RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263036.9

OPTN-201, Transcript of optineurin, humanhuman

APPRIS P2 TSL 2 BASIC

Gene OPTN, Length 2,464 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTN-201ENST00000263036 ANGPTL1O95841 491 aa10.64□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 PEX11BO96011 259 aa10.64□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 GSNP06396 782 aa10.64□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 JUNDP17535 347 aa10.64□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 CCR1P32246 355 aa10.64□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 CD86P42081 329 aa10.64□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 IFITM2Q01629 132 aa10.64□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 PWP1Q13610 501 aa10.64□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 BRMS1LQ5PSV4 323 aa10.64□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 CATSPEREQ5SY80 951 aa10.64□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 ARTNQ5T4W7 220 aa10.64□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 MRNIPQ6NTE8 343 aa10.64□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 LYSMD2Q8IV50 215 aa10.64□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 EID3Q8N140 333 aa10.64□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 SVOPQ8N4V2 548 aa10.64□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 OR2T12Q8NG77 320 aa10.64□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 OR52E4Q8NGH9 312 aa10.64□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 OR5K1Q8NHB7 308 aa10.64□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 FBXO30Q8TB52 745 aa10.64□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 CNIH3Q8TBE1 160 aa10.64□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 FIG4Q92562 907 aa10.64□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 TBATAQ96M53 351 aa10.64□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 ACOX2Q99424 681 aa10.64□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 OSMRQ99650 979 aa10.64□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 DERL2Q9GZP9 239 aa10.64□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 DUSP21Q9H596 190 aa10.64□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 SYTL2Q9HCH5 934 aa10.64□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 TXNRD2Q9NNW7 524 aa10.64□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 HEBP1Q9NRV9 189 aa10.64□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 TESMINQ9Y4I5 508 aa10.64□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa10.64□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa10.64□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 WDR90Q96KV7 1748 aa10.63□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 POM121CA8CG34 1229 aa10.63□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 RGS13O14921 159 aa10.63□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 ECI2O75521 394 aa10.63□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 PRKD3O94806 890 aa10.63□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 ITGAMP11215 1152 aa10.63□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 DARSP14868 501 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 DCTP40126 519 aa10.63□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 ST13P50502 369 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 RENBPP51606 427 aa10.63□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 NCS1P62166 190 aa10.63□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 CDC42EP1Q00587 391 aa10.63□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 SLC13A2Q13183 592 aa10.63□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 LAPTM5Q13571 262 aa10.63□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 VGLL4Q14135 290 aa10.63□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 LRIT3Q3SXY7 679 aa10.63□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 SCIMPQ6UWF3 145 aa10.63□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 PAGE2Q7Z2X7 111 aa10.63□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 ADHFE1Q8IWW8 467 aa10.63□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 FAM126BQ8IXS8 530 aa10.63□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 PSMA8Q8TAA3 256 aa10.63□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 GIPC2Q8TF65 315 aa10.63□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 YME1L1Q96TA2 773 aa10.63□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 EXD2Q9NVH0 621 aa10.63□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 ERVK-18Q9QC07 812 aa10.63□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 LIMD1Q9UGP4 676 aa10.63□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 OSGIN1Q9UJX0 560 aa10.63□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 PCTPQ9UKL6 214 aa10.63□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 TPRKBQ9Y3C4 175 aa10.63□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 KCTD3Q9Y597 815 aa10.63□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 SAGE2PA6NJ88 616 aa10.63□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 GSTA4O15217 222 aa10.63□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 IRAK2O43187 625 aa10.63□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 KLK8O60259 260 aa10.63□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 RFPL2O75678 378 aa10.63□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 GOT2P00505 430 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 CYP11A1P05108 521 aa10.63□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 MMP2P08253 660 aa10.63□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 FSHRP23945 695 aa10.63□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 MAP2K4P45985 399 aa10.63□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 LHX1P48742 406 aa10.63□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 CXCR4P61073 352 aa10.63□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 SLC35A2P78381 396 aa10.63□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 IL5RAQ01344 420 aa10.63□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 RAPSNQ13702 412 aa10.63□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 CLCA4Q14CN2 919 aa10.63□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 NPTX1Q15818 432 aa10.63□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 ZNF181Q2M3W8 571 aa10.63□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 FBXO48Q5FWF7 155 aa10.63□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 SIRPB2Q5JXA9 342 aa10.63□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 TAPT1Q6NXT6 567 aa10.63□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 TUBA3EQ6PEY2 450 aa10.63□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 TXNDC11Q6PKC3 985 aa10.63□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa10.63□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 KIAA1958Q8N8K9 716 aa10.63□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 ARL10Q8N8L6 244 aa10.63□□□□□ -0.71
OPTN-201ENST00000263036 SETD9Q8NE22 299 aa10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms