RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402697.5

PRAME-203, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene PRAME, Length 2,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-203ENST00000402697 CSPG5O95196 566 aa12.86□□□□□ -0.35
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PRAME-203ENST00000402697 CBSP35520 551 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-203ENST00000402697 AGTR2P50052 363 aa12.84□□□□□ -0.35
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