RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419302.1

PDCL2P1-201, Transcript of phosducin-like 2 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PDCL2P1, Length 352 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2P1-201ENST00000419302 MFAP5Q13361 173 aa2.53□□□□□ -2
PDCL2P1-201ENST00000419302 TEAD2Q15562 447 aa2.53□□□□□ -2
PDCL2P1-201ENST00000419302 CDONQ4KMG0 1287 aa2.53□□□□□ -2
PDCL2P1-201ENST00000419302 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
PDCL2P1-201ENST00000419302 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa2.53□□□□□ -2
PDCL2P1-201ENST00000419302 LCN10Q6JVE6 187 aa2.53□□□□□ -2
PDCL2P1-201ENST00000419302 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
PDCL2P1-201ENST00000419302 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
PDCL2P1-201ENST00000419302 CCDC190Q86UF4 302 aa2.53□□□□□ -2
PDCL2P1-201ENST00000419302 CPOQ8IVL8 374 aa2.53□□□□□ -2
PDCL2P1-201ENST00000419302 LINC00612Q8N6U2 182 aa2.53□□□□□ -2
PDCL2P1-201ENST00000419302 ZNF383Q8NA42 475 aa2.53□□□□□ -2
PDCL2P1-201ENST00000419302 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
PDCL2P1-201ENST00000419302 HERVK_113Q902F9 699 aa2.53□□□□□ -2
PDCL2P1-201ENST00000419302 SUSD6Q92537 303 aa2.53□□□□□ -2
PDCL2P1-201ENST00000419302 OMA1Q96E52 524 aa2.53□□□□□ -2
PDCL2P1-201ENST00000419302 NSL1Q96IY1 281 aa2.53□□□□□ -2
PDCL2P1-201ENST00000419302 CLEC7AQ9BXN2 247 aa2.53□□□□□ -2
PDCL2P1-201ENST00000419302 TMEM39BQ9GZU3 492 aa2.53□□□□□ -2
PDCL2P1-201ENST00000419302 PIGMQ9H3S5 423 aa2.53□□□□□ -2
PDCL2P1-201ENST00000419302 OLFML3Q9NRN5 406 aa2.53□□□□□ -2
PDCL2P1-201ENST00000419302 MAN1B1Q9UKM7 699 aa2.53□□□□□ -2
PDCL2P1-201ENST00000419302 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
PDCL2P1-201ENST00000419302 MKLN1Q9UL63 735 aa2.53□□□□□ -2
PDCL2P1-201ENST00000419302 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP2.53□□□□□ -2
PDCL2P1-201ENST00000419302 SLC7A7Q9UM01 511 aa2.53□□□□□ -2
PDCL2P1-201ENST00000419302 CLIC4Q9Y696 253 aa2.53□□□□□ -2
PDCL2P1-201ENST00000419302 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa2.52□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa2.52□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 ATP2A1O14983 1001 aa2.52□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 IGHV4-59P01825 116 aa2.52□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP2.52□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 RPS18P62269 152 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 C2CD6Q53TS8 623 aa2.52□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 FAM69AQ5T7M9 428 aa2.52□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 ZNF343Q6P1L6 599 aa2.52□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 ADIPOR2Q86V24 386 aa2.52□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 LRRTM4Q86VH4 590 aa2.52□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 C11orf53Q8IXP5 236 aa2.52□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa2.52□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 RASGEF1CQ8N431 466 aa2.52□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 GCSAMQ8N6F7 178 aa2.52□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 ISCA1Q9BUE6 129 aa2.52□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 LRRC61Q9BV99 259 aa2.52□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 MAGIXQ9H6Y5 334 aa2.52□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 AGRNO00468 2067 aa2.51□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 CAPN2P17655 700 aa2.51□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 THOP1P52888 689 aa2.51□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 F2RL1P55085 397 aa2.51□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 ZBED6P86452 979 aa2.51□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa2.51□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 RAB6CQ53S08 254 aa2.51□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 SLC25A30Q5SVS4 291 aa2.51□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 CYP4A22Q5TCH4 519 aa2.51□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa2.51□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 ZNF843Q8N446 348 aa2.51□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 SLC38A9Q8NBW4 561 aa2.51□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 SMARCE1Q969G3 411 aa2.51□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa2.51□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 RAB6CQ9H0N0 254 aa2.51□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 SLC25A18Q9H1K4 315 aa2.51□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa2.51□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 RARRES3Q9UL19 164 aa2.51□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 CAPN7Q9Y6W3 813 aa2.51□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa2.5□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 A0A1W2PQM1 296 aa2.5□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 KPNA7A9QM74 516 aa2.5□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 H3BQ06 376 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 DNM1LO00429 736 aa2.5□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 NXPH2O95156 264 aa2.5□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 ICAM1P05362 532 aa2.5□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 H1F0P07305 194 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa2.5□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 UGT1A4P22310 534 aa2.5□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 HNF4AP41235 474 aa2.5□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 RARSP54136 660 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 PPFIA1Q13136 1202 aa2.5□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 GPR17Q13304 367 aa2.5□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 TRPC3Q13507 836 aa2.5□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 NECTIN1Q15223 517 aa2.5□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 E2F5Q15329 346 aa2.5□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa2.5□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 ZNF584Q8IVC4 421 aa2.5□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 LSMEM2Q8N112 164 aa2.5□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 SLC39A13Q96H72 371 aa2.5□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 FLRT3Q9NZU0 649 aa2.5□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP2.5□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 PRO0461Q9UI25 63 aa2.5□□□□□ -2.01
PDCL2P1-201ENST00000419302 FBXW11Q9UKB1 542 aa2.5□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms