RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477334.1

RBM39-231, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 949 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-231	ENST00000477334	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RBM39-231	ENST00000477334	RUNX1T1	Q06455	604 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBM39-231	ENST00000477334	STK4	Q13043	487 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBM39-231	ENST00000477334	KRT33B	Q14525	404 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBM39-231	ENST00000477334	TOMM20	Q15388	145 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBM39-231	ENST00000477334	ZDHHC20	Q5W0Z9	365 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBM39-231	ENST00000477334	FAM171B	Q6P995	826 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF704	Q6ZNC4	412 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RBM39-231	ENST00000477334	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBM39-231	ENST00000477334	DSG4	Q86SJ6	1040 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBM39-231	ENST00000477334	KBTBD6	Q86V97	674 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBM39-231	ENST00000477334	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBM39-231	ENST00000477334	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBM39-231	ENST00000477334	LINC00346	Q8IVM7	164 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBM39-231	ENST00000477334	NAGS	Q8N159	534 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBM39-231	ENST00000477334	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBM39-231	ENST00000477334	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBM39-231	ENST00000477334	CD101	Q93033	1021 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBM39-231	ENST00000477334	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBM39-231	ENST00000477334	FEM1C	Q96JP0	617 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBM39-231	ENST00000477334	NEURL2	Q9BR09	285 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBM39-231	ENST00000477334	HGH1	Q9BTY7	390 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBM39-231	ENST00000477334	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF556	Q9HAH1	456 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBM39-231	ENST00000477334	PDE7B	Q9NP56	450 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBM39-231	ENST00000477334	KLHL1	Q9NR64	748 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBM39-231	ENST00000477334	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBM39-231	ENST00000477334	DONSON	Q9NYP3	566 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBM39-231	ENST00000477334	TAS2R14	Q9NYV8	317 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBM39-231	ENST00000477334	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBM39-231	ENST00000477334	RPS6KA6	Q9UK32	745 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBM39-231	ENST00000477334	PLAGL1	Q9UM63	463 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBM39-231	ENST00000477334	TMEM184B	Q9Y519	407 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RBM39-231	ENST00000477334	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RBM39-231	ENST00000477334	SCN5A	Q14524	2016 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-231	ENST00000477334	ZCWPW2	A0A1B0GU75	182 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-231	ENST00000477334	PLK4	O00444	970 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-231	ENST00000477334	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-231	ENST00000477334	WISP2	O76076	250 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-231	ENST00000477334	SAT1	P21673	171 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-231	ENST00000477334	NR2F2	P24468	414 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-231	ENST00000477334	CTSC	P53634	463 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-231	ENST00000477334	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-231	ENST00000477334	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	4.09	□□□□□ -1.75	1e-8	■■■■□ 21.2
RBM39-231	ENST00000477334	IGSF11	Q5DX21	431 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-231	ENST00000477334	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-231	ENST00000477334	WBP2NL	Q6ICG8	309 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-231	ENST00000477334		Q75L30	129 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF534	Q76KX8	674 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-231	ENST00000477334	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-231	ENST00000477334	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-231	ENST00000477334	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-231	ENST00000477334	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-231	ENST00000477334	C1orf52	Q8N6N3	182 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-231	ENST00000477334	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-231	ENST00000477334	OR52I2	Q8NH67	350 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-231	ENST00000477334	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-231	ENST00000477334	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-231	ENST00000477334	TMEM255B	Q8WV15	326 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-231	ENST00000477334	PHF21A	Q96BD5	680 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-231	ENST00000477334	LINGO1	Q96FE5	620 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-231	ENST00000477334	OXNAD1	Q96HP4	312 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-231	ENST00000477334	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-231	ENST00000477334	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-231	ENST00000477334	WSB2	Q9NYS7	404 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-231	ENST00000477334	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-231	ENST00000477334	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-231	ENST00000477334	DLGAP4	Q9Y2H0	992 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-231	ENST00000477334	SNX8	Q9Y5X2	465 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RBM39-231	ENST00000477334	LNP1	A1A4G5	178 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-231	ENST00000477334	C16orf97	H3BN30	126 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-231	ENST00000477334	PGM3	O95394	542 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-231	ENST00000477334	STARD3NL	O95772	234 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-231	ENST00000477334	KRT19	P08727	400 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-231	ENST00000477334	PRLR	P16471	622 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-231	ENST00000477334	PNLIPRP2	P54317	469 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-231	ENST00000477334	TROAP	Q12815	778 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-231	ENST00000477334	PCLAF	Q15004	111 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-231	ENST00000477334	NTRK2	Q16620	822 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-231	ENST00000477334	FAM98B	Q52LJ0	330 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-231	ENST00000477334	FAM76B	Q5HYJ3	339 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-231	ENST00000477334	CFAP58	Q5T655	872 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-231	ENST00000477334	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-231	ENST00000477334	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-231	ENST00000477334	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-231	ENST00000477334	BRINP3	Q76B58	766 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-231	ENST00000477334	MCEMP1	Q8IX19	187 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-231	ENST00000477334	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-231	ENST00000477334	SLC22A18	Q96BI1	424 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-231	ENST00000477334	DACH2	Q96NX9	599 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-231	ENST00000477334	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-231	ENST00000477334	TEX12	Q9BXU0	123 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-231	ENST00000477334	RTN4R	Q9BZR6	473 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-231	ENST00000477334	OSGEPL1	Q9H4B0	414 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-231	ENST00000477334	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-231	ENST00000477334	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBM39-231	ENST00000477334	MRPL15	Q9P015	296 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76

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