RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565378.1

BBS2-210, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 2, human

TSL 4

Gene BBS2, Length 574 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS2-210	ENST00000565378	SRC	P12931	536 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	CSF2RB	P32927	897 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	MAN1A1	P33908	653 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	HK3	P52790	923 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	PLK1	P53350	603 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	SRP54	P61011	504 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	YPEL5	P62699	121 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	ZFP36L1	Q07352	338 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	INCA1	Q0VD86	236 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	NME3	Q13232	169 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	STK38	Q15208	465 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	INPP5J	Q15735	1006 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	ZXDC	Q2QGD7	858 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	NADK2	Q4G0N4	442 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	LRRC73	Q5JTD7	316 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	ANKS6	Q68DC2	871 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	ARHGAP17	Q68EM7	881 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	TCTN3	Q6NUS6	607 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	TICAM1	Q8IUC6	712 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	TTC39C	Q8N584	583 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	OR2A12	Q8NGT7	310 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	STARD8	Q92502	1023 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	SLC45A3	Q96JT2	553 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	WDR92	Q96MX6	357 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	LENG8	Q96PV6	779 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	HEPH	Q9BQS7	1158 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	WRAP53	Q9BUR4	548 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	TWSG1	Q9GZX9	223 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	MBNL1	Q9NR56	388 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	CCM2L	Q9NUG4	571 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	ITM2B	Q9Y287	266 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	FADS3	Q9Y5Q0	445 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	IGHV5-10-1	A0A0J9YXX1	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	C16orf96	A6NNT2	1141 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	C10orf142	B7Z368	130 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378		M0QYV0	167 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	DAPK3	O43293	454 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	B4GAT1	O43505	415 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	SRGAP2	O75044	1071 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	IGLV3-27	P01718	113 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	PCCB	P05166	539 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	MYBL2	P10244	700 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	RBP3	P10745	1247 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	VDR	P11473	427 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	GK	P32189	559 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	DLST	P36957	453 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	MAPK9	P45984	424 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	NEK2	P51955	445 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	PGD	P52209	483 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	MAZ	P56270	477 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	LGALS4	P56470	323 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	PFN3	P60673	137 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	CDK18	Q07002	472 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	FOXM1	Q08050	763 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	C14orf28	Q4W4Y0	310 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	CARD16	Q5EG05	197 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	SYPL2	Q5VXT5	272 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	FBXL22	Q6P050	247 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	PMF1	Q6P1K2	205 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	PGM2L1	Q6PCE3	622 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	LRRC31	Q6UY01	552 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	MACC1	Q6ZN28	852 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	UNC13D	Q70J99	1090 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	SPRED1	Q7Z699	444 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	TAC4	Q86UU9	113 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	GLB1L2	Q8IW92	636 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	SFTPA2	Q8IWL1	248 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	MCEMP1	Q8IX19	187 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-210	ENST00000565378	CMIP	Q8IY22	773 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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