RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531490.1

TRIM53CP-201, Transcript of tripartite motif containing 53C, pseudogene, humanhuman

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Gene TRIM53CP, Length 1,354 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM53CP-201ENST00000531490 DONSONQ9NYP3 566 aa7.01□□□□□ -1.29
TRIM53CP-201ENST00000531490 ANKMY1Q9P2S6 941 aa7.01□□□□□ -1.29
TRIM53CP-201ENST00000531490 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
TRIM53CP-201ENST00000531490 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa7.01□□□□□ -1.29
TRIM53CP-201ENST00000531490 CENPEQ02224 2701 aa7.01□□□□□ -1.29
TRIM53CP-201ENST00000531490 ABCA12Q86UK0 2595 aa7.01□□□□□ -1.29
TRIM53CP-201ENST00000531490 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
TRIM53CP-201ENST00000531490 A0A0U1RQS6 177 aa7□□□□□ -1.29
TRIM53CP-201ENST00000531490 A8MX80 341 aa7□□□□□ -1.29
TRIM53CP-201ENST00000531490 CDRT15L2A8MXV6 281 aa7□□□□□ -1.29
TRIM53CP-201ENST00000531490 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa7□□□□□ -1.29
TRIM53CP-201ENST00000531490 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
TRIM53CP-201ENST00000531490 SUV39H1O43463 412 aa7□□□□□ -1.29
TRIM53CP-201ENST00000531490 NOBOXO60393 691 aa7□□□□□ -1.29
TRIM53CP-201ENST00000531490 IGSF6O95976 241 aa7□□□□□ -1.29
TRIM53CP-201ENST00000531490 NME1P15531 152 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
TRIM53CP-201ENST00000531490 CR2P20023 1033 aa7□□□□□ -1.29
TRIM53CP-201ENST00000531490 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
TRIM53CP-201ENST00000531490 GARSP41250 739 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
TRIM53CP-201ENST00000531490 CSNK1DP48730 415 aa7□□□□□ -1.29
TRIM53CP-201ENST00000531490 MARCKSL1P49006 195 aa7□□□□□ -1.29
TRIM53CP-201ENST00000531490 HADHBP55084 474 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
TRIM53CP-201ENST00000531490 CYP4F2P78329 520 aa7□□□□□ -1.29
TRIM53CP-201ENST00000531490 RAD51Q06609 339 aa7□□□□□ -1.29
TRIM53CP-201ENST00000531490 GALNT2Q10471 571 aa7□□□□□ -1.29
TRIM53CP-201ENST00000531490 SPA17Q15506 151 aa7□□□□□ -1.29
TRIM53CP-201ENST00000531490 UGP2Q16851 508 aa7□□□□□ -1.29
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TRIM53CP-201ENST00000531490 ATG14Q6ZNE5 492 aa7□□□□□ -1.29
TRIM53CP-201ENST00000531490 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
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TRIM53CP-201ENST00000531490 KRT35Q92764 455 aa7□□□□□ -1.29
TRIM53CP-201ENST00000531490 PPP1R16AQ96I34 528 aa7□□□□□ -1.29
TRIM53CP-201ENST00000531490 SMIM14Q96QK8 99 aa7□□□□□ -1.29
TRIM53CP-201ENST00000531490 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
TRIM53CP-201ENST00000531490 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
TRIM53CP-201ENST00000531490 ZNF670Q9BS34 389 aa7□□□□□ -1.29
TRIM53CP-201ENST00000531490 DESI2Q9BSY9 194 aa7□□□□□ -1.29
TRIM53CP-201ENST00000531490 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
TRIM53CP-201ENST00000531490 NOD2Q9HC29 1040 aa7□□□□□ -1.29
TRIM53CP-201ENST00000531490 DNAJC28Q9NX36 388 aa7□□□□□ -1.29
TRIM53CP-201ENST00000531490 DTLQ9NZJ0 730 aa7□□□□□ -1.29
TRIM53CP-201ENST00000531490 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
TRIM53CP-201ENST00000531490 TRIM10Q9UDY6 481 aa7□□□□□ -1.29
TRIM53CP-201ENST00000531490 COQ6Q9Y2Z9 468 aa7□□□□□ -1.29
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TRIM53CP-201ENST00000531490 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
TRIM53CP-201ENST00000531490 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa6.99□□□□□ -1.29
TRIM53CP-201ENST00000531490 NEMP1O14524 444 aa6.99□□□□□ -1.29
TRIM53CP-201ENST00000531490 SCAMP1O15126 338 aa6.99□□□□□ -1.29
TRIM53CP-201ENST00000531490 MATN3O15232 486 aa6.99□□□□□ -1.29
TRIM53CP-201ENST00000531490 TSPAN6O43657 245 aa6.99□□□□□ -1.29
TRIM53CP-201ENST00000531490 AP1G1O43747 822 aa6.99□□□□□ -1.29
TRIM53CP-201ENST00000531490 SPOPO43791 374 aa6.99□□□□□ -1.29
TRIM53CP-201ENST00000531490 JCHAINP01591 159 aa6.99□□□□□ -1.29
TRIM53CP-201ENST00000531490 PDHA1P08559 390 aa6.99□□□□□ -1.29
TRIM53CP-201ENST00000531490 HGFP14210 728 aa6.99□□□□□ -1.29
TRIM53CP-201ENST00000531490 WT1P19544 449 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
TRIM53CP-201ENST00000531490 CCNCP24863 283 aa6.99□□□□□ -1.29
TRIM53CP-201ENST00000531490 CDKN2BP42772 138 aa6.99□□□□□ -1.29
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TRIM53CP-201ENST00000531490 PDX1P52945 283 aa6.99□□□□□ -1.29
TRIM53CP-201ENST00000531490 DYNLT1P63172 113 aa6.99□□□□□ -1.29
TRIM53CP-201ENST00000531490 RPS21P63220 83 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
TRIM53CP-201ENST00000531490 RNF4P78317 190 aa6.99□□□□□ -1.29
TRIM53CP-201ENST00000531490 TLE1Q04724 770 aa6.99□□□□□ -1.29
TRIM53CP-201ENST00000531490 EGR3Q06889 387 aa6.99□□□□□ -1.29
TRIM53CP-201ENST00000531490 NIPAL4Q0D2K0 466 aa6.99□□□□□ -1.29
TRIM53CP-201ENST00000531490 CCDC15Q0P6D6 951 aa6.99□□□□□ -1.29
TRIM53CP-201ENST00000531490 OVGP1Q12889 678 aa6.99□□□□□ -1.29
TRIM53CP-201ENST00000531490 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
TRIM53CP-201ENST00000531490 IGFBP7Q16270 282 aa6.99□□□□□ -1.29
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TRIM53CP-201ENST00000531490 TAZQ16635 292 aa6.99□□□□□ -1.29
TRIM53CP-201ENST00000531490 DEFB133Q30KQ1 61 aa6.99□□□□□ -1.29
TRIM53CP-201ENST00000531490 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
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TRIM53CP-201ENST00000531490 MARC1Q5VT66 337 aa6.99□□□□□ -1.29
TRIM53CP-201ENST00000531490 LRRC38Q5VT99 294 aa6.99□□□□□ -1.29
TRIM53CP-201ENST00000531490 KAZNQ674X7 775 aa6.99□□□□□ -1.29
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TRIM53CP-201ENST00000531490 ZNF599Q96NL3 588 aa6.99□□□□□ -1.29
TRIM53CP-201ENST00000531490 TSGA13Q96PP4 275 aa6.99□□□□□ -1.29
TRIM53CP-201ENST00000531490 HERPUD2Q9BSE4 406 aa6.99□□□□□ -1.29
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