RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516879.1

RNU6-579P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 579, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-579P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-579P-201ENST00000516879 FOXO6A8MYZ6 492 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 TCP11X1B4DZS4 312 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 C2CD4DB7Z1M9 353 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 E5RI56 91 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 RFXAPO00287 272 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 MATN2O00339 956 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 TNFRSF10CO14798 259 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 HDAC3O15379 428 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 SPINT1O43278 529 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 LATO43561 262 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 VPS4BO75351 444 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 SPAG7O75391 227 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 KATNA1O75449 491 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 TM7SF2O76062 418 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 RHOBTB1O94844 696 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 FKBP9O95302 570 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 PIGNO95427 931 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 MATN4O95460 622 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 EPHX1P07099 455 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 VIMP08670 466 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 RPS17P08708 135 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 SBK3P0C264 359 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 CCDC166P0CW27 439 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 MTHFD2P13995 350 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 ACPPP15309 386 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 GM2AP17900 193 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 XPAP23025 273 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 KELP23276 732 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 SP100P23497 879 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 TARSP26639 723 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 AOAHP28039 575 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 PRDX6P30041 224 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 DRD3P35462 400 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 HSD17B2P37059 387 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 P2RY2P41231 377 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 ABL2P42684 1182 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 IL12RB1P42701 662 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 RPS9P46781 194 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 SLC6A11P48066 632 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 SLC1A6P48664 564 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 LIG3P49916 1009 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 ATP4BP51164 291 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 GALK1P51570 392 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 CCR5P51681 352 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 MNAT1P51948 309 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 DGKEP52429 567 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 SEC24CP53992 1094 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 PNLIPRP1P54315 467 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 GYS2P54840 703 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 CDKN2DP55273 166 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 STARD6P59095 220 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 RPS14P62263 151 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 HERVK_113P63132 956 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 TMPRSS15P98073 1019 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 MPP1Q00013 466 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 DMTNQ08495 405 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 OVGP1Q12889 678 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 LCP2Q13094 533 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 MTM1Q13496 603 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 BMPR2Q13873 1038 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 SEMA3AQ14563 771 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 ARHGAP19Q14CB8 494 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 KRT72Q14CN4 511 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 SETDB1Q15047 1291 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 TGFBIQ15582 683 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 CHRNA6Q15825 494 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 PPP1R3AQ16821 1122 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 GALNTL6Q49A17 601 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 GGTA1PQ4G0N0 100 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 ZNF789Q5FWF6 425 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 CTSL3PQ5NE16 218 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 AGBL4Q5VU57 503 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 TRIM68Q6AZZ1 485 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 SULT1C3Q6IMI6 304 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 FBXL19Q6PCT2 694 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 UNC5DQ6UXZ4 953 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 WASH2PQ6VEQ5 465 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 FRMD7Q6ZUT3 714 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 SYT13Q7L8C5 426 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 OTOAQ7RTW8 1153 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 CMC1Q7Z7K0 106 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 TTC7BQ86TV6 843 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 CHPFQ8IZ52 775 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 FAM9CQ8IZT9 166 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 MYO1HQ8N1T3 1032 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-579P-201ENST00000516879 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms