RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000363841.1

RNA5SP28-201, Transcript of RNA, 5S ribosomal pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene RNA5SP28, Length 119 nt, Biotype rRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNA5SP28-201ENST00000363841 DPEP3Q9H4B8 488 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 TASP1Q9H6P5 420 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 ACSS3Q9H6R3 686 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 IFT22Q9H7X7 185 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 NANOGQ9H9S0 305 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 IL21RQ9HBE5 538 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 AKIP1Q9NQ31 210 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 ANLNQ9NQW6 1124 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 FBXO8Q9NRD0 319 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 NDFIP2Q9NV92 336 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 DCAF16Q9NXF7 216 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 PKD2L2Q9NZM6 624 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 SIRPGQ9P1W8 387 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 KIF17Q9P2E2 1029 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 ZNF229Q9UJW7 825 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 STOML2Q9UJZ1 356 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 MKL2Q9ULH7 1088 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 MMP17Q9ULZ9 603 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 CDC14AQ9UNH5 594 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 SNX7Q9UNH6 387 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 CORINQ9Y5Q5 1042 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 WNT6Q9Y6F9 365 aa4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 TRPC5OSA6NMA1 111 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 OR5K4A6NMS3 321 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 MEI4A8MW99 385 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 FOXO6A8MYZ6 492 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 SGK1O00141 431 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 COPEO14579 308 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 NDUFA2O43678 99 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 SNNO75324 88 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 SERPINI2O75830 405 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 CCNKO75909 580 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 SEC14L2O76054 403 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 VNN1O95497 513 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 NADKO95544 446 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 FTLP02792 175 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 CALB1P05937 261 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 RPS17P08708 135 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 GFAPP14136 432 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 CYP11B1P15538 503 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 ME2P23368 584 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 RRM1P23921 792 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 GABRB3P28472 473 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 GNA15P30679 374 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 IDUAP35475 653 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 TRIM23P36406 574 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 TALDO1P37837 337 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 DDOSTP39656 456 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 SLC26A3P40879 764 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 NSFP46459 744 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 OR3A3P47888 321 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 KCNJ1P48048 391 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 MAPKAPK2P49137 400 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 HK2P52789 917 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 PPP5CP53041 499 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 CLDN6P56747 220 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 GALK2Q01415 458 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 SMARCB1Q12824 385 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 RALGDSQ12967 914 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 GRIK2Q13002 908 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 BAMBIQ13145 260 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 CBLBQ13191 982 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 MMRN1Q13201 1228 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 SLC12A1Q13621 1099 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 GNA13Q14344 377 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 TMEM132DQ14C87 1099 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 ACAP2Q15057 778 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 TAF5Q15542 800 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 TSC22D1Q15714 1073 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 MYLKQ15746 1914 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 ZNF77Q15935 545 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 DGUOKQ16854 277 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 ZNF699Q32M78 642 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 ZFP69Q49AA0 526 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 ESCO2Q56NI9 601 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 XKR4Q5GH76 650 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 ACAD10Q6JQN1 1059 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 C16orf46Q6P387 395 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 UNC5AQ6ZN44 842 aa4.59□□□□□ -1.67
RNA5SP28-201ENST00000363841 FKBP9P1Q75LS8 142 aa4.59□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms