RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475571.1

BBS5-206, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 5, human

TSL 4

Gene BBS5, Length 566 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS5-206	ENST00000475571		A0A1B0GU03	582 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	DUXA	A6NLW8	204 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	PSMD14	O00487	310 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	ZBTB43	O43298	467 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	IGLV1-44	P01699	117 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	EIF2S1	P05198	315 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	LIPF	P07098	398 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	MSH3	P20585	1137 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	PSMA4	P25789	261 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	KRT9	P35527	623 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	GALC	P54803	685 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	NDUFAF5	Q5TEU4	345 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	NAXE	Q8NCW5	288 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	TRIM58	Q8NG06	486 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	WDR20	Q8TBZ3	569 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	PERP	Q96FX8	193 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	RAD21L1	Q9H4I0	556 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	INTS10	Q9NVR2	710 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	MTMR6	Q9Y217	621 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	SCAMP1	O15126	338 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	TMCC2	O75069	709 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	GPC4	O75487	556 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	TMEM63A	O94886	807 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	TBX6	O95947	436 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	TMEM11	P17152	192 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	NFKBIA	P25963	317 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	TAF6	P49848	677 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	CD81	P60033	236 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	RAB6C	Q53S08	254 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	LCE1F	Q5T754	118 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	ACSM2B	Q68CK6	577 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	TMTC2	Q8N394	836 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	PCYOX1L	Q8NBM8	494 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	MOAP1	Q96BY2	351 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	RAB6C	Q9H0N0	254 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	WISP2	O76076	250 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	TSHB	P01222	138 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	ACTN1	P12814	892 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	GNB3	P16520	340 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	HRH2	P25021	359 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	KRTAP10-12	P60413	245 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	MMS22L	Q6ZRQ5	1243 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	TSPAN33	Q86UF1	283 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	SMPDL3B	Q92485	455 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	PSD2	Q9BQI7	771 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS5-206	ENST00000475571	PLPP2	O43688	288 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS5-206	ENST00000475571	SYNCRIP	O60506	623 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BBS5-206	ENST00000475571	KRT5	P13647	590 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS5-206	ENST00000475571	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BBS5-206	ENST00000475571	MSH2	P43246	934 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS5-206	ENST00000475571	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
BBS5-206	ENST00000475571	ITGA9	Q13797	1035 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS5-206	ENST00000475571	MED22	Q15528	200 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS5-206	ENST00000475571	ALF	Q53S48	1182 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS5-206	ENST00000475571	GORAB	Q5T7V8	394 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS5-206	ENST00000475571	ZDHHC20	Q5W0Z9	365 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS5-206	ENST00000475571	ZNF790	Q6PG37	636 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS5-206	ENST00000475571	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS5-206	ENST00000475571	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BBS5-206	ENST00000475571	PTOV1	Q86YD1	416 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS5-206	ENST00000475571	PDILT	Q8N807	584 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS5-206	ENST00000475571	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
BBS5-206	ENST00000475571	C1orf74	Q96LT6	269 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS5-206	ENST00000475571	PPM1M	Q96MI6	270 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS5-206	ENST00000475571	C2orf42	Q9NWW7	574 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS5-206	ENST00000475571	B3GALT5	Q9Y2C3	310 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS5-206	ENST00000475571		A6NL46	340 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS5-206	ENST00000475571	NR5A2	O00482	541 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS5-206	ENST00000475571	OGG1	O15527	345 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS5-206	ENST00000475571	ZNF217	O75362	1048 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS5-206	ENST00000475571	PLA2G4B	P0C869	781 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS5-206	ENST00000475571	MMP15	P51511	669 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS5-206	ENST00000475571	GPR143	P51810	404 aa		4.95	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms