RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa20.58■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 STARD8Q92502 1023 aa20.58■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 HAUS1Q96CS2 278 aa20.58■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 ULBP3Q9BZM4 244 aa20.58■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 EFR3BQ9Y2G0 817 aa20.58■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa20.58■□□□□ 0.89
LIMS1-208ENST00000428064 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 NKX2-8O15522 239 aa20.57■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 RASSF9O75901 435 aa20.57■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 ANXA9O76027 345 aa20.57■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 FGF5P12034 268 aa20.57■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 FECHP22830 423 aa20.57■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 CTSCP53634 463 aa20.57■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 GEMP55040 296 aa20.57■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 GPRC6AQ5T6X5 926 aa20.57■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 UNC5BQ8IZJ1 945 aa20.57■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 KRT35Q92764 455 aa20.57■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 OR6C1Q96RD1 312 aa20.57■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 C19orf43Q9BQ61 176 aa20.57■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 FERMT1Q9BQL6 677 aa20.57■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 IL17BQ9UHF5 180 aa20.57■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa20.57■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 GPR39O43194 453 aa20.56■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 UGT1A9O60656 530 aa20.56■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 POP7O75817 140 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF28P17035 718 aa20.56■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 NELFEP18615 380 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 UGT1A6P19224 532 aa20.56■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 UGT1A1P22309 533 aa20.56■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 UGT1A4P22310 534 aa20.56■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 PTPN7P35236 360 aa20.56■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 SEPHS1P49903 392 aa20.56■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 NFKB2Q00653 900 aa20.56■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 SPA17Q15506 151 aa20.56■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 RPE65Q16518 533 aa20.56■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP20.56■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 CACHD1Q5VU97 1274 aa20.56■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa20.56■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 KLHL35Q6PF15 583 aa20.56■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 DAAM2Q86T65 1068 aa20.56■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 GPR150Q8NGU9 434 aa20.56■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 UBXN4Q92575 508 aa20.56■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 GORASP1Q9BQQ3 440 aa20.56■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 UGT1A7Q9HAW7 530 aa20.56■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 UGT1A10Q9HAW8 530 aa20.56■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 UGT1A8Q9HAW9 530 aa20.56■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa20.55■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 STX7O15400 261 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 NDUFA10O95299 355 aa20.55■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 PRAMEF1O95521 474 aa20.55■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 RBL1P28749 1068 aa20.55■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 OAS2P29728 719 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 CA5AP35218 305 aa20.55■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 SH3BP2P78314 561 aa20.55■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 LONRF2Q1L5Z9 754 aa20.55■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 METRNLQ641Q3 311 aa20.55■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM220Q6QAJ8 160 aa20.55■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 RANBP10Q6VN20 620 aa20.55■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 SLC41A2Q96JW4 573 aa20.55■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 TRIM5Q9C035 493 aa20.55■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 TRIM10Q9UDY6 481 aa20.55■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa20.55■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 SPTA1P02549 2419 aa20.55■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 OR2AG2A6NM03 316 aa20.54■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 C2orf81A6NN90 581 aa20.54■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 F5H423 210 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 MT-ND3P03897 115 aa20.54■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 TCN2P20062 427 aa20.54■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 LPOP22079 712 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 ADRA1AP35348 466 aa20.54■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 NFE2L1Q14494 772 aa20.54■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 IRGCQ6NXR0 463 aa20.54■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 FAM92BQ6ZTR7 304 aa20.54■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 PPP1R3BQ86XI6 285 aa20.54■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 KMT5CQ86Y97 462 aa20.54■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF398Q8TD17 642 aa20.54■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 ZFPM2Q8WW38 1151 aa20.54■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 FCRL4Q96PJ5 515 aa20.54■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa20.54■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 CD180Q99467 661 aa20.54■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 HEMGNQ9BXL5 484 aa20.54■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 ARL5AQ9Y689 179 aa20.54■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 C5orf60A6NFR6 353 aa20.53■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 AGAP14A8MT82 685 aa20.53■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 H7C0C1 242 aa20.53■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 PJA2O43164 708 aa20.53■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 BUD23O43709 281 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
LIMS1-208ENST00000428064 AGTP01019 485 aa20.53■□□□□ 0.88
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