RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 ARMC12Q5T9G4 340 aa12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 LIPIQ6XZB0 460 aa12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 BBS5Q8N3I7 341 aa12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 TCP10LQ8TDR4 215 aa12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 HDAC11Q96DB2 347 aa12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 OLFM3Q96PB7 478 aa12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 RTKNQ9BST9 563 aa12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM167BQ9BTA0 163 aa12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 ZFP69BQ9UJL9 534 aa12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 SPO11Q9Y5K1 396 aa12.45□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 AURKAO14965 403 aa12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 INPP4BO15327 924 aa12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 CD68P34810 354 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 TAF11Q15544 211 aa12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 BBS9Q3SYG4 887 aa12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 LRRC66Q68CR7 880 aa12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 PID1Q7Z2X4 250 aa12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 FBXO36Q8NEA4 188 aa12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 CCDC110Q8TBZ0 833 aa12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 INPP5DQ92835 1189 aa12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 LRIG1Q96JA1 1093 aa12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 AGAP2Q99490 1192 aa12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 BPIFA1Q9NP55 256 aa12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC17A7Q9P2U7 560 aa12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 PRKAB1Q9Y478 270 aa12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 FPGTO14772 594 aa12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 WFS1O76024 890 aa12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM63AO94886 807 aa12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 PGLSO95336 258 aa12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 CER1O95813 267 aa12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 THOP1P52888 689 aa12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 ARL4CP56559 192 aa12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 AP1S1P61966 158 aa12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 FZD2Q14332 565 aa12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 PTPRCAPQ14761 206 aa12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 PDK1Q15118 436 aa12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 DEFB133Q30KQ1 61 aa12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 BRAT1Q6PJG6 821 aa12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 HID1Q8IV36 788 aa12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 PPIL6Q8IXY8 311 aa12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC25A45Q8N413 288 aa12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 MFSD2AQ8NA29 543 aa12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 PIH1D2Q8WWB5 315 aa12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 ECHDC3Q96DC8 303 aa12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF599Q96NL3 588 aa12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A0G2JND7 137 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 CCDC78A2IDD5 438 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM202A6NGA9 273 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 ENTPD5O75356 428 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 ZWINTO95229 277 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 C7P10643 843 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 PHBP35232 272 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 PTPN7P35236 360 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 POLD2P49005 469 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 PRRT3Q5FWE3 981 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 ENPP7Q6UWV6 458 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF567Q8N184 647 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 TEX26Q8N6G2 289 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 IPMKQ8NFU5 416 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 RFWD2Q8NHY2 731 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 PDXPQ96GD0 296 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 SIRPGQ9P1W8 387 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 TRIM38O00635 465 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 KCNN4O15554 427 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 GCATO75600 419 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 CALB2P22676 271 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 RPL22P35268 128 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 BASP1P80723 227 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 CLNKQ7Z7G1 428 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 SLCO6A1Q86UG4 719 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 PALM2Q8IXS6 379 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 NAT8LQ8N9F0 302 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 CCL4L1Q8NHW4 92 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 PCED1AQ9H1Q7 454 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 ACSS3Q9H6R3 686 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 BATF3Q9NR55 127 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 DKK3Q9UBP4 350 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 CHMP2BQ9UQN3 213 aa12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.8 ms