RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592594.5

TMC6-223, Transcript of transmembrane channel like 6, human

TSL 4

Gene TMC6, Length 551 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMC6-223	ENST00000592594	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	16	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		16	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	SOX13	Q9UN79	622 aa		16	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	LAMA5	O15230	3695 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	OR52A4P	A6NMU1	304 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	TAF4	O00268	1085 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	OR1I1	O60431	355 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	PROS1	P07225	676 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	ATP1B2	P14415	290 aa	Predicted RBP	15.99	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	CD1C	P29017	333 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	NPY2R	P49146	381 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	HHEX	Q03014	270 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	SPIDR	Q14159	915 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	NKAIN2	Q5VXU1	208 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	AFTPH	Q6ULP2	937 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	LDB1	Q86U70	411 aa	Predicted RBP	15.99	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	AMZ2	Q86W34	360 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	KLHL7	Q8IXQ5	586 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	OR2L2	Q8NH16	312 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	GRK7	Q8WTQ7	553 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	PRR11	Q96HE9	360 aa	Predicted RBP	15.99	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	TTC25	Q96NG3	672 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	FCRL3	Q96P31	734 aa	Predicted RBP	15.99	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	ABCG4	Q9H172	646 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	SYNDIG1	Q9H7V2	258 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	RDH14	Q9HBH5	336 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	15.99	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	ANKRD11	Q6UB99	2663 aa	Predicted RBP	15.98	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	KIR2DS5	A0A0G2JLQ3	304 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594		A0A0G2JNG1	304 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	RHPN2P1	A8MT19	583 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	KIR2DS3	K7RE56	304 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	GAS8	O95995	478 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	HOXB3	P14651	431 aa	Predicted RBP	15.98	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	XRCC1	P18887	633 aa	Predicted RBP	15.98	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	GPR3	P46089	330 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	MRPS25	P82663	173 aa	Known RBP	15.98	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	ZFP36L1	Q07352	338 aa	Known RBP	15.98	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	ITIH4	Q14624	930 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	KIR2DS5	Q14953	304 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	RTP5	Q14D33	572 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	METRNL	Q641Q3	311 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	15.98	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	PACS1	Q6VY07	963 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	TAS2R42	Q7RTR8	314 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	JAML	Q86YT9	394 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	KDF1	Q8NAX2	398 aa	Predicted RBP	15.98	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	SPDYE1	Q8NFV5	336 aa	Predicted RBP	15.98	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	OR4L1	Q8NH43	312 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	LKAAEAR1	Q8TD35	194 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	ZNF514	Q96K75	400 aa	Predicted RBP	15.98	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	RMDN2	Q96LZ7	410 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	GFM1	Q96RP9	751 aa	Known RBP	15.98	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	WDR83	Q9BRX9	315 aa	Known RBP	15.98	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	OGFR	Q9NZT2	677 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	MGAT4D	A6NG13	374 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	PDZK1P1	A8MUH7	402 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	DNALI1	O14645	258 aa	Predicted RBP	15.97	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	TTI1	O43156	1089 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	BANF1	O75531	89 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	MLN	P12872	115 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	ALDH4A1	P30038	563 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	15.97	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	PPP1R7	Q15435	360 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	AMZ1	Q400G9	498 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	MSS51	Q4VC12	460 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	WDR48	Q8TAF3	677 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	DCUN1D1	Q96GG9	259 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	NRSN2	Q9GZP1	204 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	BFAR	Q9NZS9	450 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	DKK4	Q9UBT3	224 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	FAM8A1	Q9UBU6	413 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	SDK2	Q58EX2	2172 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	GOLGA8K	D6RF30	607 aa		15.96	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	GOLGA8T	H3BQL2	631 aa		15.96	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	KCNJ13	O60928	360 aa		15.96	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	KRT37	O76014	449 aa		15.96	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	MPO	P05164	745 aa		15.96	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	F7	P08709	466 aa	Predicted RBP	15.96	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	IDS	P22304	550 aa		15.96	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	CCKBR	P32239	447 aa		15.96	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	PRAME	P78395	509 aa		15.96	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	CYP4F3	Q08477	520 aa		15.96	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	SQSTM1	Q13501	440 aa		15.96	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	LAMB3	Q13751	1172 aa		15.96	■□□□□ 0.15
TMC6-223	ENST00000592594	RPE65	Q16518	533 aa		15.96	■□□□□ 0.15

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