RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa27.4■■□□□ 1.98
HOXB3-211ENST00000490677 GPR39O43194 453 aa27.4■■□□□ 1.98
HOXB3-211ENST00000490677 VEGFDO43915 354 aa27.4■■□□□ 1.98
HOXB3-211ENST00000490677 APOC2P02655 101 aa27.4■■□□□ 1.98
HOXB3-211ENST00000490677 SLC2A4P14672 509 aa27.4■■□□□ 1.98
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
HOXB3-211ENST00000490677 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
HOXB3-211ENST00000490677 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
HOXB3-211ENST00000490677 XRCC4Q13426 336 aa27.4■■□□□ 1.98
HOXB3-211ENST00000490677 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa27.4■■□□□ 1.98
HOXB3-211ENST00000490677 LINC00303Q3SY05 128 aa27.4■■□□□ 1.98
HOXB3-211ENST00000490677 TMEM164Q5U3C3 297 aa27.4■■□□□ 1.98
HOXB3-211ENST00000490677 DAAM2Q86T65 1068 aa27.4■■□□□ 1.98
HOXB3-211ENST00000490677 LRRTM4Q86VH4 590 aa27.4■■□□□ 1.98
HOXB3-211ENST00000490677 SLC25A41Q8N5S1 370 aa27.4■■□□□ 1.98
HOXB3-211ENST00000490677 NKD1Q969G9 470 aa27.4■■□□□ 1.98
HOXB3-211ENST00000490677 SH3KBP1Q96B97 665 aa27.4■■□□□ 1.98
HOXB3-211ENST00000490677 SGF29Q96ES7 293 aa27.4■■□□□ 1.98
HOXB3-211ENST00000490677 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
HOXB3-211ENST00000490677 SPRY4Q9C004 299 aa27.4■■□□□ 1.98
HOXB3-211ENST00000490677 UCK1Q9HA47 277 aa27.4■■□□□ 1.98
HOXB3-211ENST00000490677 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa27.4■■□□□ 1.98
HOXB3-211ENST00000490677 TENM4Q6N022 2769 aa27.39■■□□□ 1.98
HOXB3-211ENST00000490677 KMOO15229 486 aa27.39■■□□□ 1.98
HOXB3-211ENST00000490677 RBL1P28749 1068 aa27.39■■□□□ 1.98
HOXB3-211ENST00000490677 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP27.39■■□□□ 1.98
HOXB3-211ENST00000490677 SLC19A1P41440 591 aa27.39■■□□□ 1.98
HOXB3-211ENST00000490677 MPP3Q13368 585 aa27.39■■□□□ 1.98
HOXB3-211ENST00000490677 MANEAQ5SRI9 462 aa27.39■■□□□ 1.98
HOXB3-211ENST00000490677 RAD9BQ6WBX8 426 aa27.39■■□□□ 1.98
HOXB3-211ENST00000490677 IPMKQ8NFU5 416 aa27.39■■□□□ 1.98
HOXB3-211ENST00000490677 LACRTQ9GZZ8 138 aa27.39■■□□□ 1.98
HOXB3-211ENST00000490677 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa27.39■■□□□ 1.98
HOXB3-211ENST00000490677 TRHDEQ9UKU6 1024 aa27.39■■□□□ 1.98
HOXB3-211ENST00000490677 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP27.39■■□□□ 1.98
HOXB3-211ENST00000490677 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.97
HOXB3-211ENST00000490677 EFCAB7A8K855 629 aa27.38■■□□□ 1.97
HOXB3-211ENST00000490677 STMND1H3BQB6 276 aa27.38■■□□□ 1.97
HOXB3-211ENST00000490677 CDK14O94921 469 aa27.38■■□□□ 1.97
HOXB3-211ENST00000490677 HLA-DPA1P20036 260 aa27.38■■□□□ 1.97
HOXB3-211ENST00000490677 COPS2P61201 443 aa27.38■■□□□ 1.97
HOXB3-211ENST00000490677 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
HOXB3-211ENST00000490677 INSCQ1MX18 579 aa27.38■■□□□ 1.97
HOXB3-211ENST00000490677 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa27.38■■□□□ 1.97
HOXB3-211ENST00000490677 NCSTNQ92542 709 aa27.38■■□□□ 1.97
HOXB3-211ENST00000490677 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
HOXB3-211ENST00000490677 EFR3BQ9Y2G0 817 aa27.38■■□□□ 1.97
HOXB3-211ENST00000490677 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa27.38■■□□□ 1.97
HOXB3-211ENST00000490677 A8MU76 341 aa27.37■■□□□ 1.97
HOXB3-211ENST00000490677 BTNL10A8MVZ5 291 aa27.37■■□□□ 1.97
HOXB3-211ENST00000490677 PTPN7P35236 360 aa27.37■■□□□ 1.97
HOXB3-211ENST00000490677 UGT1A3P35503 534 aa27.37■■□□□ 1.97
HOXB3-211ENST00000490677 CHRNA6Q15825 494 aa27.37■■□□□ 1.97
HOXB3-211ENST00000490677 ANKS6Q68DC2 871 aa27.37■■□□□ 1.97
HOXB3-211ENST00000490677 WASH2PQ6VEQ5 465 aa27.37■■□□□ 1.97
HOXB3-211ENST00000490677 EXD3Q8N9H8 876 aa27.37■■□□□ 1.97
HOXB3-211ENST00000490677 ACTL9Q8TC94 416 aa27.37■■□□□ 1.97
HOXB3-211ENST00000490677 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
HOXB3-211ENST00000490677 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
HOXB3-211ENST00000490677 GBA3Q9H227 469 aa27.37■■□□□ 1.97
HOXB3-211ENST00000490677 WASH6PQ9NQA3 447 aa27.37■■□□□ 1.97
HOXB3-211ENST00000490677 WDR70Q9NW82 654 aa27.37■■□□□ 1.97
HOXB3-211ENST00000490677 SLC39A1Q9NY26 324 aa27.37■■□□□ 1.97
HOXB3-211ENST00000490677 HACD3Q9P035 362 aa27.37■■□□□ 1.97
HOXB3-211ENST00000490677 RSPH14Q9UHP6 348 aa27.37■■□□□ 1.97
HOXB3-211ENST00000490677 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa27.37■■□□□ 1.97
HOXB3-211ENST00000490677 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
HOXB3-211ENST00000490677 PJA2O43164 708 aa27.36■■□□□ 1.97
HOXB3-211ENST00000490677 BUD23O43709 281 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
HOXB3-211ENST00000490677 PLA2G2AP14555 144 aa27.36■■□□□ 1.97
HOXB3-211ENST00000490677 CTNNA2P26232 953 aa27.36■■□□□ 1.97
HOXB3-211ENST00000490677 ADRA1AP35348 466 aa27.36■■□□□ 1.97
HOXB3-211ENST00000490677 MC2RQ01718 297 aa27.36■■□□□ 1.97
HOXB3-211ENST00000490677 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
HOXB3-211ENST00000490677 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
HOXB3-211ENST00000490677 PTPRCAPQ14761 206 aa27.36■■□□□ 1.97
HOXB3-211ENST00000490677 SNAP47Q5SQN1 464 aa27.36■■□□□ 1.97
HOXB3-211ENST00000490677 AGAP9Q5VTM2 703 aa27.36■■□□□ 1.97
HOXB3-211ENST00000490677 TMEM26Q6ZUK4 368 aa27.36■■□□□ 1.97
HOXB3-211ENST00000490677 FAM129CQ86XR2 697 aa27.36■■□□□ 1.97
HOXB3-211ENST00000490677 TMTC1Q8IUR5 882 aa27.36■■□□□ 1.97
HOXB3-211ENST00000490677 LRRC57Q8N9N7 239 aa27.36■■□□□ 1.97
HOXB3-211ENST00000490677 AVL9Q8NBF6 648 aa27.36■■□□□ 1.97
HOXB3-211ENST00000490677 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa27.36■■□□□ 1.97
HOXB3-211ENST00000490677 ALG3Q92685 438 aa27.36■■□□□ 1.97
HOXB3-211ENST00000490677 MED8Q96G25 268 aa27.36■■□□□ 1.97
HOXB3-211ENST00000490677 EPB41L1Q9H4G0 881 aa27.36■■□□□ 1.97
HOXB3-211ENST00000490677 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa27.36■■□□□ 1.97
HOXB3-211ENST00000490677 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa27.36■■□□□ 1.97
HOXB3-211ENST00000490677 UGT1A9O60656 530 aa27.35■■□□□ 1.97
HOXB3-211ENST00000490677 AGTP01019 485 aa27.35■■□□□ 1.97
HOXB3-211ENST00000490677 C9P02748 559 aa27.35■■□□□ 1.97
HOXB3-211ENST00000490677 UGT1A6P19224 532 aa27.35■■□□□ 1.97
HOXB3-211ENST00000490677 UGT1A1P22309 533 aa27.35■■□□□ 1.97
HOXB3-211ENST00000490677 UGT1A4P22310 534 aa27.35■■□□□ 1.97
HOXB3-211ENST00000490677 SPAM1P38567 509 aa27.35■■□□□ 1.97
HOXB3-211ENST00000490677 CTSCP53634 463 aa27.35■■□□□ 1.97
HOXB3-211ENST00000490677 GFERP55789 205 aa27.35■■□□□ 1.97
HOXB3-211ENST00000490677 AADACL2Q6P093 401 aa27.35■■□□□ 1.97
HOXB3-211ENST00000490677 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms