RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454619.5

NME4-208, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, human

TSL 5

Gene NME4, Length 719 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NME4-208	ENST00000454619	PLCL1	Q15111	1095 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NME4-208	ENST00000454619	EIF2S3L	Q2VIR3	472 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
NME4-208	ENST00000454619	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
NME4-208	ENST00000454619	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
NME4-208	ENST00000454619	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NME4-208	ENST00000454619	MAMDC2	Q7Z304	686 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
NME4-208	ENST00000454619	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NME4-208	ENST00000454619	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NME4-208	ENST00000454619	D2HGDH	Q8N465	521 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NME4-208	ENST00000454619	GDAP1	Q8TB36	358 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NME4-208	ENST00000454619	FAF2	Q96CS3	445 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NME4-208	ENST00000454619	TTC25	Q96NG3	672 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NME4-208	ENST00000454619	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
NME4-208	ENST00000454619	MAP3K3	Q99759	626 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NME4-208	ENST00000454619	TUBB2B	Q9BVA1	445 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NME4-208	ENST00000454619	MAP10	Q9P2G4	905 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NME4-208	ENST00000454619	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NME4-208	ENST00000454619	BZW2	Q9Y6E2	419 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
NME4-208	ENST00000454619	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NME4-208	ENST00000454619	KLK3	P07288	261 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
NME4-208	ENST00000454619	GSDMD	P57764	484 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NME4-208	ENST00000454619	CDK18	Q07002	472 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NME4-208	ENST00000454619	PPID	Q08752	370 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
NME4-208	ENST00000454619	DMPK	Q09013	629 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NME4-208	ENST00000454619	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
NME4-208	ENST00000454619	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
NME4-208	ENST00000454619	ZBTB17	Q13105	803 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NME4-208	ENST00000454619	MRPL49	Q13405	166 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
NME4-208	ENST00000454619	SLC14A2	Q15849	920 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NME4-208	ENST00000454619	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NME4-208	ENST00000454619	PRR30	Q53SZ7	412 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
NME4-208	ENST00000454619	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NME4-208	ENST00000454619	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
NME4-208	ENST00000454619	NT5DC3	Q86UY8	548 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NME4-208	ENST00000454619	AMZ2	Q86W34	360 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NME4-208	ENST00000454619	PQLC3	Q8N755	202 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NME4-208	ENST00000454619	CNTD1	Q8N815	330 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NME4-208	ENST00000454619	GPR150	Q8NGU9	434 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NME4-208	ENST00000454619	PRR7	Q8TB68	274 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NME4-208	ENST00000454619	BRSK1	Q8TDC3	778 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NME4-208	ENST00000454619	ADAMTS17	Q8TE56	1095 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NME4-208	ENST00000454619	PNPLA2	Q96AD5	504 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NME4-208	ENST00000454619	IMP4	Q96G21	291 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
NME4-208	ENST00000454619	ZCCHC2	Q9C0B9	1178 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
NME4-208	ENST00000454619	CBX8	Q9HC52	389 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NME4-208	ENST00000454619	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NME4-208	ENST00000454619	KCND1	Q9NSA2	647 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NME4-208	ENST00000454619	SNX7	Q9UNH6	387 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NME4-208	ENST00000454619	MED13	Q9UHV7	2174 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	OR5K3	A6NET4	321 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	TMEM63A	O94886	807 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	ZBTB11	O95625	1053 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	RAB40AL	P0C0E4	278 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	GPS2	Q13227	327 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	RPE65	Q16518	533 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	PCSK7	Q16549	785 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	SLC6A19	Q695T7	634 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	ZNF787	Q6DD87	383 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	CERS6	Q6ZMG9	384 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	OOSP2	Q86WS3	158 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	CARF	Q8N187	725 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619		Q8NA96	180 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	LRFN5	Q96NI6	719 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	CHST8	Q9H2A9	424 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	FANCE	Q9HB96	536 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	LUZP4	Q9P127	313 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	TMPRSS11E	Q9UL52	423 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	BOLA1	Q9Y3E2	137 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	CACNA1D	Q01668	2161 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	DCT	P40126	519 aa		13.94	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	RRAD	P55042	308 aa		13.94	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	GPR19	Q15760	415 aa		13.94	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		13.94	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		13.94	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		13.94	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	MED25	Q71SY5	747 aa		13.94	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	TMEM102	Q8N9M5	508 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		13.94	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	FDCSP	Q8NFU4	85 aa		13.94	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	CPT1B	Q92523	772 aa		13.94	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	ZNF501	Q96CX3	271 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	NUDT9	Q9BW91	350 aa		13.94	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	NLN	Q9BYT8	704 aa		13.94	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		13.94	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	HRASLS2	Q9NWW9	162 aa		13.94	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	SOHLH2	Q9NX45	425 aa		13.94	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	GPR83	Q9NYM4	423 aa		13.94	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	TCFL5	Q9UL49	500 aa		13.94	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		13.94	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		13.93	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	WIPF3	A6NGB9	483 aa		13.93	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	ZNF185	O15231	689 aa		13.93	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	POP7	O75817	140 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18

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