RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323374.8

SPHK1-201, Transcript of sphingosine kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPHK1, Length 2,138 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1-201ENST00000323374 SPATA24Q86W54 205 aa21.47■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 TMEM126BQ8IUX1 230 aa21.47■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 MYO1HQ8N1T3 1032 aa21.47■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 CCT7Q99832 543 aa21.47■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 TCF25Q9BQ70 676 aa21.47■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 C17orf80Q9BSJ5 609 aa21.47■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 IL23AQ9NPF7 189 aa21.47■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 TMEM181Q9P2C4 612 aa21.47■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 PRSS21Q9Y6M0 314 aa21.47■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 A8MX80 341 aa21.47■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 GRM6O15303 877 aa21.47■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 ITGB6P18564 788 aa21.47■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 CCR2P41597 374 aa21.47■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 PTPN5P54829 565 aa21.47■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP21.47■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 XKR7Q5GH72 579 aa21.47■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 C22orf39Q6P5X5 142 aa21.47■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 LRGUKQ96M69 825 aa21.47■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 CCL26Q9Y258 94 aa21.47■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 MAGEA13PA6NCF6 341 aa21.46■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 A6NHS1 94 aa21.46■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 ANGPT2O15123 496 aa21.46■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 RAD51BO15315 384 aa21.46■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 TRIM16O95361 564 aa21.46■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 DGKAP23743 735 aa21.46■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 GRAMD1BQ3KR37 738 aa21.46■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 FUT11Q495W5 492 aa21.46■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 CRTC1Q6UUV9 634 aa21.46■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 TPRG1Q6ZUI0 275 aa21.46■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 TSPAN33Q86UF1 283 aa21.46■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 CLDN19Q8N6F1 224 aa21.46■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 GATA6Q92908 595 aa21.46■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 SCRN2Q96FV2 425 aa21.46■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 HTATIP2Q9BUP3 242 aa21.46■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 VCXQ9H320 206 aa21.46■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 EBF3Q9H4W6 596 aa21.46■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 SUV39H2Q9H5I1 410 aa21.46■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa21.46■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 CD300AQ9UGN4 299 aa21.46■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 SLC25A13Q9UJS0 675 aa21.46■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 PRORSD1PA6NEY8 169 aa21.46■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 FFAR2O15552 330 aa21.46■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 BNIP3LO60238 219 aa21.46■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 OR4F21O95013 312 aa21.46■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 RALGDSQ12967 914 aa21.46■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 GRIK2Q13002 908 aa21.46■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 VPS26BQ4G0F5 336 aa21.46■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 MACC1Q6ZN28 852 aa21.46■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 USP45Q70EL2 814 aa21.46■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 RETREG3Q86VR2 466 aa21.46■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa21.46■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 NAT14Q8WUY8 206 aa21.46■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 MIEF2Q96C03 454 aa21.46■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 ECHDC3Q96DC8 303 aa21.46■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 KLHL32Q96NJ5 620 aa21.46■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 RIC8BQ9NVN3 520 aa21.46■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 SCOCQ9UIL1 159 aa21.46■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 GPR45Q9Y5Y3 372 aa21.46■■□□□ 1.03
SPHK1-201ENST00000323374 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
SPHK1-201ENST00000323374 AQP4P55087 323 aa21.45■■□□□ 1.02
SPHK1-201ENST00000323374 ADGRE1Q14246 886 aa21.45■■□□□ 1.02
SPHK1-201ENST00000323374 TMEM25Q86YD3 366 aa21.45■■□□□ 1.02
SPHK1-201ENST00000323374 NXPE1Q8N323 547 aa21.45■■□□□ 1.02
SPHK1-201ENST00000323374 CDYL2Q8N8U2 506 aa21.45■■□□□ 1.02
SPHK1-201ENST00000323374 PDPRQ8NCN5 879 aa21.45■■□□□ 1.02
SPHK1-201ENST00000323374 OR52B6Q8NGF0 335 aa21.45■■□□□ 1.02
SPHK1-201ENST00000323374 RIN3Q8TB24 985 aa21.45■■□□□ 1.02
SPHK1-201ENST00000323374 VOPP1Q96AW1 172 aa21.45■■□□□ 1.02
SPHK1-201ENST00000323374 ASIC4Q96FT7 647 aa21.45■■□□□ 1.02
SPHK1-201ENST00000323374 ACOX2Q99424 681 aa21.45■■□□□ 1.02
SPHK1-201ENST00000323374 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
SPHK1-201ENST00000323374 PCDHAC1Q9H158 963 aa21.45■■□□□ 1.02
SPHK1-201ENST00000323374 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
SPHK1-201ENST00000323374 PPIL1Q9Y3C6 166 aa21.45■■□□□ 1.02
SPHK1-201ENST00000323374 INSL6Q9Y581 213 aa21.45■■□□□ 1.02
SPHK1-201ENST00000323374 IRAK3Q9Y616 596 aa21.45■■□□□ 1.02
SPHK1-201ENST00000323374 CSPG5O95196 566 aa21.44■■□□□ 1.02
SPHK1-201ENST00000323374 CAPN3P20807 821 aa21.44■■□□□ 1.02
SPHK1-201ENST00000323374 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP21.44■■□□□ 1.022e-6■□□□□ 8.9
SPHK1-201ENST00000323374 SLC7A2P52569 658 aa21.44■■□□□ 1.02
SPHK1-201ENST00000323374 DIO3P55073 304 aa21.44■■□□□ 1.02
SPHK1-201ENST00000323374 ERVFC1P60507 584 aa21.44■■□□□ 1.02
SPHK1-201ENST00000323374 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
SPHK1-201ENST00000323374 PRMT9Q6P2P2 845 aa21.44■■□□□ 1.02
SPHK1-201ENST00000323374 ZBTB2Q8N680 514 aa21.44■■□□□ 1.02
SPHK1-201ENST00000323374 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
SPHK1-201ENST00000323374 CEP44Q9C0F1 390 aa21.44■■□□□ 1.02
SPHK1-201ENST00000323374 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
SPHK1-201ENST00000323374 AIG1Q9NVV5 245 aa21.44■■□□□ 1.02
SPHK1-201ENST00000323374 MAP10Q9P2G4 905 aa21.44■■□□□ 1.02
SPHK1-201ENST00000323374 DTNAQ9Y4J8 743 aa21.44■■□□□ 1.02
SPHK1-201ENST00000323374 OARD1Q9Y530 152 aa21.44■■□□□ 1.02
SPHK1-201ENST00000323374 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa21.44■■□□□ 1.02
SPHK1-201ENST00000323374 FGF19O95750 216 aa21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.5 ms