RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 TDGF1P3P51864 188 aa11.52□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 EPHA4P54764 986 aa11.52□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 GFERP55789 205 aa11.52□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 NCALDP61601 193 aa11.52□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 ZBED6P86452 979 aa11.52□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 CTBSQ01459 385 aa11.52□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 ELP6Q0PNE2 266 aa11.52□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 Q0VFX4 171 aa11.52□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 BNIP1Q12981 228 aa11.52□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 GSTA3Q16772 222 aa11.52□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 SPDYAQ5MJ70 313 aa11.52□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 TMEM198Q66K66 360 aa11.52□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 GDPD4Q6W3E5 623 aa11.52□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP11.52□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 SMYD1Q8NB12 490 aa11.52□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 PBKQ96KB5 322 aa11.52□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 SLC38A3Q99624 504 aa11.52□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 SMR3AQ99954 134 aa11.52□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 WDR26Q9H7D7 661 aa11.52□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 KBTBD4Q9NVX7 518 aa11.52□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa11.52□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa11.52□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 CSAG2Q9Y5P2 127 aa11.52□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 TSPAN11A1L157 253 aa11.51□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 LGALS16A8MUM7 142 aa11.51□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa11.51□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 I6L893 689 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 AGAP20933 346 aa11.51□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 CALB2P22676 271 aa11.51□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 MMP12P39900 470 aa11.51□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 MSH2P43246 934 aa11.51□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 SUOXP51687 545 aa11.51□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 VAMP7P51809 220 aa11.51□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 COPS2P61201 443 aa11.51□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 ADORA2A-AS1P86434 159 aa11.51□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 SPA17Q15506 151 aa11.51□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 WASHC2DQ5SRD0 308 aa11.51□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 OR52E8Q6IFG1 317 aa11.51□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 XKRXQ6PP77 449 aa11.51□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 ZNF783Q6ZMS7 281 aa11.51□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 RINLQ6ZS11 566 aa11.51□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 ASRGL1Q7L266 308 aa11.51□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 HOOK3Q86VS8 718 aa11.51□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 ZBTB2Q8N680 514 aa11.51□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 ELMO2Q96JJ3 720 aa11.51□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 C9orf72Q96LT7 481 aa11.51□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 TMEM237Q96Q45 408 aa11.51□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 SMC6Q96SB8 1091 aa11.51□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 TRIM62Q9BVG3 475 aa11.51□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa11.51□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 POPDC2Q9HBU9 364 aa11.51□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 PCMTD2Q9NV79 361 aa11.51□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 ADAM22Q9P0K1 906 aa11.51□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 SCOCQ9UIL1 159 aa11.51□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 L3MBTL1Q9Y468 752 aa11.51□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa11.51□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa11.5□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 ILVBLA1L0T0 632 aa11.5□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 M0QYV0 167 aa11.5□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 PAGE1O75459 146 aa11.5□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 POP4O95707 220 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 RARAP10276 462 aa11.5□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 CA5AP35218 305 aa11.5□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 RRADP55042 308 aa11.5□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 KCNK10P57789 538 aa11.5□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 RPS15P62841 145 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 MYLK3Q32MK0 819 aa11.5□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 TCP11X2Q5H9J9 407 aa11.5□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 IZUMO3Q5VZ72 239 aa11.5□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa11.5□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa11.5□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 PPP1R3BQ86XI6 285 aa11.5□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP11.5□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 HMCESQ96FZ2 354 aa11.5□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 CHP1Q99653 195 aa11.5□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 TMEM121Q9BTD3 319 aa11.5□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 TMEM8AQ9HCN3 771 aa11.5□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 ATP13A1Q9HD20 1204 aa11.5□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 PCDH12Q9NPG4 1184 aa11.5□□□□□ -0.57
HCG18-241ENST00000602290 ANLNQ9NQW6 1124 aa11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms