RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514231.1

PDE4D-221, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 733 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-221ENST00000514231 GNB3P16520 340 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 HRH2P25021 359 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 HCAR2Q8TDS4 363 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 TRPC4APQ8TEL6 797 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 ASCL2Q99929 193 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 C2orf42Q9NWW7 574 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 MMP24Q9Y5R2 645 aa4.76□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 PSMD14O00487 310 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 BMP10O95393 424 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 IGLV1-44P01699 117 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 NR3C1P04150 777 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 LIPFP07098 398 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 CD48P09326 243 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 ACADLP28330 430 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 PIK3CAP42336 1068 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 DRG2P55039 364 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 TPRG1Q6ZUI0 275 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 CCDC190Q86UF4 302 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 NAXEQ8NCW5 288 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 WDR20Q8TBZ3 569 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 KCNG4Q8TDN1 519 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 SLX1AQ9BQ83 275 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 DUXAA6NLW8 204 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 PLPP2O43688 288 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 KRT19P08727 400 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 SELLP14151 372 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 TAF6P49848 677 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 MVPQ14764 893 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 TSTQ16762 297 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 SMPDL3BQ92485 455 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 PPM1MQ96MI6 270 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 GFI1Q99684 422 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 SLC38A7Q9NVC3 462 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 MTMR6Q9Y217 621 aa4.74□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 OR2M5A3KFT3 312 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 NPHP1O15259 732 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 ZBTB43O43298 467 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 TMCC2O75069 709 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 ZNF217O75362 1048 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 DDX58O95786 925 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 KRT5P13647 590 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 GALCP54803 685 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 KIAA1644Q3SXP7 199 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 NCEH1Q6PIU2 408 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 CPLX4Q7Z7G2 160 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 PTOV1Q86YD1 416 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 C7orf26Q96N11 449 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 RAD21L1Q9H4I0 556 aa4.73□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 J3QR06 171 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 CLIC2O15247 247 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 ACTN1P12814 892 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 TMEM11P17152 192 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 GNAZP19086 355 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 MSH2P43246 934 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 CD81P60033 236 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 ITGA9Q13797 1035 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 PCGF3Q3KNV8 242 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 TMTC3Q6ZXV5 915 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 ZNF534Q76KX8 674 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 CEP97Q8IW35 865 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 GSDMBQ8TAX9 411 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 NUDCD1Q96RS6 583 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 PSD2Q9BQI7 771 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 SLC26A6Q9BXS9 759 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 SMC4Q9NTJ3 1288 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 NOTCH3Q9UM47 2321 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 FLT1P17948 1338 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-221ENST00000514231 DISP3Q9P2K9 1392 aa4.71□□□□□ -1.66
PDE4D-221ENST00000514231 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
PDE4D-221ENST00000514231 A6NL46 340 aa4.71□□□□□ -1.66
PDE4D-221ENST00000514231 H3BQ06 376 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
PDE4D-221ENST00000514231 GPC4O75487 556 aa4.71□□□□□ -1.66
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