RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484846.1

EHD1-209, Transcript of EH domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene EHD1, Length 3,469 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD1-209ENST00000484846 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa13.05□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 SLC7A4O43246 635 aa13.04□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 LDB2O43679 373 aa13.04□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 SELPP16109 830 aa13.04□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 KCNQ1P51787 676 aa13.04□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 NUP107P57740 925 aa13.04□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 ITGADQ13349 1161 aa13.04□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 KIAA1841Q6NSI8 718 aa13.04□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 DBF4BQ8NFT6 615 aa13.04□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 ANKRD60Q9BZ19 345 aa13.04□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 ASB1Q9Y576 335 aa13.04□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 C1RP00736 705 aa13.04□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 NAT2P11245 290 aa13.04□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 OXCT1P55809 520 aa13.04□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 LCP2Q13094 533 aa13.04□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 XKR4Q5GH76 650 aa13.04□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 ANKRD34AQ69YU3 496 aa13.04□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 TBPL2Q6SJ96 375 aa13.04□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 TMEM126BQ8IUX1 230 aa13.04□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 SMYD1Q8NB12 490 aa13.04□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 MYEOVQ96EZ4 313 aa13.04□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 LINGO1Q96FE5 620 aa13.04□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 ITCHQ96J02 903 aa13.04□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 SLC30A3Q99726 388 aa13.04□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 SMURF2Q9HAU4 748 aa13.04□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 TBC1D23Q9NUY8 699 aa13.04□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 AASSQ9UDR5 926 aa13.04□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa13.04□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 WDR37Q9Y2I8 494 aa13.04□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 KNL1Q8NG31 2342 aa13.04□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 B4GALT3O60512 393 aa13.04□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 SLC2A4P14672 509 aa13.04□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 GDF5P43026 501 aa13.04□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 RPS24P62847 133 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 CTBSQ01459 385 aa13.04□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP13.04□□□□□ -0.324e-7■■■□□ 16.6
EHD1-209ENST00000484846 SPESP1Q6UW49 350 aa13.04□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 CCDC81Q6ZN84 652 aa13.04□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa13.04□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 TRMOQ9BU70 441 aa13.04□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 OSBPL6Q9BZF3 934 aa13.04□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 SMOC2Q9H3U7 446 aa13.04□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa13.04□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 FXYD1O00168 92 aa13.03□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 GSNP06396 782 aa13.03□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 IDO1P14902 403 aa13.03□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 UGT1A1P22309 533 aa13.03□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 UGT1A4P22310 534 aa13.03□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 UGT1A3P35503 534 aa13.03□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 UGT1A5P35504 534 aa13.03□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 C21orf59P57076 290 aa13.03□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 PYCR3Q53H96 274 aa13.03□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 NANOGP8Q6NSW7 305 aa13.03□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 SYVN1Q86TM6 617 aa13.03□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 ADGRG5Q8IZF4 528 aa13.03□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 TRPV3Q8NET8 790 aa13.03□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 ITFG1Q8TB96 612 aa13.03□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 ROPN1LQ96C74 230 aa13.03□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 BIRC7Q96CA5 298 aa13.03□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa13.03□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 MFSD1Q9H3U5 465 aa13.03□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 CCSER2Q9H7U1 834 aa13.03□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 NANOGQ9H9S0 305 aa13.03□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 SH3GLB1Q9Y371 365 aa13.03□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 SPO11Q9Y5K1 396 aa13.03□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 TMEM247A6NEH6 219 aa13.03□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 CYP4B1P13584 511 aa13.03□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 MTHFD2P13995 350 aa13.03□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 DGCR6Q14129 220 aa13.03□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 PERM1Q5SV97 790 aa13.03□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 SNX29P2Q8IUI4 249 aa13.03□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 TNIP2Q8NFZ5 429 aa13.03□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 SEPT8Q92599 483 aa13.03□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 CEP295NLQ96MC4 621 aa13.03□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 FKBPLQ9UIM3 349 aa13.03□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 H0Y626 953 aa13.03□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 SH3BGRLO75368 114 aa13.03□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 TRIM16O95361 564 aa13.03□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 CTPS1P17812 591 aa13.03□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 HMOX2P30519 316 aa13.03□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 RPL9P32969 192 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 HTR6P50406 440 aa13.03□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 TMTC4Q5T4D3 741 aa13.03□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 GPSM1Q86YR5 675 aa13.03□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 KIAA2013Q8IYS2 634 aa13.03□□□□□ -0.32
EHD1-209ENST00000484846 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.4 ms