RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	ADAM10	O14672	748 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	NCAM2	O15394	837 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	KLK10	O43240	276 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	NFATC1	O95644	943 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	TIMP1	P01033	207 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	CXCL10	P02778	98 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	CLTA	P09496	248 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	CXCL8	P10145	99 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	KRT13	P13646	458 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	ARSA	P15289	507 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	CSF2RA	P15509	400 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	HOXB9	P17482	250 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	TNNI1	P19237	187 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	TFEB	P19484	476 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	KEL	P23276	732 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	GSTM2	P28161	218 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	FMO5	P49326	533 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	KLK7	P49862	253 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	CFHR1	Q03591	330 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	UBXN1	Q04323	297 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	ZBTB16	Q05516	673 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	BFSP1	Q12934	665 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	PSMD6	Q15008	389 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	ZBTB6	Q15916	424 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	CBWD6	Q4V339	395 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	ANO7	Q6IWH7	933 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	FAM47B	Q8NA70	645 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	LMO3	Q8TAP4	145 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	ZFPM2	Q8WW38	1151 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	HERVK_113	Q902F9	699 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	SEPT8	Q92599	483 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	SEMA4D	Q92854	862 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	GAD1	Q99259	594 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	RGS18	Q9NS28	235 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	SLC22A11	Q9NSA0	550 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM184C	Q9NVA4	438 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	DTX4	Q9Y2E6	619 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	PKP3	Q9Y446	797 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	CEP350	Q5VT06	3117 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	PTPRJ	Q12913	1337 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	PTGES	O14684	152 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	EPHB6	O15197	1021 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	USP12	O75317	370 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	NOL4	O94818	638 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	AGR2	O95994	175 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	ACTN1	P12814	892 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	CYP4B1	P13584	511 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	PON1	P27169	355 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	ABCG1	P45844	678 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	CCR5	P51681	352 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	SLC12A2	P55011	1212 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	C21orf58	P58505	322 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	UBE3A	Q05086	875 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	ENPEP	Q07075	957 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	SYCP1	Q15431	976 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	FILIP1L	Q4L180	1135 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	XKR4	Q5GH76	650 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	JADE1	Q6IE81	842 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LINS1-210	ENST00000560934	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		4.63	□□□□□ -1.67

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