RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229304.4

APOBEC1-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC1, Length 879 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1-201ENST00000229304 SLC40A1Q9NP59 571 aa9.41□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 TCF7L2Q9NQB0 619 aa9.41□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 ARL8BQ9NVJ2 186 aa9.41□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 KCTD5Q9NXV2 234 aa9.41□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 EPS15L1Q9UBC2 864 aa9.41□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 TAGLN3Q9UI15 199 aa9.41□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 IKZF3Q9UKT9 509 aa9.41□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa9.41□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 MIA3Q5JRA6 1907 aa9.41□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa9.4□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 GOLGA8OA6NCC3 632 aa9.4□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa9.4□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 IQCF5A8MTL0 148 aa9.4□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 SUPT3HB4E1H0 165 aa9.4□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa9.4□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 ANHXE9PGG2 379 aa9.4□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 GOLGA8NF8WBI6 632 aa9.4□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 CDC7O00311 574 aa9.4□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 KPNA5O15131 536 aa9.4□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 SUPT3HO75486 399 aa9.4□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 SUPT7LO94864 414 aa9.4□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 KAT7O95251 611 aa9.4□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 MLYCDO95822 493 aa9.4□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 APODP05090 189 aa9.4□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 GDI1P31150 447 aa9.4□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 MNAT1P51948 309 aa9.4□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 SEMG2Q02383 582 aa9.4□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 KDSRQ06136 332 aa9.4□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 CDC16Q13042 620 aa9.4□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 LCP2Q13094 533 aa9.4□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 GBX1Q14549 363 aa9.4□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP9.4□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 TMEM52BQ4KMG9 183 aa9.4□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa9.4□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 FAM46CQ5VWP2 391 aa9.4□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 PARM1Q6UWI2 310 aa9.4□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa9.4□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 CYHR1Q6ZMK1 362 aa9.4□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 Q6ZVL8 140 aa9.4□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 TREML1Q86YW5 311 aa9.4□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 C10orf67Q8IYJ2 551 aa9.4□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 MYO1HQ8N1T3 1032 aa9.4□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 CLDN19Q8N6F1 224 aa9.4□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 PRR7Q8TB68 274 aa9.4□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa9.4□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa9.4□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 SUSD6Q92537 303 aa9.4□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 ARRDC3Q96B67 414 aa9.4□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 FAM136AQ96C01 138 aa9.4□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 MOCOSQ96EN8 888 aa9.4□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 CHFRQ96EP1 664 aa9.4□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 DCUN1D1Q96GG9 259 aa9.4□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 MSLNLQ96KJ4 702 aa9.4□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 COQ10AQ96MF6 247 aa9.4□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 BTBD10Q9BSF8 475 aa9.4□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 SPATA16Q9BXB7 569 aa9.4□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 RASSF4Q9H2L5 321 aa9.4□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF576Q9H609 170 aa9.4□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 MEAF6Q9HAF1 191 aa9.4□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 ARMCX1Q9P291 453 aa9.4□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 SARDHQ9UL12 918 aa9.4□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 HCN2Q9UL51 889 aa9.4□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 CDYLQ9Y232 598 aa9.4□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 TRAF6Q9Y4K3 522 aa9.4□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 OARD1Q9Y530 152 aa9.4□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 CHD7Q9P2D1 2997 aa9.4□□□□□ -0.9
APOBEC1-201ENST00000229304 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
APOBEC1-201ENST00000229304 TMEM265A0A087WTH1 108 aa9.39□□□□□ -0.91
APOBEC1-201ENST00000229304 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
APOBEC1-201ENST00000229304 SDHDO14521 159 aa9.39□□□□□ -0.91
APOBEC1-201ENST00000229304 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
APOBEC1-201ENST00000229304 WNT9AO14904 365 aa9.39□□□□□ -0.91
APOBEC1-201ENST00000229304 RAD51BO15315 384 aa9.39□□□□□ -0.91
APOBEC1-201ENST00000229304 SPINT1O43278 529 aa9.39□□□□□ -0.91
APOBEC1-201ENST00000229304 NUAK1O60285 661 aa9.39□□□□□ -0.91
APOBEC1-201ENST00000229304 SNX2O60749 519 aa9.39□□□□□ -0.91
APOBEC1-201ENST00000229304 TBX10O75333 385 aa9.39□□□□□ -0.91
APOBEC1-201ENST00000229304 CDK14O94921 469 aa9.39□□□□□ -0.91
APOBEC1-201ENST00000229304 TRIM16O95361 564 aa9.39□□□□□ -0.91
APOBEC1-201ENST00000229304 ELFN1P0C7U0 828 aa9.39□□□□□ -0.91
APOBEC1-201ENST00000229304 MPC1LP0DKB6 136 aa9.39□□□□□ -0.91
APOBEC1-201ENST00000229304 HLA-EP13747 358 aa9.39□□□□□ -0.91
APOBEC1-201ENST00000229304 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
APOBEC1-201ENST00000229304 GM2AP17900 193 aa9.39□□□□□ -0.91
APOBEC1-201ENST00000229304 AOAHP28039 575 aa9.39□□□□□ -0.91
APOBEC1-201ENST00000229304 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
APOBEC1-201ENST00000229304 ETV3P41162 512 aa9.39□□□□□ -0.91
APOBEC1-201ENST00000229304 IL12RB1P42701 662 aa9.39□□□□□ -0.91
APOBEC1-201ENST00000229304 TNFRSF4P43489 277 aa9.39□□□□□ -0.91
APOBEC1-201ENST00000229304 HK3P52790 923 aa9.39□□□□□ -0.91
APOBEC1-201ENST00000229304 KCNJ2P63252 427 aa9.39□□□□□ -0.91
APOBEC1-201ENST00000229304 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms