RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544989.1

HDAC4-216, Transcript of histone deacetylase 4, human

TSL 5

Gene HDAC4, Length 342 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC4-216	ENST00000544989	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	SNX20	Q7Z614	316 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	B3GNT8	Q7Z7M8	397 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	STYX	Q8WUJ0	223 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	PATE1	Q8WXA2	126 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	NAP1L3	Q99457	506 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	APOL2	Q9BQE5	337 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	ASB8	Q9H765	288 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	VPS37B	Q9H9H4	285 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	ASCL3	Q9NQ33	180 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	POT1	Q9NUX5	634 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	CRLS1	Q9UJA2	301 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	LOXL2	Q9Y4K0	774 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	SCN8A	Q9UQD0	1980 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	TCRBV7S2A1N4T	A0A589	114 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	AGAP14	A8MT82	685 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989		F8W8V4	182 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989		H7C0S8	307 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	GAPDHS	O14556	408 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	NVL	O15381	856 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	ZSCAN12	O43309	604 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	UGT1A9	O60656	530 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	MTX2	O75431	263 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	SUN1	O94901	812 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	METTL18	O95568	372 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	GSTM1	P09488	218 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	UGT1A6	P19224	532 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	UGT1A1	P22309	533 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	UGT1A4	P22310	534 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	CD82	P27701	267 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	UGT1A3	P35503	534 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	LIMK2	P53671	638 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	GDF10	P55107	478 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	GSTM4	Q03013	218 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	SPARCL1	Q14515	664 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	ZNF648	Q5T619	568 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	ABRAXAS1	Q6UWZ7	409 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	ZNF547	Q8IVP9	402 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	SFTPA2	Q8IWL1	248 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	DNAAF3	Q8N9W5	541 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	AGBL5	Q8NDL9	886 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	C1orf54	Q8WWF1	131 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	KCNE4	Q8WWG9	221 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	TBRG4	Q969Z0	631 aa	Known RBP eCLIP	11.62	□□□□□ -0.55	4e-7	■■■■■ 34.7
HDAC4-216	ENST00000544989	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	PRR11	Q96HE9	360 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	UGT1A7	Q9HAW7	530 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	UGT1A10	Q9HAW8	530 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	UGT1A8	Q9HAW9	530 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	FKBPL	Q9UIM3	349 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	ACSL6	Q9UKU0	697 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	TMPRSS11E	Q9UL52	423 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	ACSL5	Q9ULC5	683 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	RIMKLB	Q9ULI2	386 aa		11.62	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	ATXN7L1	Q9ULK2	861 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	PCYT1B	Q9Y5K3	369 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	SPTA1	P02549	2419 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	ZNF462	Q96JM2	2506 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	HEATR9	A2RTY3	570 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	PRR19	A6NJB7	356 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	QSOX1	O00391	747 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	LDB2	O43679	373 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	POP7	O75817	140 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	FGG	P02679	453 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	THRA	P10827	490 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	CSTF2	P33240	577 aa	Known RBP eCLIP	11.61	□□□□□ -0.55	1e-6	■■■□□ 19
HDAC4-216	ENST00000544989	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	XIAP	P98170	497 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	SEMA5A	Q13591	1074 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	BCL7A	Q4VC05	210 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	TMEM220	Q6QAJ8	160 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	TMEM26	Q6ZUK4	368 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	USP53	Q70EK8	1073 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	GSTA5	Q7RTV2	222 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	NXPE1	Q8N323	547 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	RASGEF1A	Q8N9B8	481 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	ZFPM2	Q8WW38	1151 aa		11.61	□□□□□ -0.55
HDAC4-216	ENST00000544989	PEX13	Q92968	403 aa		11.61	□□□□□ -0.55

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