RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 PDP2Q9P2J9 529 aa7□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 DEC1Q9P2X7 70 aa7□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC39A10Q9ULF5 831 aa7□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 ACOT9Q9Y305 439 aa7□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 HEATR9A2RTY3 570 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 RGSL1A5PLK6 1076 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 WASH4PA8MWX3 477 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 PRRT4C9JH25 899 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 HHLA1C9JL84 531 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM72CH0Y354 149 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 H0Y8X5 98 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 HDAC3O15379 428 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 IRAK2O43187 625 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 NPHS1O60500 1241 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 LILRA1O75019 489 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
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SMARCE1-201ENST00000264640 KRT36O76013 467 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 NTRK1P04629 796 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 RBP1P09455 135 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 COX4I1P13073 169 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 ANPEPP15144 967 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 STMN1P16949 149 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 GM2AP17900 193 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 CD68P34810 354 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 CPA2P48052 419 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 RPL14P50914 215 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 CCT8P50990 548 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 TPMTP51580 245 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 RENBPP51606 427 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 CLCN2P51788 898 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 NDST2P52849 883 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 TMPRSS3P57727 454 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 RAB10P61026 200 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC7A9P82251 487 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 NFKB2Q00653 900 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 RTP5Q14D33 572 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM83EQ2M2I3 478 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 TBC1D25Q3MII6 688 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 FUT11Q495W5 492 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 RABGAP1LQ5R372 815 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 SH2D4BQ5SQS7 431 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 CERCAMQ5T4B2 595 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM72AQ5TYM5 149 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 AGAP9Q5VTM2 703 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 GRAMD4Q6IC98 578 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 SDE2Q6IQ49 451 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM72DQ6L9T8 149 aa6.99□□□□□ -1.29
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SMARCE1-201ENST00000264640 CES3Q6UWW8 571 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 GALNT7Q86SF2 657 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 TAC4Q86UU9 113 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM72BQ86X60 149 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM25Q86YD3 366 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 CNTN4Q8IWV2 1026 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 BBS7Q8IWZ6 715 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 ZMIZ2Q8NF64 920 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 EDEM1Q92611 657 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 TTC9Q92623 222 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 WBP2Q969T9 261 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 C1orf74Q96LT6 269 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 RANBP9Q96S59 729 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 SORT1Q99523 831 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 PKMYT1Q99640 499 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 IL12RB2Q99665 862 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 GABRG3Q99928 467 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 DRC3Q9H069 523 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 SIK2Q9H0K1 926 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC25A51Q9H1U9 297 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 Q9H521 79 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 RETREG1Q9H6L5 497 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 TCF7L2Q9NQB0 619 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 IGSF5Q9NSI5 407 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 PNPOQ9NVS9 261 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 NMRK1Q9NWW6 199 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 COMMD8Q9NX08 183 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 IL17BQ9UHF5 180 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-201ENST00000264640 PLA2G4CQ9UP65 541 aa6.99□□□□□ -1.29
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