RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455609.1

C9orf41-AS1-201, C9orf41 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf41-AS1, Length 719 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PRORYQ9H606 182 aa15.32■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LRRC40Q9H9A6 602 aa15.32■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LZTFL1Q9NQ48 299 aa15.32■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LOC400499M0QZD8 3231 aa15.31■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PDZK1P1A8MUH7 402 aa15.31■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HGSO14964 777 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LIASO43766 372 aa15.31■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SRP72O76094 671 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 BRAFP15056 766 aa15.31■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 VCLP18206 1134 aa15.31■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IDSP22304 550 aa15.31■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RPL10P27635 214 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 AKT1P31749 480 aa15.31■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MAPK9P45984 424 aa15.31■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MAPK10P53779 464 aa15.31■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DRG2P55039 364 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TMPRSS15P98073 1019 aa15.31■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 XIAPP98170 497 aa15.31■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PDE1BQ01064 536 aa15.31■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP15.31■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 OASLQ15646 514 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 BROXQ5VW32 411 aa15.31■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TMEM71Q6P5X7 295 aa15.31■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF662Q6ZS27 426 aa15.31■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 AVL9Q8NBF6 648 aa15.31■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C1orf54Q8WWF1 131 aa15.31■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ALS2CR12Q96Q35 445 aa15.31■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa15.31■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ASB8Q9H765 288 aa15.31■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IGSF10Q6WRI0 2623 aa15.31■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 UNC79Q9P2D8 2635 aa15.31■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LILRA5A6NI73 299 aa15.3■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 OR2AG2A6NM03 316 aa15.3■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CCL22O00626 93 aa15.3■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NVLO15381 856 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LDB2O43679 373 aa15.3■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 POP7O75817 140 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 AP2A1O95782 977 aa15.3■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CCL4P13236 92 aa15.3■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MSH3P20585 1137 aa15.3■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLC19A1P41440 591 aa15.3■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 EPHA4P54764 986 aa15.3■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CXADRP78310 365 aa15.3■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CLN3Q13286 438 aa15.3■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 AGAP9Q5VTM2 703 aa15.3■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TMEM220Q6QAJ8 160 aa15.3■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa15.3■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 WASH2PQ6VEQ5 465 aa15.3■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DET1Q7L5Y6 550 aa15.3■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 AMZ2Q86W34 360 aa15.3■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TRIM48Q8IWZ4 208 aa15.3■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NAT14Q8WUY8 206 aa15.3■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NCSTNQ92542 709 aa15.3■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 USP7Q93009 1102 aa15.3■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 WASH6PQ9NQA3 447 aa15.3■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PDP2Q9P2J9 529 aa15.3■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa15.3■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa15.29■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 OR52A4PA6NMU1 304 aa15.29■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C9orf172C9J069 976 aa15.29■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PRAMEF10O60809 474 aa15.29■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KCNJ13O60928 360 aa15.29■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 VIPP01282 170 aa15.29■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TPH1P17752 444 aa15.29■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 STIP1P31948 543 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HADHAP40939 763 aa15.29■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TMPRSS3P57727 454 aa15.29■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DMPKQ09013 629 aa15.29■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LONRF2Q1L5Z9 754 aa15.29■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SNAP47Q5SQN1 464 aa15.29■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FNBP1LQ5T0N5 605 aa15.29■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TMEM26Q6ZUK4 368 aa15.29■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MICALCLQ6ZW33 695 aa15.29■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 AGBL5Q8NDL9 886 aa15.29■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SGF29Q96ES7 293 aa15.29■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C19orf43Q9BQ61 176 aa15.29■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 UCK1Q9HA47 277 aa15.29■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CPNE5Q9HCH3 593 aa15.29■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 POT1Q9NUX5 634 aa15.29■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FOXJ2Q9P0K8 574 aa15.29■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CRLS1Q9UJA2 301 aa15.29■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ACSL6Q9UKU0 697 aa15.29■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF148Q9UQR1 794 aa15.29■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 WDR37Q9Y2I8 494 aa15.29■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SSUH2Q9Y2M2 353 aa15.29■□□□□ 0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 AGAP14A8MT82 685 aa15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms