RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550442.5

LETMD1-223, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 4

Gene LETMD1, Length 469 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-223	ENST00000550442	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		11.72	□□□□□ -0.53
LETMD1-223	ENST00000550442	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
LETMD1-223	ENST00000550442	ARL5A	Q9Y689	179 aa		11.72	□□□□□ -0.53
LETMD1-223	ENST00000550442	C15orf38-AP3S2	A0A0A6YYH1	394 aa		11.71	□□□□□ -0.53
LETMD1-223	ENST00000550442		H0Y3Z8	333 aa		11.71	□□□□□ -0.53
LETMD1-223	ENST00000550442	STK25	O00506	426 aa		11.71	□□□□□ -0.53
LETMD1-223	ENST00000550442	MUSK	O15146	869 aa		11.71	□□□□□ -0.53
LETMD1-223	ENST00000550442	HTRA2	O43464	458 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
LETMD1-223	ENST00000550442	NRP2	O60462	931 aa		11.71	□□□□□ -0.53
LETMD1-223	ENST00000550442	SNX2	O60749	519 aa		11.71	□□□□□ -0.53
LETMD1-223	ENST00000550442	TMCC1	O94876	653 aa		11.71	□□□□□ -0.53
LETMD1-223	ENST00000550442	ESRRB	O95718	433 aa		11.71	□□□□□ -0.53
LETMD1-223	ENST00000550442	PRL	P01236	227 aa		11.71	□□□□□ -0.53
LETMD1-223	ENST00000550442	KLKB1	P03952	638 aa		11.71	□□□□□ -0.53
LETMD1-223	ENST00000550442	GFAP	P14136	432 aa		11.71	□□□□□ -0.53
LETMD1-223	ENST00000550442	LBP	P18428	481 aa		11.71	□□□□□ -0.53
LETMD1-223	ENST00000550442	VASP	P50552	380 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
LETMD1-223	ENST00000550442	RHOA	P61586	193 aa		11.71	□□□□□ -0.53
LETMD1-223	ENST00000550442	RPS24	P62847	133 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
LETMD1-223	ENST00000550442	POLR2L	P62875	67 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
LETMD1-223	ENST00000550442	MAP7	Q14244	749 aa		11.71	□□□□□ -0.53
LETMD1-223	ENST00000550442	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
LETMD1-223	ENST00000550442	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
LETMD1-223	ENST00000550442	TTLL9	Q3SXZ7	439 aa		11.71	□□□□□ -0.53
LETMD1-223	ENST00000550442	UNC50	Q53HI1	259 aa		11.71	□□□□□ -0.53
LETMD1-223	ENST00000550442	KANK2	Q63ZY3	851 aa		11.71	□□□□□ -0.53
LETMD1-223	ENST00000550442	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		11.71	□□□□□ -0.53
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF549	Q6P9A3	640 aa		11.71	□□□□□ -0.53
LETMD1-223	ENST00000550442	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		11.71	□□□□□ -0.53
LETMD1-223	ENST00000550442	FKBP9P1	Q75LS8	142 aa		11.71	□□□□□ -0.53
LETMD1-223	ENST00000550442	ARPIN	Q7Z6K5	226 aa		11.71	□□□□□ -0.53
LETMD1-223	ENST00000550442	RBFA	Q8N0V3	343 aa		11.71	□□□□□ -0.53
LETMD1-223	ENST00000550442	FBXO39	Q8N4B4	442 aa		11.71	□□□□□ -0.53
LETMD1-223	ENST00000550442	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	11.71	□□□□□ -0.53
LETMD1-223	ENST00000550442	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		11.71	□□□□□ -0.53
LETMD1-223	ENST00000550442	HCAR2	Q8TDS4	363 aa		11.71	□□□□□ -0.53
LETMD1-223	ENST00000550442	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		11.71	□□□□□ -0.53
LETMD1-223	ENST00000550442	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF570	Q96NI8	536 aa		11.71	□□□□□ -0.53
LETMD1-223	ENST00000550442	NDN	Q99608	321 aa		11.71	□□□□□ -0.53
LETMD1-223	ENST00000550442	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		11.71	□□□□□ -0.53
LETMD1-223	ENST00000550442	CPEB1	Q9BZB8	566 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
LETMD1-223	ENST00000550442	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		11.71	□□□□□ -0.53
LETMD1-223	ENST00000550442	WDR55	Q9H6Y2	383 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
LETMD1-223	ENST00000550442	ATP13A3	Q9H7F0	1226 aa		11.71	□□□□□ -0.53
LETMD1-223	ENST00000550442	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		11.71	□□□□□ -0.53
LETMD1-223	ENST00000550442	ABCB8	Q9NUT2	735 aa		11.71	□□□□□ -0.53
LETMD1-223	ENST00000550442	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		11.71	□□□□□ -0.53
LETMD1-223	ENST00000550442	IL17C	Q9P0M4	197 aa		11.71	□□□□□ -0.53
LETMD1-223	ENST00000550442	DPP7	Q9UHL4	492 aa		11.71	□□□□□ -0.53
LETMD1-223	ENST00000550442	GNPTG	Q9UJJ9	305 aa		11.71	□□□□□ -0.53
LETMD1-223	ENST00000550442	RALY	Q9UKM9	306 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
LETMD1-223	ENST00000550442	CDV3	Q9UKY7	258 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
LETMD1-223	ENST00000550442	LZTS1	Q9Y250	596 aa		11.71	□□□□□ -0.53
LETMD1-223	ENST00000550442	CRYL1	Q9Y2S2	319 aa		11.71	□□□□□ -0.53
LETMD1-223	ENST00000550442	DHRS7	Q9Y394	339 aa		11.71	□□□□□ -0.53
LETMD1-223	ENST00000550442	PPIL1	Q9Y3C6	166 aa		11.71	□□□□□ -0.53
LETMD1-223	ENST00000550442	IRAK3	Q9Y616	596 aa		11.71	□□□□□ -0.53
LETMD1-223	ENST00000550442	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	FRYL	O94915	3013 aa		11.7	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	TRAV19	A0A0A6YYK7	116 aa		11.7	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	E2F8	A0AVK6	867 aa		11.7	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		11.7	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442		E5RI56	91 aa		11.7	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	AIM2	O14862	343 aa		11.7	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	KPNA5	O15131	536 aa		11.7	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	LILRB3	O75022	631 aa		11.7	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	PGLS	O95336	258 aa		11.7	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	SEC24A	O95486	1093 aa		11.7	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	IGSF6	O95976	241 aa		11.7	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	CAPNS1	P04632	268 aa		11.7	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	ADH1A	P07327	375 aa		11.7	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	ADRB1	P08588	477 aa		11.7	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	RPS17	P08708	135 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	CTSA	P10619	480 aa		11.7	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	PIM1	P11309	404 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	ITGAL	P20701	1170 aa		11.7	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	DGKA	P23743	735 aa		11.7	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	SERPINA4	P29622	427 aa		11.7	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	ABCG1	P45844	678 aa		11.7	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	MAPK9	P45984	424 aa		11.7	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	SNRPD1	P62314	119 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	ARF5	P84085	180 aa		11.7	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	CLC	Q05315	142 aa		11.7	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF33B	Q06732	778 aa		11.7	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	BCL2L1	Q07817	233 aa		11.7	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	DMWD	Q09019	674 aa		11.7	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	TWF1	Q12792	350 aa		11.7	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	BNIP2	Q12982	314 aa		11.7	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	FLOT2	Q14254	428 aa		11.7	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	IHH	Q14623	411 aa		11.7	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	PTPRN	Q16849	979 aa		11.7	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF423	Q2M1K9	1284 aa		11.7	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	UGT3A2	Q3SY77	523 aa		11.7	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		11.7	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		11.7	□□□□□ -0.54
LETMD1-223	ENST00000550442	SNX20	Q7Z614	316 aa		11.7	□□□□□ -0.54

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