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 PLXDC1Q8IUK5 500 aa8.95□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 AGBL5Q8NDL9 886 aa8.95□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 MCUQ8NE86 351 aa8.95□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 GPR150Q8NGU9 434 aa8.95□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 ZFPM2Q8WW38 1151 aa8.95□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 USP7Q93009 1102 aa8.95□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 MFSD3Q96ES6 412 aa8.95□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 CAPZA3Q96KX2 299 aa8.95□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 KIFC1Q9BW19 673 aa8.95□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 COG4Q9H9E3 785 aa8.95□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 VPS37BQ9H9H4 285 aa8.95□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 TREX1Q9NSU2 369 aa8.95□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 OCIAD1Q9NX40 245 aa8.95□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 KLHL3Q9UH77 587 aa8.95□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 SOX13Q9UN79 622 aa8.95□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa8.95□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 SAR1BQ9Y6B6 198 aa8.95□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP8.95□□□□□ -0.98
SYN3-211ENST00000472027 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa8.95□□□□□ -0.98
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