RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585934.1

TRAPPC6A-202, Transcript of trafficking protein particle complex 6A, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC6A, Length 758 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6A-202ENST00000585934 OR2AG2A6NM03 316 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 NVLO15381 856 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 PRAMEF10O60809 474 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 MSH3P20585 1137 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 RPL10P27635 214 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 ETV5P41161 510 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 HALP42357 657 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 DRG2P55039 364 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 TMPRSS15P98073 1019 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 SQSTM1Q13501 440 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 LONRF2Q1L5Z9 754 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 SNAP47Q5SQN1 464 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 TMEM71Q6P5X7 295 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 GPR155Q7Z3F1 870 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 AMZ2Q86W34 360 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 AGBL5Q8NDL9 886 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 ZNF398Q8TD17 642 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 NCSTNQ92542 709 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 USP7Q93009 1102 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 CXorf40BQ96DE9 158 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 EPB41L1Q9H4G0 881 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 ASB8Q9H765 288 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 LZTFL1Q9NQ48 299 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 KCTD3Q9Y597 815 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 SRP72O76094 671 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 METTL18O95568 372 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 ITGALP20701 1170 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 HADHAP40939 763 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 CTSCP53634 463 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 CFHR1Q03591 330 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 CLN3Q13286 438 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 SEPT6Q14141 434 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 RPS6KA1Q15418 735 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 TMEM220Q6QAJ8 160 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 DET1Q7L5Y6 550 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 C11orf96Q7Z7L8 435 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 FAM129CQ86XR2 697 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 OR13C4Q8NGS5 318 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 CPNE5Q9HCH3 593 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 POT1Q9NUX5 634 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 KLHL3Q9UH77 587 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 OR52A4PA6NMU1 304 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 A8MU76 341 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 PSMD3O43242 534 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 KCNJ13O60928 360 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 POP7O75817 140 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 IFNB1P01574 187 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 LIPCP11150 499 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 RALBP11234 206 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 CCL4P13236 92 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 CA5AP35218 305 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 FNBP1LQ5T0N5 605 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 ARHGAP40Q5TG30 622 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 AGAP9Q5VTM2 703 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 DENND5AQ6IQ26 1287 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 WASH2PQ6VEQ5 465 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 TMEM26Q6ZUK4 368 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 ULK4Q96C45 1275 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 DCUN1D1Q96GG9 259 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 UCK1Q9HA47 277 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 ARNT2Q9HBZ2 717 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 WASH6PQ9NQA3 447 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 FOXJ2Q9P0K8 574 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 ACSL6Q9UKU0 697 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 IGSF10Q6WRI0 2623 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 SDK2Q58EX2 2172 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 BPTFQ12830 3046 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 PRR19A6NJB7 356 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 EFCAB7A8K855 629 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 C9orf172C9J069 976 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 CCL22O00626 93 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 LIASO43766 372 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 AP2A1O95782 977 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 BRAFP15056 766 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 CD82P27701 267 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 SLC19A1P41440 591 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 LMAN1P49257 510 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 DMPKQ09013 629 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 POU6F1Q14863 301 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 MEI1Q5TIA1 1274 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-202ENST00000585934 KCTD11Q693B1 232 aa16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms