RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584538.1

USP22-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 22, human

TSL 4

Gene USP22, Length 554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP22-211	ENST00000584538	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		11.66	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		11.66	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	MAGEB16	A2A368	324 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	MGAT4D	A6NG13	374 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	ESPN	B1AK53	854 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	CFAP99	D6REC4	459 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	POP7	O75817	140 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	AP2A2	O94973	939 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	F3	P13726	295 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	PAM	P19021	973 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	RPS3	P23396	243 aa	Known RBP eCLIP	11.65	□□□□□ -0.54	1e-11	■■□□□ 11.5
USP22-211	ENST00000584538	PBLD	P30039	288 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	NSG1	P42857	185 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	DAB2	P98082	770 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	CALCOCO2	Q13137	446 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	NFE2L1	Q14494	772 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	ZNF789	Q5FWF6	425 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	SPANXN3	Q5MJ09	141 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	CHCHD2P9	Q5T1J5	151 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	LYPLAL1	Q5VWZ2	237 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	WASH2P	Q6VEQ5	465 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	EFL1	Q7Z2Z2	1120 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	CILP2	Q8IUL8	1156 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	PDIK1L	Q8N165	341 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	CEP112	Q8N8E3	955 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	11.65	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	OR2L2	Q8NH16	312 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	IFI44	Q8TCB0	444 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	HM13	Q8TCT9	377 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	CCDC74A	Q96AQ1	378 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	DCUN1D1	Q96GG9	259 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	RMDN2	Q96LZ7	410 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	TTC25	Q96NG3	672 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	PADI4	Q9UM07	663 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	DOLK	Q9UPQ8	538 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	DNAJC16	Q9Y2G8	782 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	UTP11	Q9Y3A2	253 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	RNF215	Q9Y6U7	377 aa		11.65	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	EIF3H	O15372	352 aa	Known RBP eCLIP	11.64	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	TTC4	O95801	387 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	C1QA	P02745	245 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	POLB	P06746	335 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	GP1BA	P07359	652 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	RALB	P11234	206 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	PML	P29590	882 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	SLC1A2	P43004	574 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	FASLG	P48023	281 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	TTPA	P49638	278 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	CLDN6	P56747	220 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	ILK	Q13418	452 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	LONRF1	Q17RB8	773 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	ZNF470	Q6ECI4	717 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	NEPRO	Q6NW34	567 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	TRMT10B	Q6PF06	316 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	IYD	Q6PHW0	289 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	ABRAXAS1	Q6UWZ7	409 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	AMZ2	Q86W34	360 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	KCNMB4	Q86W47	210 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	ARL14	Q8N4G2	192 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	ADAMTS14	Q8WXS8	1223 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	NAT6	Q93015	286 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	CERS2	Q96G23	380 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	BIRC8	Q96P09	236 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	NAT9	Q9BTE0	207 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	DPEP2	Q9H4A9	486 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	OSGEPL1	Q9H4B0	414 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	COG4	Q9H9E3	785 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	EPB41L5	Q9HCM4	733 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	ZNF624	Q9P2J8	865 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	MED16	Q9Y2X0	877 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	SPEG	Q15772	3267 aa		11.64	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	KLHL33	A6NCF5	533 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	PRMT5	O14744	637 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	KCNJ13	O60928	360 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	S1PR4	O95977	384 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	ADRB1	P08588	477 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	GLB1	P16278	677 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	KCNA4	P22459	653 aa		11.63	□□□□□ -0.55
USP22-211	ENST00000584538	RPIA	P49247	311 aa		11.63	□□□□□ -0.55

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