RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623983.1

CU639417.5-201, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CU639417.5, Length 476 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CU639417.5-201ENST00000623983 SNX20Q7Z614 316 aa8.69□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 SLC9B2Q86UD5 537 aa8.69□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 PIM3Q86V86 326 aa8.69□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 AMZ2Q86W34 360 aa8.69□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 SLITRK4Q8IW52 837 aa8.69□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 LSMEM2Q8N112 164 aa8.69□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 SLC35F6Q8N357 371 aa8.69□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 DNAAF3Q8N9W5 541 aa8.69□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 SGF29Q96ES7 293 aa8.69□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa8.69□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 MS4A14Q96JA4 679 aa8.69□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 PBKQ96KB5 322 aa8.69□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 SLC46A1Q96NT5 459 aa8.69□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 NUDT22Q9BRQ3 303 aa8.69□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 RDH14Q9HBH5 336 aa8.69□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 ASCL3Q9NQ33 180 aa8.69□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 CASS4Q9NQ75 786 aa8.69□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 WASH6PQ9NQA3 447 aa8.69□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 CPNE7Q9UBL6 633 aa8.69□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa8.69□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa8.69□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa8.69□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 SCN8AQ9UQD0 1980 aa8.69□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 ZZEF1O43149 2961 aa8.69□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 APC2O95996 2303 aa8.69□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 LAMA5O15230 3695 aa8.68□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 CACNA1GO43497 2377 aa8.68□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa8.68□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 A0A087WV48 116 aa8.68□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 USP27XA6NNY8 438 aa8.68□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 PDZK1P1A8MUH7 402 aa8.68□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 E7EVH7 732 aa8.68□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 PLD2O14939 933 aa8.68□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 KIF5CO60282 957 aa8.68□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 APRTP07741 180 aa8.68□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 PRSS56P0CW18 603 aa8.68□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 VCLP18206 1134 aa8.68□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 MSH3P20585 1137 aa8.68□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 ITGALP20701 1170 aa8.68□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 IDSP22304 550 aa8.68□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 RPL10P27635 214 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 AKT1P31749 480 aa8.68□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 MC4RP32245 332 aa8.68□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 SLC19A1P41440 591 aa8.68□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 LMAN1P49257 510 aa8.68□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 ARSDP51689 593 aa8.68□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 DRG2P55039 364 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 ERVPABLB-1P60509 514 aa8.68□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 GPR33Q49SQ1 333 aa8.68□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 CCDC38Q502W7 563 aa8.68□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 FNBP1LQ5T0N5 605 aa8.68□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 AGAP9Q5VTM2 703 aa8.68□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 NKAIN2Q5VXU1 208 aa8.68□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa8.68□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 DET1Q7L5Y6 550 aa8.68□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 RAB11FIP2Q7L804 512 aa8.68□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 GSTA5Q7RTV2 222 aa8.68□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 PIANPQ8IYJ0 282 aa8.68□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 NXPE1Q8N323 547 aa8.68□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 NAT14Q8WUY8 206 aa8.68□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 FGF11Q92914 225 aa8.68□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 SH3KBP1Q96B97 665 aa8.68□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 ULK4Q96C45 1275 aa8.68□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 OSBPL9Q96SU4 736 aa8.68□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 SLC38A3Q99624 504 aa8.68□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 STRADBQ9C0K7 418 aa8.68□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 SEMA6CQ9H3T2 930 aa8.68□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 FAM96AQ9H5X1 160 aa8.68□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 EPB41L5Q9HCM4 733 aa8.68□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa8.68□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 KCNK4Q9NYG8 393 aa8.68□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 CRLS1Q9UJA2 301 aa8.68□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 WDR37Q9Y2I8 494 aa8.68□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 MYLKQ15746 1914 aa8.68□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa8.67□□□□□ -1.02
CU639417.5-201ENST00000623983 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa8.67□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms