RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	IQCB1	Q15051	598 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	LARP7	Q4G0J3	582 aa	Known RBP eCLIP	11.72	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	PDPK2P	Q6A1A2	396 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	PWWP2B	Q6NUJ5	590 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	TEX19	Q8NA77	164 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	SPATA22	Q8NHS9	363 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	AGAP3	Q96P47	875 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	RNF157	Q96PX1	679 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	ACTL8	Q9H568	366 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	MAGEE1	Q9HCI5	957 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	LHX9	Q9NQ69	397 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	BZW2	Q9Y6E2	419 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	PCSK5	Q92824	1860 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	PIPSL	A2A3N6	862 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	SMTNL1	A8MU46	457 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	VEGFD	O43915	354 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	CDK14	O94921	469 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	MBD3	O95983	291 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	MT-CYB	P00156	380 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	SERPINC1	P01008	464 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	RNF224	P0DH78	156 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	FOLR1	P15328	257 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	KDELR1	P24390	212 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	CASP14	P31944	242 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	CA5A	P35218	305 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	CHAF1B	Q13112	559 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	TUBB3	Q13509	450 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	IL10RA	Q13651	578 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	NOMO1	Q15155	1222 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	NFKBIB	Q15653	356 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM199X	Q6PEV8	388 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	NPNT	Q6UXI9	565 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	WASH2P	Q6VEQ5	465 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	ATCAY	Q86WG3	371 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	TRAPPC5	Q8IUR0	188 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC41A2	Q96JW4	573 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	OLFM3	Q96PB7	478 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	BPIFA1	Q9NP55	256 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	CTTNBP2NL	Q9P2B4	639 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	EPHA6	Q9UF33	1036 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	KCND3	Q9UK17	655 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	HEY1	Q9Y5J3	304 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	SPTB	P11277	2137 aa		11.71	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	LRRD1	A4D1F6	860 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	GYPC	P04921	128 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	EBLN1	P0CF75	366 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	IDS	P22304	550 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	GNLY	P22749	145 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	CTSC	P53634	463 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	ZBED6	P86452	979 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	CDK18	Q07002	472 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	AP1B1	Q10567	949 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	SEMA5A	Q13591	1074 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	NT5DC3	Q86UY8	548 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	MAP7D3	Q8IWC1	876 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	VPS35	Q96QK1	796 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	RAB33B	Q9H082	229 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	PADI1	Q9ULC6	663 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		11.7	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	C21orf140	B9A014	251 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	PMPCB	O75439	489 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	NDST3	O95803	873 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	CCNYL3	P0C7X3	344 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	FECH	P22830	423 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	FANCC	Q00597	558 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC14A2	Q15849	920 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	RPE65	Q16518	533 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	UGT8	Q16880	541 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	NADK2	Q4G0N4	442 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	TTC30B	Q8N4P2	665 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	SIDT2	Q8NBJ9	832 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	MAP3K3	Q99759	626 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	RAD18	Q9NS91	495 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	UBP1	Q9NZI7	540 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	UVRAG	Q9P2Y5	699 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	RARRES3	Q9UL19	164 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TTLL3-233	ENST00000602338	ESPL1	Q14674	2120 aa		11.69	□□□□□ -0.54

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