RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592965.2

MBD3-211, Transcript of methyl-CpG binding domain protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene MBD3, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3-211ENST00000592965 BRAFP15056 766 aa22.89■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 IDSP22304 550 aa22.89■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 RBL1P28749 1068 aa22.89■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 GEMP55040 296 aa22.89■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 CHRNA6Q15825 494 aa22.89■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 LDLRAP1Q5SW96 308 aa22.89■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 CCDC181Q5TID7 509 aa22.89■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa22.89■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 FAM151BQ6UXP7 276 aa22.89■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 DDHD1Q8NEL9 900 aa22.89■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 ACTL9Q8TC94 416 aa22.89■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 FERMT1Q9BQL6 677 aa22.89■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 GORASP1Q9BQQ3 440 aa22.89■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 ZPBPQ9BS86 351 aa22.89■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 OSBPL8Q9BZF1 889 aa22.89■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 FBXO8Q9NRD0 319 aa22.89■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 SMOXQ9NWM0 555 aa22.89■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 OGFRQ9NZT2 677 aa22.89■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 PKP3Q9Y446 797 aa22.89■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 CCDC66A2RUB6 948 aa22.88■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 KCNJ13O60928 360 aa22.88■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 C9P02748 559 aa22.88■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 CTNNA2P26232 953 aa22.88■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 ITGA9Q13797 1035 aa22.88■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 LINC00303Q3SY05 128 aa22.88■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 CEACAM20Q6UY09 585 aa22.88■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 IL22RA1Q8N6P7 574 aa22.88■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 RTP4Q96DX8 246 aa22.88■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 TTC25Q96NG3 672 aa22.88■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa22.88■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 RAD1O60671 282 aa22.87■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 UBXN7O94888 489 aa22.87■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 RPL10P27635 214 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 DMPKQ09013 629 aa22.87■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa22.87■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 EXTL1Q92935 676 aa22.87■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 FICDQ9BVA6 458 aa22.87■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 SPRY4Q9C004 299 aa22.87■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 C10orf88Q9H8K7 445 aa22.87■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 SLC40A1Q9NP59 571 aa22.87■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 KLHL3Q9UH77 587 aa22.87■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 PILRAQ9UKJ1 303 aa22.87■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 DUSP10Q9Y6W6 482 aa22.87■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 MACROD2A1Z1Q3 448 aa22.86■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 OR52A4PA6NMU1 304 aa22.86■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 GPR39O43194 453 aa22.86■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 UGT1A9O60656 530 aa22.86■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 UGT1A6P19224 532 aa22.86■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 UGT1A1P22309 533 aa22.86■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 UGT1A4P22310 534 aa22.86■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 ADRA1AP35348 466 aa22.86■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 CAPZBP47756 277 aa22.86■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 GFERP55789 205 aa22.86■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 RWDD2BP57060 319 aa22.86■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 GPRC6AQ5T6X5 926 aa22.86■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 RANBP10Q6VN20 620 aa22.86■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 RAD9BQ6WBX8 426 aa22.86■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 AMZ2Q86W34 360 aa22.86■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa22.86■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 EXD3Q8N9H8 876 aa22.86■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 LRRC57Q8N9N7 239 aa22.86■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 C9orf72Q96LT7 481 aa22.86■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 LACRTQ9GZZ8 138 aa22.86■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 RBSNQ9H1K0 784 aa22.86■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 UGT1A7Q9HAW7 530 aa22.86■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 UGT1A10Q9HAW8 530 aa22.86■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 UGT1A8Q9HAW9 530 aa22.86■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 B8ZZF3 427 aa22.85■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 STX7O15400 261 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 BUD23O43709 281 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 STK10O94804 968 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 AGTP01019 485 aa22.85■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 RBP3P10745 1247 aa22.85■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 LIFP15018 202 aa22.85■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 TYRP1P17643 537 aa22.85■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 VAV2P52735 878 aa22.85■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 CTSCP53634 463 aa22.85■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 DRG2P55039 364 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 GPR18Q14330 331 aa22.85■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa22.85■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa22.85■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa22.85■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 ALG3Q92685 438 aa22.85■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 CXorf40BQ96DE9 158 aa22.85■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 CTRCQ99895 268 aa22.85■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 SLC12A9Q9BXP2 914 aa22.85■■□□□ 1.25
MBD3-211ENST00000592965 WDR37Q9Y2I8 494 aa22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 122.2 ms