RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533557.5

BBS1-222, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 1,043 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-222	ENST00000533557	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	PLEKHS1	Q5SXH7	462 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	ERMARD	Q5T6L9	678 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	DNAJC24	Q6P3W2	148 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF547	Q8IVP9	402 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	11.92	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	MR1	Q95460	341 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	PPM1M	Q96MI6	270 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	MAP3K3	Q99759	626 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	MLPH	Q9BV36	600 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	OR2AG1	Q9H205	316 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	OSGEPL1	Q9H4B0	414 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	CHKB	Q9Y259	395 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	MED13L	Q71F56	2210 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	SEC16A	O15027	2179 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	CALB1	P05937	261 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	TCF4	P15884	667 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	SPINT3	P49223	89 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	ATP1A4	Q13733	1029 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	GPR19	Q15760	415 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	CAMK4	Q16566	473 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	CRTC3	Q6UUV7	619 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	ABRAXAS1	Q6UWZ7	409 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	ADGRG6	Q86SQ4	1221 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	CUZD1	Q86UP6	607 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	IQCK	Q8N0W5	287 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	SIDT2	Q8NBJ9	832 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	SEC14L1	Q92503	715 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	MOCOS	Q96EN8	888 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	FCRL4	Q96PJ5	515 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	CARD9	Q9H257	536 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	RMI1	Q9H9A7	625 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	PDE7B	Q9NP56	450 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	NT5M	Q9NPB1	228 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	FGF21	Q9NSA1	209 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	GPR83	Q9NYM4	423 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	TAS2R14	Q9NYV8	317 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	TRIM10	Q9UDY6	481 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	TCFL5	Q9UL49	500 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	DNAJC16	Q9Y2G8	782 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	CSAG2	Q9Y5P2	127 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	PIKFYVE	Q9Y2I7	2098 aa		11.9	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	E2F3	O00716	465 aa		11.9	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	CHUK	O15111	745 aa		11.9	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	LCA5L	O95447	670 aa		11.9	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	SLC2A4	P14672	509 aa		11.9	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF30	P17039	623 aa		11.9	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	IL1R2	P27930	398 aa		11.9	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	MIP	P30301	263 aa		11.9	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	HSPA9	P38646	679 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	MMP13	P45452	471 aa		11.9	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	HCAR3	P49019	387 aa		11.9	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	DSC2	Q02487	901 aa		11.9	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	MAMLD1	Q13495	774 aa		11.9	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		11.9	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	PHYKPL	Q8IUZ5	450 aa		11.9	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	MCOLN2	Q8IZK6	566 aa		11.9	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	TEX26	Q8N6G2	289 aa		11.9	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	GPR150	Q8NGU9	434 aa		11.9	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF501	Q96CX3	271 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		11.9	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF514	Q96K75	400 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	RAB33B	Q9H082	229 aa		11.9	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	FAM83D	Q9H4H8	585 aa		11.9	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	TMPRSS11E	Q9UL52	423 aa		11.9	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	B3GNT3	Q9Y2A9	372 aa		11.9	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	PKDREJ	Q9NTG1	2253 aa		11.9	□□□□□ -0.5
BBS1-222	ENST00000533557	TACC2	O95359	2948 aa		11.89	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		11.89	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	ATMIN	O43313	823 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	MTX2	O75431	263 aa		11.89	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	SCRG1	O75711	98 aa		11.89	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	PYGL	P06737	847 aa		11.89	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF7	P17097	686 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	RORA	P35398	523 aa		11.89	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	VAV2	P52735	878 aa		11.89	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		11.89	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	ABR	Q12979	859 aa		11.89	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	KRTAP21-3	Q3LHN1	58 aa		11.89	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	FAM198B	Q6UWH4	519 aa		11.89	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		11.89	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	KCNMB4	Q86W47	210 aa		11.89	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	TRIM48	Q8IWZ4	208 aa		11.89	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	D2HGDH	Q8N465	521 aa		11.89	□□□□□ -0.51

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