RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261497.8

USP22-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 22, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP22, Length 5,220 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP22-201ENST00000261497 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa13.65□□□□□ -0.22
USP22-201ENST00000261497 ILVBLA1L0T0 632 aa13.65□□□□□ -0.22
USP22-201ENST00000261497 MTMR11A4FU01 709 aa13.65□□□□□ -0.22
USP22-201ENST00000261497 RGSL1A5PLK6 1076 aa13.65□□□□□ -0.22
USP22-201ENST00000261497 CCNKO75909 580 aa13.65□□□□□ -0.22
USP22-201ENST00000261497 VNN1O95497 513 aa13.65□□□□□ -0.22
USP22-201ENST00000261497 SERPINA1P01009 418 aa13.65□□□□□ -0.22
USP22-201ENST00000261497 FAM163BP0C2L3 166 aa13.65□□□□□ -0.22
USP22-201ENST00000261497 RALGDSQ12967 914 aa13.65□□□□□ -0.22
USP22-201ENST00000261497 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
USP22-201ENST00000261497 LIN54Q6MZP7 749 aa13.65□□□□□ -0.22
USP22-201ENST00000261497 Q6ZVU0 165 aa13.65□□□□□ -0.22
USP22-201ENST00000261497 SMYD1Q8NB12 490 aa13.65□□□□□ -0.22
USP22-201ENST00000261497 MYDGFQ969H8 173 aa13.65□□□□□ -0.22
USP22-201ENST00000261497 GAL3ST4Q96RP7 486 aa13.65□□□□□ -0.22
USP22-201ENST00000261497 TCF12Q99081 682 aa13.65□□□□□ -0.22
USP22-201ENST00000261497 NCDNQ9UBB6 729 aa13.65□□□□□ -0.22
USP22-201ENST00000261497 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
USP22-201ENST00000261497 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
USP22-201ENST00000261497 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
USP22-201ENST00000261497 PLOD3O60568 738 aa13.65□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 CBX3Q13185 183 aa13.65□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 TSTD2Q5T7W7 516 aa13.65□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 PARP8Q8N3A8 854 aa13.65□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 KCTD13Q8WZ19 329 aa13.65□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 TOR4AQ9NXH8 423 aa13.65□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 COG5Q9UP83 839 aa13.65□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 GRIN2DO15399 1336 aa13.64□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa13.64□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 TYRP14679 529 aa13.64□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 PPIBP23284 216 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 HTRA1Q92743 480 aa13.64□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 ITCHQ96J02 903 aa13.64□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 C8orf48Q96LL4 319 aa13.64□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 BIRC5O15392 142 aa13.64□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 ESR1P03372 595 aa13.64□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 SLC6A2P23975 617 aa13.64□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 LIN52Q52LA3 116 aa13.64□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 WDR45BQ5MNZ6 344 aa13.64□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 LY6G5CQ5SRR4 150 aa13.64□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 PROSER1Q86XN7 944 aa13.64□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 HCN3Q9P1Z3 774 aa13.64□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 ERVK-11Q9UQG0 969 aa13.64□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 COQ4Q9Y3A0 265 aa13.64□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 TRAF6Q9Y4K3 522 aa13.64□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 GOT2P00505 430 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 PRKCGP05129 697 aa13.64□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 NUDT17P0C025 328 aa13.64□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 IQCF3P0C7M6 154 aa13.64□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 ITGA2P17301 1181 aa13.64□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 EPHA3P29320 983 aa13.64□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 GSTM5P46439 218 aa13.64□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 ARF5P84085 180 aa13.64□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 ZFP69Q49AA0 526 aa13.64□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 POMZP3Q6PJE2 187 aa13.64□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 OFCC1Q8IZS5 231 aa13.64□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 FAM47BQ8NA70 645 aa13.64□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 CLHC1Q8NHS4 586 aa13.64□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 SUN5Q8TC36 379 aa13.64□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa13.64□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 PSMD11O00231 422 aa13.64□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 MAGP20916 626 aa13.64□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 PTGER3P43115 390 aa13.64□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 GABRB2P47870 512 aa13.64□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 HSPA7P48741 367 aa13.64□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 TAS2R50P59544 299 aa13.64□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 MED27Q6P2C8 311 aa13.64□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 SLC43A3Q8NBI5 491 aa13.64□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 OR2AP1Q8NGE2 309 aa13.64□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 OR4A15Q8NGL6 344 aa13.64□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 MCFD2Q8NI22 146 aa13.64□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 FAR1Q8WVX9 515 aa13.64□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 SLC9A6Q92581 669 aa13.64□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 PTPN18Q99952 460 aa13.64□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 DPYSL5Q9BPU6 564 aa13.64□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 FNDC11Q9BVV2 318 aa13.64□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 KLF15Q9UIH9 416 aa13.64□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 IKZF3Q9UKT9 509 aa13.64□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 C9J4A7 227 aa13.63□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 NOL4O94818 638 aa13.63□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 IDO1P14902 403 aa13.63□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 CYP4F3Q08477 520 aa13.63□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 LAPTM5Q13571 262 aa13.63□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 TIGD2Q4W5G0 525 aa13.63□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 PHF19Q5T6S3 580 aa13.63□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 KLHL24Q6TFL4 600 aa13.63□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 SIAH1Q8IUQ4 282 aa13.63□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 FAM13CQ8NE31 585 aa13.63□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 NTAN1Q96AB6 310 aa13.63□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 OSBPL2Q9H1P3 480 aa13.63□□□□□ -0.23
USP22-201ENST00000261497 DPPA5A6NC42 116 aa13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms