RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586312.5

PSME3-208, Transcript of proteasome activator subunit 3, human

TSL 5

Gene PSME3, Length 752 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME3-208	ENST00000586312	IGF2BP2	Q9Y6M1	599 aa	Known RBP eCLIP	13.57	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	TRBV23OR9-2	A0A075B6M9	112 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312		A6NCN8	305 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	OR5K4	A6NMS3	321 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	PFDN6	O15212	129 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	KRT14	P02533	472 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	ACP5	P13686	325 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	HGF	P14210	728 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	ZNF8	P17098	575 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	TPH1	P17752	444 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	ADRA1D	P25100	572 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	CASQ1	P31415	396 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	RPL22	P35268	128 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	HAL	P42357	657 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	KCNJ1	P48048	391 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	PCBP4	P57723	403 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	TLE3	Q04726	772 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	GPS1	Q13098	491 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	ZRANB3	Q5FWF4	1079 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	CRTC3	Q6UUV7	619 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	TAS2R42	Q7RTR8	314 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	SNX20	Q7Z614	316 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	ADGRG6	Q86SQ4	1221 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	CLEC14A	Q86T13	490 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	TRIM48	Q8IWZ4	208 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	KLHDC8B	Q8IXV7	354 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	PRELID2	Q8N945	189 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	OR52K1	Q8NGK4	314 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	SH3KBP1	Q96B97	665 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	MS4A14	Q96JA4	679 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	RDH14	Q9HBH5	336 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	EPB41L5	Q9HCM4	733 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	SMOX	Q9NWM0	555 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	FKBPL	Q9UIM3	349 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	SSUH2	Q9Y2M2	353 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	ATM	Q13315	3056 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	SNRNP200	O75643	2136 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	ATRX	P46100	2492 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	TMX2-CTNND1	H3BSU7	103 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	AGRP	O00253	132 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	NDC80	O14777	642 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	CHUK	O15111	745 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	RRP8	O43159	456 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	SNX2	O60749	519 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	SUN1	O94901	812 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	TNFSF15	O95150	251 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	ETS1	P14921	441 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	CD1C	P29017	333 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	UGT1A5	P35504	534 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	COIL	P38432	576 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	ETV5	P41161	510 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	NPY2R	P49146	381 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	VPS41	P49754	854 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	PRAME	P78395	509 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	NFATC2	Q13469	925 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	OLIG2	Q13516	323 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	CHCHD2P9	Q5T1J5	151 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	LYPLAL1	Q5VWZ2	237 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	LRRC69	Q6ZNQ3	347 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	RAB11FIP2	Q7L804	512 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	ZNF761	Q86XN6	746 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	SFRP1	Q8N474	314 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	ZNF248	Q8NDW4	579 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	DDHD1	Q8NEL9	900 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	SLC37A2	Q8TED4	501 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	CAPZA3	Q96KX2	299 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	TMEM74	Q96NL1	305 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	COPS8	Q99627	209 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	TIMM29	Q9BSF4	260 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	IL22	Q9GZX6	179 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	NLE1	Q9NVX2	485 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	AKAP7	Q9P0M2	348 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	SLC23A2	Q9UGH3	650 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	KCNK6	Q9Y257	313 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	SPTB	P11277	2137 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	PRR19	A6NJB7	356 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	USP27X	A6NNY8	438 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	PDZK1P1	A8MUH7	402 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	QSOX1	O00391	747 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	GAPDHS	O14556	408 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	PLD2	O14939	933 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	MTX2	O75431	263 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	ZSCAN5DP	P0CG00	497 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	ZNF7	P17097	686 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	PAM	P19021	973 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	ITIH1	P19827	911 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	TPSB2	P20231	275 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME3-208	ENST00000586312	IDS	P22304	550 aa		13.54	□□□□□ -0.24

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