RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496325.5

PRKCZ-222, Transcript of protein kinase C zeta, human

TSL 4

Gene PRKCZ, Length 563 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCZ-222	ENST00000496325	OR13J1	Q8NGT2	312 aa		15.58	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	CAPZA3	Q96KX2	299 aa		15.58	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		15.58	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	RANBP9	Q96S59	729 aa		15.58	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	NAPG	Q99747	312 aa	Predicted RBP	15.58	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	TRIM4	Q9C037	500 aa		15.58	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	ENTPD2	Q9Y5L3	495 aa		15.58	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		15.58	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	15.57	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	HEATR9	A2RTY3	570 aa		15.57	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	CCDC162P	A2VCL2	907 aa		15.57	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	POP7	O75817	140 aa	Known RBP	15.57	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	GAS8	O95995	478 aa		15.57	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	TPSB2	P20231	275 aa		15.57	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	15.57	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	PBLD	P30039	288 aa	Predicted RBP	15.57	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	PDX1	P52945	283 aa		15.57	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	RHD	Q02161	417 aa		15.57	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	SPIDR	Q14159	915 aa		15.57	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	KCNJ11	Q14654	390 aa		15.57	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	NR1D2	Q14995	579 aa		15.57	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	TPSAB1	Q15661	275 aa		15.57	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	15.57	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	GPR33	Q49SQ1	333 aa		15.57	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	CHCHD2P9	Q5T1J5	151 aa	Predicted RBP	15.57	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		15.57	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	15.57	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	TMPRSS9	Q7Z410	1059 aa		15.57	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	B3GNT8	Q7Z7M8	397 aa		15.57	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	SERPINA9	Q86WD7	417 aa		15.57	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	CREG2	Q8IUH2	290 aa		15.57	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	PIANP	Q8IYJ0	282 aa		15.57	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	WBP1	Q96G27	269 aa		15.57	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	GFM1	Q96RP9	751 aa	Known RBP	15.57	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZCCHC2	Q9C0B9	1178 aa	Known RBP	15.57	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	DDX47	Q9H0S4	455 aa	Known RBP	15.57	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	KCND1	Q9NSA2	647 aa		15.57	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		15.57	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325		A0A1W2PNU3	283 aa	Predicted RBP	15.56	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	TCEA3	O75764	348 aa		15.56	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	BRAF	P15056	766 aa		15.56	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	ALDH4A1	P30038	563 aa		15.56	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	FOXN2	P32314	431 aa		15.56	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	FASLG	P48023	281 aa		15.56	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	15.56	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	CACNG1	Q06432	222 aa		15.56	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	BIRC2	Q13490	618 aa		15.56	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		15.56	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	FNBP1L	Q5T0N5	605 aa		15.56	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	LRRC8B	Q6P9F7	803 aa		15.56	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	XKR5	Q6UX68	686 aa		15.56	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	15.56	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	TAS2R42	Q7RTR8	314 aa		15.56	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	AMZ2	Q86W34	360 aa		15.56	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	WDR48	Q8TAF3	677 aa		15.56	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	CPT1B	Q92523	772 aa		15.56	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	HDAC10	Q969S8	669 aa		15.56	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	ULK4	Q96C45	1275 aa		15.56	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		15.56	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	CHRAC1	Q9NRG0	131 aa		15.56	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZDHHC3	Q9NYG2	299 aa		15.56	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZNF624	Q9P2J8	865 aa	Predicted RBP	15.56	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		15.56	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	SAR1B	Q9Y6B6	198 aa		15.56	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	IGLV3-16	A0A075B6K0	115 aa		15.55	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		15.55	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	CTAGE9	A4FU28	777 aa		15.55	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325		D6RAR5	112 aa		15.55	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	TMEM63A	O94886	807 aa		15.55	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	GOT2	P00505	430 aa	Known RBP	15.55	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	ATP1B2	P14415	290 aa	Predicted RBP	15.55	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	ACRV1	P26436	265 aa		15.55	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	MGAT1	P26572	445 aa		15.55	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	CD1C	P29017	333 aa		15.55	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	SLC19A1	P41440	591 aa		15.55	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	MAGEA6	P43360	314 aa		15.55	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	NPY2R	P49146	381 aa		15.55	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	FNTA	P49354	379 aa		15.55	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	TMPRSS3	P57727	454 aa		15.55	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	HHEX	Q03014	270 aa		15.55	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	ACVR1	Q04771	509 aa		15.55	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	DMPK	Q09013	629 aa		15.55	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	NFE2L1	Q14494	772 aa		15.55	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	CLCA4	Q14CN2	919 aa		15.55	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	DBN1	Q16643	649 aa		15.55	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	AMZ1	Q400G9	498 aa		15.55	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	PCID2	Q5JVF3	399 aa		15.55	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	NKAIN2	Q5VXU1	208 aa		15.55	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	ABRAXAS1	Q6UWZ7	409 aa		15.55	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	USP53	Q70EK8	1073 aa		15.55	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	15.55	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	COPS8	Q99627	209 aa		15.55	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		15.55	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	RDH14	Q9HBH5	336 aa		15.55	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	15.55	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	SYBU	Q9NX95	663 aa		15.55	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		15.55	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	RIMKLB	Q9ULI2	386 aa		15.55	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	15.55	■□□□□ 0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		15.54	■□□□□ 0.08

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