RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 FIBCD1Q8N539 461 aa20.24■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 GOLM1Q8NBJ4 401 aa20.24■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 PDZD8Q8NEN9 1154 aa20.24■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 TRPV3Q8NET8 790 aa20.24■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 HBEGFQ99075 208 aa20.24■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 THEGQ9P2T0 379 aa20.24■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 CEPT1Q9Y6K0 416 aa20.24■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 THSD7BQ9C0I4 1608 aa20.24■□□□□ 0.83
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IMP4-208ENST00000460766 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 IL12AP29459 219 aa20.24■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 PTGER3P43115 390 aa20.24■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 CLCN4P51793 760 aa20.24■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 CDH15P55291 814 aa20.24■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 ERVPABLB-1P60509 514 aa20.24■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 SPATS1Q496A3 300 aa20.24■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 ADGRF1Q5T601 910 aa20.24■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 TTC30BQ8N4P2 665 aa20.24■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 TMIGD2Q96BF3 282 aa20.24■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 C9orf16Q9BUW7 83 aa20.24■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 PKP3Q9Y446 797 aa20.24■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa20.24■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 DLGAP1O14490 977 aa20.23■□□□□ 0.83
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IMP4-208ENST00000460766 ASLP04424 464 aa20.23■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 CCT8P50990 548 aa20.23■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 LETMD1Q6P1Q0 360 aa20.23■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 CHST9Q7L1S5 443 aa20.23■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 MFSD2AQ8NA29 543 aa20.23■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 WBP2Q969T9 261 aa20.23■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 ZNF382Q96SR6 550 aa20.23■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 ADI1Q9BV57 179 aa20.23■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 USP22Q9UPT9 525 aa20.23■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 V9GYQ6 96 aa20.23■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 CD160O95971 181 aa20.23■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 TUFMP49411 452 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 NANOGP8Q6NSW7 305 aa20.23■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 ZNF786Q8N393 782 aa20.23■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 METTL6Q8TCB7 284 aa20.23■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 PROKR1Q8TCW9 393 aa20.23■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 RNF38Q9H0F5 515 aa20.23■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 NANOGQ9H9S0 305 aa20.23■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 TMCO1Q9UM00 188 aa20.23■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 SLC8A2Q9UPR5 921 aa20.23■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 FAM234BA2RU67 622 aa20.22■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 CAPN1P07384 714 aa20.22■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 CD9P21926 228 aa20.22■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 PCSK6P29122 969 aa20.22■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 SLC5A2P31639 672 aa20.22■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 CLCN7P51798 805 aa20.22■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 MERTKQ12866 999 aa20.22■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 SLC2A7Q6PXP3 512 aa20.22■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 IL27RAQ6UWB1 636 aa20.22■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 Q6ZSR9 355 aa20.22■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 CARNMT1Q8N4J0 409 aa20.22■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 GPR63Q9BZJ6 419 aa20.22■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 MUC13Q9H3R2 512 aa20.22■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 SMPD4Q9NXE4 827 aa20.22■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa20.22■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 ZIM2Q9NZV7 527 aa20.22■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa20.22■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 H0Y626 953 aa20.22■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 MT-ND1P03886 318 aa20.22■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 FCGR1AP12314 374 aa20.22■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 CTPS1P17812 591 aa20.22■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 ATP6AP1Q15904 470 aa20.22■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 NCEH1Q6PIU2 408 aa20.22■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 HM13Q8TCT9 377 aa20.22■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 CYGBQ8WWM9 190 aa20.22■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 CWH43Q9H720 699 aa20.22■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 NUDT4Q9NZJ9 180 aa20.22■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 ANAPC2Q9UJX6 822 aa20.22■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 TCRBV5S2A0A599 114 aa20.21■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 C2orf78A6NCI8 922 aa20.21■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 H7C0S8 307 aa20.21■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 KATNA1O75449 491 aa20.21■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 PRAMEF12O95522 483 aa20.21■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 HTR6P50406 440 aa20.21■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 PRKG2Q13237 762 aa20.21■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 GPNMBQ14956 572 aa20.21■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 TAF12Q16514 161 aa20.21■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 NPAS4Q8IUM7 802 aa20.21■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 SFRP1Q8N474 314 aa20.21■□□□□ 0.83
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