RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 KIR2DS3K7RE56 304 aa20.6■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 TAF4O00268 1085 aa20.6■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 FANCGO15287 622 aa20.6■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 PHF2O75151 1096 aa20.6■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 SLC2A4P14672 509 aa20.6■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 IDSP22304 550 aa20.6■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 MAGEA6P43360 314 aa20.6■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 VPS41P49754 854 aa20.6■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 CACNG1Q06432 222 aa20.6■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 DMPKQ09013 629 aa20.6■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 BIRC2Q13490 618 aa20.6■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 LAMB3Q13751 1172 aa20.6■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 KCNJ11Q14654 390 aa20.6■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 KIR2DS5Q14953 304 aa20.6■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 ST3GAL2Q16842 350 aa20.6■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 FNBP1LQ5T0N5 605 aa20.6■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa20.6■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 WASH2PQ6VEQ5 465 aa20.6■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa20.6■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa20.6■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 AMZ2Q86W34 360 aa20.6■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 PIANPQ8IYJ0 282 aa20.6■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 COPS8Q99627 209 aa20.6■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 WASH6PQ9NQA3 447 aa20.6■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa20.6■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa20.6■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 FRYQ5TBA9 3013 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 CCDC162PA2VCL2 907 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 OR51F1A6NGY5 319 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 PDZK1P1A8MUH7 402 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 BRAFP15056 766 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 VCLP18206 1134 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 ACRV1P26436 265 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 RPL10P27635 214 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 CD1CP29017 333 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 FNTAP49354 379 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 TERF1P54274 439 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 CDK16Q00536 496 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 HHEXQ03014 270 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 ACVR1Q04771 509 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 AMZ1Q400G9 498 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 BCL7AQ4VC05 210 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 PCID2Q5JVF3 399 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 AGAP9Q5VTM2 703 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 LRRC8BQ6P9F7 803 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 TAS2R42Q7RTR8 314 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 SLC9B2Q86UD5 537 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 SERPINA9Q86WD7 417 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 HEXDCQ8WVB3 486 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 HDAC10Q969S8 669 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 NXPE2Q96DL1 559 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 DCUN1D1Q96GG9 259 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 CHRAC1Q9NRG0 131 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 CPNE7Q9UBL6 633 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 WDR37Q9Y2I8 494 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 AK5Q9Y6K8 562 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 EPG5Q9HCE0 2579 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa20.58■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa20.58■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 AP3B1O00203 1094 aa20.58■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 ZW10O43264 779 aa20.58■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 RALBP11234 206 aa20.58■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 FOXN2P32314 431 aa20.58■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 NPY2RP49146 381 aa20.58■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 DRG2P55039 364 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 SQSTM1Q13501 440 aa20.58■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 DBN1Q16643 649 aa20.58■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 ANKRD22Q5VYY1 191 aa20.58■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 XKR5Q6UX68 686 aa20.58■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 USP53Q70EK8 1073 aa20.58■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 NLRP9Q7RTR0 991 aa20.58■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 PROSER1Q86XN7 944 aa20.58■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 CREG2Q8IUH2 290 aa20.58■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 CPT1BQ92523 772 aa20.58■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 PEX13Q92968 403 aa20.58■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 KCNK4Q9NYG8 393 aa20.58■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 BFARQ9NZS9 450 aa20.58■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 MGAT4DA6NG13 374 aa20.57■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 CFAP99D6REC4 459 aa20.57■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 CPNE6O95741 557 aa20.57■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 APC2O95996 2303 aa20.57■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 GOT2P00505 430 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 MPOP05164 745 aa20.57■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 SLC19A1P41440 591 aa20.57■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 LSSP48449 732 aa20.57■□□□□ 0.88
ACTB-211ENST00000480301 INHBCP55103 352 aa20.57■□□□□ 0.88
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