RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ADGRE1Q14246 886 aa18.48■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM126BQ8IUX1 230 aa18.48■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CLDN19Q8N6F1 224 aa18.48■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KLHL23Q8NBE8 558 aa18.48■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa18.48■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC22A17Q8WUG5 538 aa18.48■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C17orf80Q9BSJ5 609 aa18.48■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BEGAINQ9BUH8 593 aa18.48■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GPR45Q9Y5Y3 372 aa18.48■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRSS21Q9Y6M0 314 aa18.48■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DOCK6Q96HP0 2047 aa18.48■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A8MX80 341 aa18.48■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR4F21O95013 312 aa18.48■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ITGB6P18564 788 aa18.48■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UGT1A6P19224 532 aa18.48■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UGT1A1P22309 533 aa18.48■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UGT1A4P22310 534 aa18.48■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UGT1A3P35503 534 aa18.48■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UGT1A5P35504 534 aa18.48■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCR2P41597 374 aa18.48■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DIO3P55073 304 aa18.48■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 VPS26BQ4G0F5 336 aa18.48■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SPATA19Q7Z5L4 167 aa18.48■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TSPAN33Q86UF1 283 aa18.48■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LILRA2Q8N149 483 aa18.48■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR52B6Q8NGF0 335 aa18.48■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LRGUKQ96M69 825 aa18.48■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LYSMD1Q96S90 227 aa18.48■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ACOX2Q99424 681 aa18.48■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C11orf49Q9H6J7 331 aa18.48■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa18.48■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAP10Q9P2G4 905 aa18.48■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SCOCQ9UIL1 159 aa18.48■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CRLS1Q9UJA2 301 aa18.48■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCL26Q9Y258 94 aa18.48■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NDUFAF1Q9Y375 327 aa18.48■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa18.47■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KIAA0355O15063 1070 aa18.47■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ANGPT2O15123 496 aa18.47■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCL16O15467 120 aa18.47■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UQCRBP14927 111 aa18.47■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PFKLP17858 780 aa18.47■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SPAM1P38567 509 aa18.47■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC7A2P52569 658 aa18.47■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RPS6KA2Q15349 733 aa18.47■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP18.47■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CHRNA6Q15825 494 aa18.47■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa18.47■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GRAMD4Q6IC98 578 aa18.47■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM199Q8N511 208 aa18.47■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa18.47■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa18.47■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HS3ST2Q9Y278 367 aa18.47■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DTNAQ9Y4J8 743 aa18.47■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C9JVG2 144 aa18.46■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C8BP07358 591 aa18.46■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FUT11Q495W5 492 aa18.46■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GPR33Q49SQ1 333 aa18.46■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR52E8Q6IFG1 317 aa18.46■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C22orf39Q6P5X5 142 aa18.46■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CDYL2Q8N8U2 506 aa18.46■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR2T11Q8NH01 316 aa18.46■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PFDN4Q9NQP4 134 aa18.46■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AIG1Q9NVV5 245 aa18.46■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MYOFQ9NZM1 2061 aa18.46■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FFAR2O15552 330 aa18.46■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRIM16O95361 564 aa18.46■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RGS4P49798 205 aa18.46■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ERVPABLB-1P60509 514 aa18.46■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MYLK3Q32MK0 819 aa18.46■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C6orf10Q5SRN2 563 aa18.46■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LETMD1Q6P1Q0 360 aa18.46■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa18.46■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CRTC1Q6UUV9 634 aa18.46■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SCIMPQ6UWF3 145 aa18.46■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MYO1HQ8N1T3 1032 aa18.46■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NXPE1Q8N323 547 aa18.46■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PDPRQ8NCN5 879 aa18.46■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RIN3Q8TB24 985 aa18.46■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ECHDC3Q96DC8 303 aa18.46■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LRCH3Q96II8 777 aa18.46■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CDK15Q96Q40 435 aa18.46■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HTATIP2Q9BUP3 242 aa18.46■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC52A3Q9NQ40 469 aa18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms