RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597315.5

BRD4-208, Transcript of bromodomain containing 4, humanhuman

TSL 5

Gene BRD4, Length 892 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4-208ENST00000597315 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 CPNE7Q9UBL6 633 aa26.51■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 UNC13CQ8NB66 2214 aa26.5■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa26.5■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 A6NCN8 305 aa26.5■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 DXOO77932 396 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 RPL10P27635 214 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 CD1CP29017 333 aa26.5■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 XIAPP98170 497 aa26.5■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 SEMA5AQ13591 1074 aa26.5■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 GPR33Q49SQ1 333 aa26.5■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 NKAIN2Q5VXU1 208 aa26.5■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 TAS2R42Q7RTR8 314 aa26.5■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 PRUNE1Q86TP1 453 aa26.5■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 COPS8Q99627 209 aa26.5■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 FAM96AQ9H5X1 160 aa26.5■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 CCL22O00626 93 aa26.49■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 SUN1O94901 812 aa26.49■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 TNFSF15O95150 251 aa26.49■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 RPL22P35268 128 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 MAPK9P45984 424 aa26.49■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 CTSCP53634 463 aa26.49■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 BASP1P80723 227 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 IGF2-ASQ6U949 168 aa26.49■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 REXO1L1PQ8IX06 675 aa26.49■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 NXPE1Q8N323 547 aa26.49■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 CXorf40BQ96DE9 158 aa26.49■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 SLC46A1Q96NT5 459 aa26.49■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 NUDT22Q9BRQ3 303 aa26.49■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 LOXL2Q9Y4K0 774 aa26.49■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 ASPMQ8IZT6 3477 aa26.49■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 ACACAQ13085 2346 aa26.48■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 ZFHX4Q86UP3 3567 aa26.48■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 HEATR9A2RTY3 570 aa26.48■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 KLHL33A6NCF5 533 aa26.48■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 AGRPO00253 132 aa26.48■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa26.48■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 KCNJ1P48048 391 aa26.48■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 DRG2P55039 364 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 WASH2PQ6VEQ5 465 aa26.48■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 C11orf96Q7Z7L8 435 aa26.48■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 SLC35F6Q8N357 371 aa26.48■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 ZNF248Q8NDW4 579 aa26.48■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 SGF29Q96ES7 293 aa26.48■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 KCNF1Q9H3M0 494 aa26.48■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 SEMA6CQ9H3T2 930 aa26.48■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 WASH6PQ9NQA3 447 aa26.48■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 CCDC78A2IDD5 438 aa26.47■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 H7C0S8 307 aa26.47■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 CA5AP35218 305 aa26.47■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 EPHA4P54764 986 aa26.47■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 AGAP9Q5VTM2 703 aa26.47■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa26.47■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 JAMLQ86YT9 394 aa26.47■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 SLITRK4Q8IW52 837 aa26.47■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 GLIS1Q8NBF1 620 aa26.47■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 OR4D9Q8NGE8 314 aa26.47■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP26.47■■□□□ 1.832e-11■■■■■ 29.4
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BRD4-208ENST00000597315 EPB41L1Q9H4G0 881 aa26.47■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 POT1Q9NUX5 634 aa26.47■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 PISDQ9UG56 409 aa26.47■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 AP3B1O00203 1094 aa26.46■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 ITGA2BP08514 1039 aa26.46■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 ABCG1P45844 678 aa26.46■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 CACNG1Q06432 222 aa26.46■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 DMPKQ09013 629 aa26.46■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 SQSTM1Q13501 440 aa26.46■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP26.46■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 CCDC38Q502W7 563 aa26.46■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 TMEM71Q6P5X7 295 aa26.46■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa26.46■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 NCSTNQ92542 709 aa26.46■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 ASCL3Q9NQ33 180 aa26.46■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa26.46■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 APC2O95996 2303 aa26.46■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
BRD4-208ENST00000597315 A0A087WV48 116 aa26.45■■□□□ 1.82
BRD4-208ENST00000597315 AGAP14A8MT82 685 aa26.45■■□□□ 1.82
BRD4-208ENST00000597315 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
BRD4-208ENST00000597315 ADRA1DP25100 572 aa26.45■■□□□ 1.82
BRD4-208ENST00000597315 LIMK2P53671 638 aa26.45■■□□□ 1.82
BRD4-208ENST00000597315 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
BRD4-208ENST00000597315 CCDC173Q0VFZ6 552 aa26.45■■□□□ 1.82
BRD4-208ENST00000597315 C19orf48Q6RUI8 117 aa26.45■■□□□ 1.82
BRD4-208ENST00000597315 NLRP9Q7RTR0 991 aa26.45■■□□□ 1.82
BRD4-208ENST00000597315 SERPINA9Q86WD7 417 aa26.45■■□□□ 1.82
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