RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614197.4

NPIPB4-222, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family member B4, human

TSL 5 BASIC

Gene NPIPB4, Length 1,216 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPIPB4-222	ENST00000614197	THRA	P10827	490 aa		10.81	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	RALB	P11234	206 aa		10.81	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	MPST	P25325	297 aa		10.81	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	RBL1	P28749	1068 aa		10.81	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	AKT1	P31749	480 aa		10.81	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	MARCKSL1	P49006	195 aa		10.81	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	VAV2	P52735	878 aa		10.81	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	SLC1A5	Q15758	541 aa		10.81	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		10.81	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	CHCHD2P9	Q5T1J5	151 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZNF648	Q5T619	568 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	KDELC1	Q6UW63	502 aa		10.81	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	FAM151B	Q6UXP7	276 aa		10.81	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	TMPRSS9	Q7Z410	1059 aa		10.81	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	IL22RA1	Q8N6P7	574 aa		10.81	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	ACTL9	Q8TC94	416 aa		10.81	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	ART4	Q93070	314 aa		10.81	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZPBP	Q9BS86	351 aa		10.81	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	FICD	Q9BVA6	458 aa		10.81	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	DDA1	Q9BW61	102 aa		10.81	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	RBSN	Q9H1K0	784 aa		10.81	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	GBA3	Q9H227	469 aa		10.81	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		10.81	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	TFR2	Q9UP52	801 aa		10.81	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		10.81	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		10.81	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	C5orf60	A6NFR6	353 aa		10.8	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	LILRA5	A6NI73	299 aa		10.8	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	MIF4GD	A9UHW6	222 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197		B4E171	279 aa		10.8	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	C9orf172	C9J069	976 aa		10.8	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	CHUK	O15111	745 aa		10.8	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	PJA2	O43164	708 aa		10.8	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	MTX2	O75431	263 aa		10.8	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	CCL4	P13236	92 aa		10.8	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	XRCC1	P18887	633 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	MSH3	P20585	1137 aa		10.8	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	LPO	P22079	712 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	ETV5	P41161	510 aa		10.8	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	TSPAN7	P41732	249 aa		10.8	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	CHRNA4	P43681	627 aa		10.8	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	CFHR1	Q03591	330 aa		10.8	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		10.8	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		10.8	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	KLHL35	Q6PF15	583 aa		10.8	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	CEACAM20	Q6UY09	585 aa		10.8	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		10.8	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	AMZ2	Q86W34	360 aa		10.8	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZFAND4	Q86XD8	727 aa		10.8	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	DTX3L	Q8TDB6	740 aa		10.8	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	SNRNP27	Q8WVK2	155 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	KIAA1143	Q96AT1	154 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	EID2B	Q96D98	161 aa		10.8	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	SGF29	Q96ES7	293 aa		10.8	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	DCUN1D1	Q96GG9	259 aa		10.8	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZNF514	Q96K75	400 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	MRGPRX2	Q96LB1	330 aa		10.8	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	ALS2CR12	Q96Q35	445 aa		10.8	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	UCK1	Q9HA47	277 aa		10.8	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	IL26	Q9NPH9	171 aa		10.8	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	POT1	Q9NUX5	634 aa		10.8	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		10.8	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	KLHL3	Q9UH77	587 aa		10.8	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	PCDHGA3	Q9Y5H0	932 aa		10.8	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZFYVE26	Q68DK2	2539 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	ASPM	Q8IZT6	3477 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	KLHL33	A6NCF5	533 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	CFAP99	D6REC4	459 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	AURKA	O14965	403 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	RASSF9	O75901	435 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	UBXN7	O94888	489 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	EML2	O95834	649 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	GAS8	O95995	478 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	PYGM	P11217	842 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	FECH	P22830	423 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	CSF2RB	P32927	897 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	PTPN7	P35236	360 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	HADHA	P40939	763 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	ADCY2	Q08462	1091 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	TGIF1	Q15583	401 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	CHRNA6	Q15825	494 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	ANKRD20A2	Q5SQ80	823 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	ANKRD20A1	Q5TYW2	823 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	ANKRD20A3	Q5VUR7	823 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	XKR5	Q6UX68	686 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NPIPB4-222	ENST00000614197	WASH2P	Q6VEQ5	465 aa		10.79	□□□□□ -0.68

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